R语言之常用函数

R语言之常用函数

对一般数据进行运算的常用函数：

数学函数：

1、round() #四舍五入
例：x <- c(3.1416, 15.377, 269.7)
round(x, 0) #保留整数位
round(x, 2) #保留两位小数
round(x, -1) #保留到十位
 
2、signif() #取有效数字(跟学过的有效数字不是一个意思)
例：略
 
3、trunc() #取整
   floor() #向下取整
   ceiling() #向上取整
例：xx <- c(3.60, 12.47, -3.60, -12.47)
trunc(xx)
floor(xx)
ceiling(xx)
 
4、logb(a, b) #以b为底的对数，省略b表示自然对数
   log() #自然对数
   log10() #以10为底的常用对数
例：logb(8, 2)
log(8); logb(8)
log10(100); logb(100, 10)
 
5、sqrt() #平方根
   exp() #指数
 
6、sin() #正弦
   cos() #余弦
   tan() #正切
   asin() #反正弦
   acos() #反余弦
   atan() #反正切
   sinh() #双曲正弦
   tanh() #双曲正切
 
7、nchar() #字符长度
例：xx <- 'China is a great country'
nchar(xx)
 
8、substring() #取子字符串
例：substring(xx, 1, 5)
 
9、paste() #连接字符
语法是：paste(..., sep = " ", collapse = NULL)
例1：x <- 'I'; y <- 'am'; z <- 'a'; d <- 'student'
paste(x, y, z, d)
例2：paste(c('x', 'y'), 1:4, sep = '')
例3：paste('x', 1:4, sep = '', collapse = '+')
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

10、计算
+, -, *, /, ^, %%, %/%：四则运算ceiling，floor，round，signif，trunc，zapsmall：舍入max，min，pmax，pmin：最大 最小值 range：最大值和最小值sum，prod：向量元素和，积cumsum，cumprod，cummax，cummin：累加、累乘sort：排序 approx和approx fun：插值diff：差分sign：符号函数

------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
11、自己写函数程序流程
一、控制结构
if，else，ifelse，switch：分支for，while，repeat，break，next：循环apply，lapply，sapply，tapply，sweep：替代循环的函数。
二、函数
function：函数定义 source：调用文件 call：函数调用.C，.Fortran：调用C或者Fortran子程序的动态链接库。Recall：递归调用 browser，debug，trace，traceback：程序调试options：指定系统参数 missing：判断虚参是否有对应实参nargs：参数个数 stop：终止函数执行on.exit：指定退出时执行 eval，expression：表达式计算system.time：表达式计算计时 invisible：使变量不显示menu：选择菜单（字符列表菜单）
其它与函数有关的还有：delay，delete.response，deparse，do.call，dput，environment ，，formals，format.info，interactive，is.finite，is.function，is.language，is.recursive ，match.arg，match.call，match.fun，model.extract，name，parse，substitute，sys.parent ，warning，machine。
三、输入输出
cat，print：显示对象
sink：输出转向到指定文件
dump，save，dput，write：输出对象
scan，read.table，load，dget：读入
四、工作环境
ls，objects：显示对象列表
rm, remove：删除对象
q，quit：退出系统
.First，.Last：初始运行函数与退出运行函数
options：系统选项
 ，help，help.start，apropos：帮助功能
data：列出数据集

-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
12、统计计算函数
一、统计分布
每一种分布有四个函数：d――density（密度函数），p――分布函数，q――分位数 函数，r――随机数函数。比如，正态分布的这四个函数为dnorm，pnorm，qnorm，rnorm。各分布后缀，前面加前缀d、p、q或r就构成函数名：
norm：正态
t：t分布
f：F分布
chisq：卡方（包括非中心）
unif：均匀
exp：指数
weibull：威布尔
gamma：伽 玛
beta：贝塔
lnorm：对数正态
logis：逻辑分布
cauchy：柯西
binom：二项分布
geom：几何分布
hyper：超几 何
nbinom：负二项
pois：泊松
signrank：符号秩
wilcox：秩和
tukey：学生化极差
二、简单统计量
sum, mean, var, sd, min, max, range, median, IQR（四分位间距）等为统计 量
sort，order，rank与排序有关
其它还有ave，fivenum，mad，quantile，stem等。
三、统计检验
R中已实现的有chisq.test，prop.test，t.test。
四、多元分析
cor，cov.wt，var：协方差阵及相关阵计算
biplot，biplot.princomp：多元数据biplot图
cancor：典则相关
princomp：主成分分析
hclust：谱系聚类：
kmeans：k-均值聚类
cmdscale：经典多维标度
其它有dist，mahalanobis，cov.rob。
五、时间序列
ts：时间序列对象 diff：计算差分 time：时间序列的采样时间 window：时间窗
六、统计模型
lm，glm，aov：线性模型、广义线性模型、方差分析

--------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
13、其他
（1）rm(list = ls())
#清空控制台所有向量
（2）setwd("D:/ziliao/zhuanye/R bear/R code")
#设置工作目录
（3）library(Biostrings)
#调用程序包
（4）aa <- AAString("LANDEECQW")
#将一个字符向量转化成氨基酸序列aa
（5）typeof(aa)
#查看aa类型
[1] "S4"
#aa为S4方法类型
（6）write(aa,"chuana.txt")
#尝试将aa输出到文件chuana.txt中
（7）aa=as.character(aa)
#将aa转化为字符向量
（8）write(aa,"chuana.txt")
#再次输出
------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------

奇葩函数
看别人的代码会遇到一些奇葩的函数，一般的教程上很少提到，但却有很好的用处，这类函数基本上分布在base以及utils包中，下面将它们略为归纳一下，以备后用。

1 文件执行：
在用R生成一个PDF文档后，如果想去打开它，你可能会在文件夹里找到再点开。再或者我们想调用系统中的其它程序来做点事情，可能要打开cmd敲点命令。实际上这都可以在R内部完成。举例来说用pandoc转换na.md成docx再打开它。
 
system('pandoc d:\\rspace\\na.md -o d:\\rspace\\na.docx')
shell.exec('d:\\rspace\\na.docx')
 

2 网络浏览：
browseURL：浏览某个指定的网页
download.file：下载网络文件到本地

3 文件操作
dir.create：新建一个文件夹
list.dirs：显示目录下的文件夹
list.files：显示目录下的文档
file.create：文档创建
file.exists：判断文档是否存在
file.remove：文档删除
file.rename：重命名
file.append：文档添加
file.copy：文档复制
file.symlink(from, to)
file.show：显示文档内容
file.info：显示文档信息
file.edit：编辑文档
zip： 压缩文件
unzip： 解压缩文件

4 运算进度条
在一个大循环运算时，如果可以看到目前的进度是比较方便的，txtProgressBar和setTxtProgressBar函数可以帮助做到这一点，下面是内置的一个小例子