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什么是中医系统医学？中医是在生命的现象中看生命的本质，又从生命的本质中发现了十一个不等的“本能系统”中医是围绕着十一个不等的本能系统做文章的医学。中医是怎样认识生命的？最早的中医典籍《黄帝内经》展示了人与大自然的关系，用顺应自然的方法研究生命，理解生命。生命只有在宇宙中顺应大自然，才有生命小自然的生存，这也是先人对生命宏观的认识，对生命有了宏观的认识，就掌握了生存与防病治病的大规矩。
中医对生命的认识，对生命的思索，对生命的研究，总是蕴涵在临床行为过程之中。中医没有一部单行的生命科学专著。这并无损于中医在生命科学领域上的伟大成就。中医要有超现代的临床疗效，必然会有一套相应的科学理论。中医传统的理论，既丰富有复杂，既难懂又说不出一个标准。学医的人一旦绕进去，就出不来，很多人在这种理论中迷糊了一辈子，困惑了大半生，耗费了无数的精力，也没有做出什么突破，形成了十个中医看一个病，很可能有十个不同的方案，决不会有两个相同的方案。只凭这一点就难以被现代人认可。但它确实有超现代的疗效。这种情况不是中医学的错，而是我们的错。我们至今没有把中医的“核心思维，科学内涵”诠释出来，这也不是无缘无故的，但真理是封锁不住的。虽然大道无形，但现代人的智慧一定能解开祖先留下来的密码。
中医对生命的发生，在两千五百年前已认识到“阴阳合德”对生命的本质已认识到“阴阳互根”。对生命的终结认为是“阴阳离决”。这个认识早了西方两千五百年以上。
一千八百年前的《伤寒杂病论》是在“天人合一”观念与“顺应自然法则”思想指导下用于临床，使中医在发展道路上发生了突飞。张仲景是中医生命科学的奠基者，是医圣揭示了“生命本能”。《伤寒论》三阴三阳的六个系统中，解读了伤寒病的全过程。张仲景对病的理解，从认识到治疗都是以“生命本能”为生存依据的。一个生命发生了，这个生命必然同时有生存的本能。为什么叫它本能？因为这种生存能力是与生命同时具有的，是大自然赋予的。生命在漫长的运动过程中，在大自然中生活，在与自然万物共同生存。也就是说人与宇宙万物有相互依赖、相互制约、相互变化的繁杂关系，时刻不能相离。
人在大自然中受到风雨寒暑气候变化的伤害，与外界有毒有害物质对人体的侵害，从饮食呼吸中进入体内的致病物的损害，以及人自己七情六欲造成的功能性障碍；也就是人在宇宙万物之中，所受到的外源性与内源性的伤害，都是对生命的威胁。人如何抵御这些伤害保护自己呢？如果人没有保护自己的能力，生命是不可能存在的。然而神奇的大自然造就了生命的神奇，与人生命俱来的“阴阳互根”
之中带来了诸多本能，诸多的生命本能形成系统就是中医的系统医学。
到目前为止我们诠释了十一个生命本能系统：我们先从应变本能系统说起。孕妇分娩，胎儿从母腹中来到世界为什么先是哭声？不哭的胎儿有没有活下来的？人人皆知，婴儿落地时的哭声是一个“应变性本能”的反应。腹儿在母腹中是一个没有寒热、没有饥渴、没有任何不舒服的环境，一旦离开母腹来到一个新环境，立刻便有很多的刺激，首先是寒冷和衣被枕席的不适。哭声是婴儿对新环境不适应的呼叫。胎儿都有应变性本能。当婴儿调整了自己，适应了新环境，便开始了新生活，新生活会遇到很多不适应，“应变性本能”也会不断地改变着自己以适应新环境。我们从婴儿落地的哭声中可以知道婴儿的健康状况，如果哭声洪亮而暂短，表明胎儿身体强壮，“应变性本能系统”很灵敏，应变能力很快；一个生存本能的强盛，是生命保护系统的强大，表明这个发育很好，不易生病，生病也容易治愈。如果胎儿哭声低微，哭声长时不断，表明这个胎儿体弱，“应变性本能”较弱，长时间不能改变自己而适应环境。这是我们在婴儿身上对应变本能的一个认识。应变性本能对人的健康意义很重要在防疫、妊娠反应等等方面有深远意义。
