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Nature Communications:宏基因组和代谢组等多组学揭示了纤维缺乏的饮食扰乱了小鼠结肠微生物组空间结构导读。4 饮食影响结肠微生物群的空间结构使用上述LCM方法,接下来评估饮食是否影响结肠微生物群的空间结构。这些结果强化了膳食纤维对结肠微生物群落多样性和功能的重要性,但也强调了膳食纤维是微生物群落划分的关键驱动力,这可能对局部...
Nature:?肠道微生物通过代谢调节人体肠道免疫宏基因组学的发展方兴未艾,被称为“人类基因组计划2.0”的人类肠道微生物基因组计划让我们真正认清了“自己”——一个由人类和共生菌群组成的多元复合体。肠道细菌产生的BA衍生物的种类和数量各不相同,本论文的研究者证实了许多肠道胆汁酸衍生物都能通过胆汁酸受体-维生素D受体通路调节RORγ+Tre...
Cell:肠道菌对轮状病毒感染的防治导读。10月10日,《Cell》刊发了题为《Segmented Filamentous Bacteria Prevent and Cure Rotavirus Infection(分段丝状细菌对轮状病毒感染的预防和治疗)》的新研究,指明一种叫做分段丝状细菌的肠道菌在轮状病毒感染中扮演着重要角色,并解释了轮状病毒在某些人群中引发严重致死性疾病的分子机制,或有助于...
本文通过研究四种不同水平无机氮施肥条件下小麦根和根际的细菌和真菌群落在分蘖期、拔节期和成熟期的组成、变化及根系释放有机碳(ROC),根系分泌的有机酸以及根际的土壤有机碳(SOC)和土壤活性碳(SAC),确定了氮输入的增加、碳有效性改变和植物根和根际微生物群落变化之间的关系。根际(d)和根(f)样品的相异距离。由于只调查了根际和根样品,土壤...
COM:养分平衡在塑造植物根-真菌互作中的作用:事实与猜想营养平衡在塑造植物根-真菌互作中的作用:事实和推测。营养状况的不平衡会影响植物生理以及植物与有益土壤真菌的相互作用;由植物PSR驱动的根真菌群落的转变是否是以下因素的结果依然有待研究:(1) 宿主对促进植物生长的真菌有益/互惠关联的适应策略 [54··],(2) 根定殖者之...
MP综述:植物-微生物互作的系统生物学植物-微生物互作的系统生物学。关键字:植物系统生物学,植物微生物,微生物组,合成群落,微生物-宿主交互作用。植物微生物组。植物,植物器官及根源土壤的微生物组分析展现了一个多样性的高度动态变化的植物微生物组。虽然植物和它们的微生物组之间有明显的互利关系,而且“呼救”可以招募微生物来支持宿...
粪便标本的采集方法粪便标本的采取直接影响结果的准确性,通常采用自然排出的粪便,标本采集时注意事项如下:7.找寄生虫虫体及作虫卵计数时应采集网收集 整理24小时粪便,前者应从全部粪便中仔细搜查或过筛,然后鉴别其种属;9.做粪胆原定量时,应连续收集3天的粪便,每天将粪便渴匀秤重后取出允20克送检。11.无粪便排出而又必须检查时,可...
在几年前,我们刚刚进入到肠道菌群研究领域的时候,我们就想,先给自己设定一个小目标吧——能不能在一个复杂的肠道菌群样品中,先把革兰氏阳性菌、革兰氏阴性菌用荧光成像的办法区分开来。我们了解到这个问题以后,我们就想能不能利用抗生素分子对细菌结合的特异性,在不破坏抗生素与细菌结合的这种特异性的同时,把抗生素分子改造成一种荧光...
通过对粪便进行16S宏基因组学测序发现,如图2A所示,FMT前PSC患者的多样性与捐献者baseline具有显著性差异(P = 0.0058),FMT一周后PSC患者的多样性与捐献者接近而不具有显著性差异(P = 0.053)。control OTUs 是指捐献者粪便中没有但PSC患者粪便中有且在粪菌移植后增加的菌,rare engrafters 是指在少于50%PSC患者中经FMT移植定植的菌群,fr...
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