内嵌帮助内联帮助可通过点击任何地方的链接  中找到。内联帮助由来自各部分的参考手册。 全球工具栏是从QuickGO的任何页面访问。下列功能可以从全局工具栏进行访问; 1. QuickGO搜索框 - 可通过关键字或标识符搜索GO术语或搜索蛋白的名称或加入。 2. Web服务 - QuickGO用品GO术语信息，并通过REST Web服务GO注释数据。 3.数据集 - 即QuickGO包含的数据的细节 4.期限篮- GO术语可以通过点击添加到您的篮子一词  出现毗邻GO方面的图标。欲了解更多信息，请参见下面的期限篮“部分。 注释工具栏无法显示页面的注释，如注释下载页面访问。 下列功能可在注解工具栏进行访问; 1.显示 - 注释表是按客户需要选择显示哪些列 2. ID映射 ??- 这种过滤器用于不同的序列标识符类型之间切换，默认为UniProtKB的加入。 3.过滤 - 注释集可以由几个参数，包括序列标识符，??类群，GO ID和证据码进行过滤。 4.统计 - 各种统计信息计算当前的注解集，包括许多不同的蛋白质，GO ID的数量，证据码数和类群标识符的数量。统计上更新即时对注解数据集中的每个过滤动作。 5.下载 - 注释集可以以多种格式，包括基因关联的文件，蛋白质列表和FASTA下载。的'限制'应该增加，以确保在该组的所有注解被下载（在一组注解的总数目被发现在注解表的左上方）。有一个选项，输出文件gzip压缩。 历史记录选项 默认GO项历史记录显示过去的500修改为所有GO条款。然而，除了点击选项卡，时间戳和走在默认的显示标识符，用户还可以通过添加参数输入页面的URL，使用历史记录选项的形式定制的GO长期变化的显示。因此，用户可以使用指定最感兴趣，对他们的书签定期更新所产生的URL变化的类型。 日期规格 在历史记录选项对话框允许用户通过设置“从”，指定感兴趣的明确日期范围和“到”参数; 这将限制显示到（含）日期范围内记录这些修改的数据。 另外，在“周期”参数，用户可以查看指定日期之前发生过天（S），周（S），月（S）或年（S）特定数量的GO长期变化。 如果没有“到”日期值被输入，则周期将是相对于当前日期。然而，如果指定了“到”值，则“周期”的值将显示在时间表记录直到和包括该指定的日期。 例如，如果“到”设置为2011-06-01和“期间”设定为6瓦特，然后QuickGO将显示记录在大小周期，2011年六月结束了第一这些变化。 分类 用户可以使用此字段来指定哪些类型的长期变化，他们愿意返回。 条款 GO条款可以在此字段中输入限制所显示的长期变化。请注意，只有变化做出直接列出的条款将被显示出来，不称之为后代。 限制 记录返回的默认数量为500，但这个限制可以增加/减少用户。为了防止可能的浏览器的问题，最大的上限为10,000。 GO术语可以通过点击被添加到期限篮 出现相邻GO术语图标。以这种方式，一组的GO术语可以被选择，然后可以用于检索相关联的注释 QuickGO主页。 QuickGO帮助手册。 从的UniProt-GOA网站下载基因关联的文件。 从GO术语关键字搜索返回的检索GO术语列表时列的说明显示该GO包含三个本体术语：分子功能，生物过程和细胞组分。 显示的值表示，其中三个本体一个GO长期驻留的。 为显示GO术语独特的，稳定的数值GO术语标识符 点击一个GO标识符将带你到GO术语详细信息页面，在GO来看，其中的详细信息，以及对使用这一术语的任何注释的列表。 单击其中一个 图标，使用户可以添加邻GO期限为期限篮这样产生的GO术语列表可用于检索包含一个或多个这些GO术语注解 为显示GO术语主的名字 当GO期限已过时，一个红色的“过时”的标签会出现相邻的上市GO术语。 点击这种“过时的”标记将生成一个弹出窗口，将详细说明原因，后面的词的obsoletion。 当搜索返回基于匹配无论是在GO术语的描述或同义词部分找到单词GO术语， 然后是一个“说明”或“同”的标签会出现毗邻上市GO术语。 点击这样的标签将产生弹出窗口示出的术语的定义或同义词，具有匹配字（多个）突出。 从蛋白质的关键字搜索返回的检索到的蛋白质列表时列的说明显示从独特的蛋白标识的UniProt知识库 点击加入将带你到一个包含所有GO注释蛋白质的页面。 