自主调节本能系统，我们也以婴儿为例来说明。有的，我们还能看到婴儿假死的现象。婴儿生下来没有呼吸、没有脉搏，心肺停止了自主性运动，助产医生轻轻拍打婴儿后背，婴儿又开始了呼吸与心搏，恢复了自主性运动。从这个现象，我们知道了些什么呢？自主性运动一旦发生障碍，我们只能顺应自主性本能的趋势，顺其势而利导，以顺水推舟之势来助其自主运动。自主调节系统是生命本能中一个重要的系统。比如说，生命活动从自塑本能到自我修复本能、自我更新本能、自主排异本能、应变本能，这些系统活动是在一个大程序之中。这个大程序中各个系统与系统之间的活动，以及每个本能系统内部多器官、组织之间的活动上下、内外、左右、纵横、高低、消长、强弱进退中的升降出入的均势平衡，都是自主调节系统所主宰的。自主调节本能系统在临床上有非常重大的意义。人体生命过程中，一切器官、组织的功能障碍，程序紊乱，都会在自主调节本能的活动恢复常态。我们的体温调节：当气温、室温、只要是身处的环境温度超过我们体温时，调节系统便会排汗散热平衡体温。当身处环境温度过低时，我们的调节系统便会收缩皮肤保存体温，或肌组织颤抖制造提高身体温度以平衡体温。这是自主调节本能系统时时在活动着。
我们的肢体、思维活动是需要营养来维持的。比如：葡萄糖、氧以及其他物质，供给这些物质的是血循环。我们停止活动时，对这些营养物质的需要量少，供给相对降低，循环相应降低，心率降低；当我们剧烈活动时，运动员竞技时，我们的感情激动时，我们需要的营养物质量大大增多，循环量相应增强，心率提高，每分钟可达130-180次以上。这是自主调节对供血的调节。
我们在生活中常有饥饱劳逸。当我们饮食丰美而充足时我们会有较多的富营养食物摄入，我们除去活动消耗尚有大量的营养盈余，我们的调节系统会存储起来。这就是调节系统把大量葡萄糖变化成脂肪，贮存在脏器间与皮下脂肪库内。当我们摄入营养不足，又要大量活动、大量消耗时，调节系统又把贮存的脂肪游离出来变化为葡萄糖供给体能活动需要。这是调节系统对营养物质的调节。在这个营养调节系统应包括脂肪、葡萄糖、蛋白质，各种维生素，以及其它微量物质。这个本能调节系统调节着一切营养与活动消耗关系的均势平衡。这是非常重要的一个系统。如果这个系统发生了障碍，许多的生存问题都会发生。如生命物质合成利用发生了障碍，人体的“自我修复本能”降低，身体要发生溃疡不能愈合，伤损不能修复，许多疾病都会发生，而不能痊愈。如风湿、类风湿、红斑狼疮、硬皮病、过敏性疾病等等。营养物质的合成利用发生障碍，必然活动能力低下，精神萎靡，出现衰老、短寿；又可发生高脂血、高血压、冠心病、脑血管病、糖尿病、脂肪肝、肾小球硬化、前列腺肥大等等。只不过是举两个病例来说明“自主调节系统”中的一个代表性疾病，实际直接与间接发生的疾病会很多很多！
脂肪摄入太多而利用太少，势必把脂肪储存起来。久而久之，脂肪会大量进入血液，造成高浓度脂肪血。脂肪便会粘附在血管壁上，渗透入血管组织，血管腔变狭窄，特别是微循环发生障碍，血管组织通透性降低，细胞组织供血不足，细胞饥饿，长期得不到营养便会饿死！“生命本能系统”中的“共生性本能”使心脏提高供血能力，保障细胞的生存。于是心脏提高血压，以满足供血的需要。这是高血压发生的原因。血压是因为保障细胞不会饿死而升高，组织不会缺血性坏死。高血压本身是病吗？吃降压药是有好处的吗？每一个人都会明白！扩张血管降压是错误，把一个简单的病搞成终身病、终身服药是个历史的悲哀！
糖尿病与高血压病是营养物脂肪与葡萄糖的转化、利用发生障碍而致病。葡萄糖不能利用，大量葡萄糖进入血中。血中糖浓度超过标准便会从肾泌尿中排出。体内糖在紊乱的程序中又会变脂肪，因脂肪转化过程中进入血液又会造成高血压的机制，发生高血脂、高血压。由此，分泌功能疾病，代谢功能疾病，蛋白质降低又发生免疫功能疾病。一个循环系统中大血管病、周围血管病、微血管病，其并发性疾病蜂起。
这些病为什么都不能治愈？其实不是不能治愈，而是没有治愈的方法。生命是大自然赋予的，生命规律与自然规律一样是不可改造，不可对抗，不可取代的！要用顺其势而利导的方法，这些病都可治愈。
排异本能系统也以婴儿为例来引申。婴儿哺乳期，健康的婴儿，也就是生存本能强势的婴儿食欲好，而母乳又丰富时，婴儿常因吃乳太多而吐乳，这是婴儿的“排异性本能”把过量的食物排了出来，以免发生消化不良而产生疾病。如果婴儿过量吃乳而不能吐多余的食物，必然发生消化不良，而出现胃肠因宿食而胀满，痞结发热，体温常升高到40°以上，甚至出现抽搐，这会使母亲很害怕。
