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[如何找到目标microRNA(前体,成熟)] 请教各位有经验的战友，如何才能查找到与靶mRNA结合并起调控作用的microRNA?本人对这方面的了解甚少，希望能有战友给出详细解答，不胜感激！回答内容至少包括以下方面： 提供软件或网址名称及具体操作步骤；查找到的microRNA分值较高，即能够检测到其在组织中的表达情况。最好能够说明检测microRNA前体以及成熟microRNA那个更方便。 我会按照操作步骤的满意程度额外赠送10~30个丁当。 关键词:[前体 成熟]… 请教各位有经验的朋友，如何才能查找到与靶mRNA结合并起调控作用的microRNA?本人对这方面的了解甚少，希望能有朋友给出详细解答，不胜感激！ 回答内容至少包括以下方面： 提供软件或网址名称及具体操作步骤；查找到的microRNA分值较高，即能够检测到其在组织中的表达情况。最好能够说明检测microRNA前体以及成熟microRNA那个更方便。 我会按照操作步骤的满意程度额外赠送10~30个丁当。 回复 最常用的是TargetScan and PicTar两个生物信息(bioinformation)学网站软件，具体的操作很简单，这两个网站都是既可以查询miRNA的可能靶基因，也可以查询靶基因的对应miRNA。比如说查询作用于RUNX2的miRNA  回复  回复 [Show conserved sites for miRNA families conserved only among mammals] [Show poorly conserved sites for miRNA families conserved among mammals or vertebrates] [Show sites for poorly conserved miRNA families] [View SVG image of miRNA sites] [View table of miRNA sites] [View human genome browser (Feb 09)] 然后可以根据你的要求选择不同匹配程度的miRNA，也可以选择miRNA的形式，如SVG 图或是表格样式的 回复  回复 然后点击任何一个miRNA，如miR-30a...就可以看到具体的匹配序列等信息  回复 pictar的操作和这个类似，至于你说的miRNA的前提还是成熟体，这是根据碱基配对原理预测的，只能是从成熟体中那20nt左右的序列得来的。对于这方面，可以到miRBase中去查询，看看有没有你想要的信息。  回复 然后点击任何一个miRNA，如miR-30a...就可以看到具体的匹配序列等信息 先送你10丁当，其实这个我之前也用过，就是看不懂上面的参数，不知道选择哪个MICRORNA更有意义。举个例子，麻烦您 查一下对“单羧酸转运蛋白1（MCT1）”具有调控作用的microRNA，并根据其CT值说明哪个更有意义，非常感谢！ 回复   回复 不知道你是做哪方面实验，对于这几个生物信息(bioinformation)学网站，它们的基础是基于碱基配对的，不论CT值或匹配程度怎么样，这只是生物学预测分析，要证明这个基因是miRNA的靶基因，需要的具体的实验。 回复 如果你只是针对一个基因，想做关于和这个基因相关miRNA的研究，只是同时这个样生物信息(bioinformation)学分析，肯定是不够的 回复 不知道你是做哪方面实验，对于这几个生物信息(bioinformation)学网站，它们的基础是基于碱基配对的，不论CT值或匹配程度怎么样，这只是生物学预测分析，要证明这个基因是miRNA的靶基因，需要的具体的实验。 第一步就是预测对靶点旗调控作用的MIR，之前也预测过不少，但最终都没做成。预测完之后还要继续往下做很多实验的 回复 你要是想在预测这方面多做些工作，或是说得到更靠谱点的结果，那到中山大自己的一个网站Starbase，整合的好几个预测软件，或许对你更有帮助 将本文分享到下面的网站：
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