从这里我们知道：婴儿过量吃入母乳的呕吐，是婴儿自己保护自己的本能活动，不是疾病；出现这种情况，只需有节制地哺乳即可，不可止呕，以保护婴儿本能。如果婴儿腹胀痞满而发烧，千万不可用化学药退热，如用化学药退热，必不能治愈；不仅热不退，还会造成药源性疾病。如婴儿腹胀忽然发热又下痢，千万不可止泻又退热，必然是痢不能止而身热不退。如果用化学药，使其痢止、热退，必会导致不吃母乳而腹大胀满，后果严重，这是因为什么？婴儿过度吃乳后的呕吐，是排异性本能系统功能运动。食物在胃肠中不能消化而发酵胀气的下痢，是婴儿对异物的排除。身热是食物在胃肠中腐败后产生大量的热要通过循环从体表散热，这个是现象，胃肠中有腐败物是病的本质。吐和泻本来是婴儿的保护系统-生存本能活动。如果一见热便退热，一见呕吐便止呕，一见下痢便止泻，这样治的后果很糟糕。原因是这种捕风捉影的治法，并没有接触到病的实质，而实际是在镇压婴儿的排异本能。反而使婴儿自己保护自己的能力不能发挥出来。
婴儿无言，父母有大爱而苦不知医。人从一出生落地便在生存本能系统的保护之下。中医认识人体生存本能系统，并以顺势利导的大法延长人的寿命，治愈疾病，保护健康，是人类悟得天地之道的大智大慧。
人的疾病来自两个方面：一是外界致病物质的侵入引起排异本能系统的反应；
二是人体内部发生的功能性障碍。这两个方面是人致病的途径，也就是疾病的来源，一个是外源性疾病，一个是内源性疾病。
外源性疾病很多，一切致病微生物都是疾病的外源，这些外源性疾病都会引起排异系统的排异反应；不同的外界致病物，对人的伤害有不同的部位。本能系统发生的排异方式，趋势也因不同的致病物而有所不同，医生根据排异本能系统的排异方式与趋势的特点而顺势利导，排出异物，疾病则痊愈。
在此，举几个实例说明不同的致病物质，损害不同的组织，引起不同的排异趋势，因而用不同利导方法。
例1：流行性感冒病毒，引起的排异反应是：头疼、身疼、腰痛、骨节酸痛、发烧39°以上、恶寒颤抖、气喘、身体不出汗、脉浮。我们在这个排异趋势中，看到排异本能要从汗腺分泌中排除致病物，而汗腺发生了障碍，不分泌，汗不出。中医根据这一排异趋势，采用发汗法。
例2：感冒发热恶风，体温38°，头疼、鼻塞、时有汗时无汗，发热不解，脉浮，这例感冒，发热不高，有汗，热不退，排异反应要把有害物从汗腺分泌中排出；汗腺分泌虽然没障碍，但体液不足，也就是周围血管的供血不能满足排汗的需要，因而不能排汗。中医根据这个趋势，采用助津液发汗法。
例3：感冒身无大热，汗出而喘、咳、有痰、脉浮。这个病例的排异反应在肺，只靠汗腺分泌排异，不足以祛除病理物质，需要排汗、利尿、通肠三个通路排异，中医用麻杏石甘汤治疗。麻黄发汗有利小便，石膏既发汗又通肠，甘草缓和百药，这是一个顺势利导。
例4：感冒咽痛（急性咽炎或急性扁桃体炎），身热，无力，咽痛红肿，脉浮。体温不太高，无汗。用透表法，身似有汗而不是明显的汗液，只是微循环血管明显扩张，病毒从微血管中渗出。
例5：身有热，胸中痞硬，气上冲，咽喉不得息，或饮食入口则吐，心中愠愠欲吐又不能吐。这是病理物质在胃中，当用吐法，催吐方剂。
例6：头疼身热，不大便六七日，不恶寒反恶热，或不大便五六日，绕脐疼，心中烦躁。这是病理物在结肠中不能排除，因其排异趋势而采用通大便的下法。
例7：热结膀胱，其人如狂，少腹急结者，是膀胱蓄血排不出，排出既愈。用桃核承气汤排除膀胱蓄血，这是下淤血的排异法。
例8：感冒后，汗出，口渴，水入胃既吐，小便不利。对此，当利小便这是利尿排异法
例9：急性盲肠炎、阑尾炎，以大黄牡丹汤破血通便下法，把盲肠或阑尾的肿块排出既愈。这也是顺势利导排异法。
例10：急性乳腺炎：发热恶寒，乳房红肿热疼，无汗大便秘，脉浮弦，这个排异趋势的障碍在乳腺在乳腺与结肠，顺其势而用活血透表通便法；如发热不恶寒，有汗而大便秘结者，用活血通便法；若寒热往来，口苦咽干或渴身有汗出，大便正常的用调节三焦气机生津活血法。
人体的生存本能，对外界致病物质的排异性本能是生命的自然规律。医学必须认识这个自然法则，顺应自然法则才能成功保护生命。以上十例病案，仅仅是排异本能系统在外源性疾病中的小小一部分。疾病可以千变万化，但顺势利导的法则不变，这就是天不变，道也不变。
以下还有：自我修复本能系统、自我复制本能系统、自我更新本能系统、自主共生本能系统、个性传递本能系统、信息处理本能系统、意念能系统、自塑自我本能系统，在此不一一例解。
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