该匹配于UniProtKB登录号基因符号 品种的展示蛋白质学名 通过UniProtKB提供蛋白质名 该值的GO术语的详细信息页面说明术语名称的说明 GO上长期使用的定义和言论的澄清 二级GO术语标识符列表这个词替换 链接到与此GO任期GONUTS维基页面 同义词在意到术语名称，与由同义词范围给定的名称和同义词之间的关系的指示密切相关的替代单词或短语。 交叉引用外部数据库条目相关的术语。 在GO的截面的视觉显示器向非循环图（DAG）的单个或一组GO术语。条款中的GO是由一个或多个“关系”联系到父（更普遍的）条款和常子（更具体的）条款 在GO的部分替代显示，提供连接GO方面关系的简明视图 儿童来讲是，现有的时候，直接链接到选定的GO术语更专业的GO术语。 GO条款和蛋白质标识之间建立关联。 蛋白质注解共同occurence的GO方面的统计。 列在表中注释的描述此列显示数据库的名称来自其注释的基因或蛋白质识别发送器（例如，UniProtKB，以RefSeq，MGI）。 请点击工具栏中的“ID映射”按钮，如果你想有显示的标识映射到不同的序列数据库。 该字段等同于GO联盟的的“DB”（列1）基因的关联文件。 此列显示已注明去序列标识符。 请点击工具栏中的“滤镜”按钮，如果你想看到注解序列标识符的具体名单。 另外，点击工具栏中的“ID映射”按钮，如果你想有显示的标识映射到不同的序列数据库。 该字段等同于GO联盟的的“DB对象ID”（第2列）基因的关联文件。 此列显示相匹配的“ID”栏提供的标识符号。 一个官方批准的基因符号将被用于在该领域时可用。可替代地，其他基因符号或基因座的名称被应用。 如果没有符号是可用的，该标识符在塔2施加（DB_Object_ID）将被使用。 该字段等同于“DB_Object_Symbol'的GO联盟的中（专栏3）基因的关联文件。 此列用于修改注释的解释。 当一个注解应用，值可以等于'没'，'contributes_to“或”colocalizes_with“之一。 在预选赛进一步的细节可以发现这里。 如果你想明确地筛选限定值，这个注解集，请单击工具栏中的“过滤器”按钮。 该字段等同于“预选赛”的GO联盟的中（专栏3）基因的关联文件。 此列显示原始注释的GO ID时，注释已经精简到更高级别的条款。 此列显示一个引用到一个参考，或者一个搜索PubMed引用或GO_REF标识符，它包含任一支撑所述注解或电子方法的细节的数据施加到产生的注释。 该字段等同于“DB：参考”的GO联盟的中（专栏6）基因的关联文件。 此列显示一个附加标识，以支持使用某些证据的代码（包括国际能源署（IEA），工业生产指数，IGI，IC和ISS的证据）的注释。 示例：UniProtKB：O00341，InterPro的：IPROO1878，ENSEMBL：ENSG00000136141，GO：0000001，EC：3.1.22.1 该字段等同于“有或从'GO联盟的的（第8列）基因的关联文件。 此列显示相匹配的分类标识符被注释的品种名称。 此列显示匹配在注释中使用的GO标识的GO术语名称。 此列显示原始注释时，注释已经精简到更高的层次来讲GO术语名称。 该列显示注释序列的氨基酸长度。点击的长度将导致包含实际序列的弹出框。 列在长期的历史/更改日志说明变更条款显示在根据由的UniProt-GOA数据库中登记的时间戳日期降序排列。 点击一个日期将显示被记录在该日的所有条款，这些改变。 不同的变化在GO术语重点围绕稳定GO标识符。 点击一个GO标识符将提供所选择的GO术语，其中包括记录这个词的所有更改的完整历史（在更改日志选项卡），完整的数据。 相关GO标识符的GO术语名称。 改变本体被记录在的UniProt-GOA数据库作为“新增”，“更新”或“删除”动作。 请注意，在这些变化的显示顺序是由在其中的行动是在数据库中执行的顺序决定。 这可能会导致在那里记录为相同的整体本体更新的一部分该动作可能会被显示在一个非直观顺序的情况; 这是不幸的是，不可避免的。 变化是通过记录到GO术语的具体方面的变化识别。 当前审计的类别有：TERM，OBSOLETION，定义，同义词关系，XREF??，中学和苗条。 除了“所有更改”选项卡，其中显示的变化在所有类别中，也有对各个类别单独的标签。 这列包含关于变更的其他详细信息; 它的内容可能有所不同取决于变更类别。 例如，对于关系类别它显示目标的GO术语的关系和所述标识符和名称的类型。 预选赛不被用于做出明确说明该基因产物不与GO术语相关联。GO 联盟的文档 'Contributes_to“出现在一个GO注释时的蛋白复合物的功能变得容易，但不直接由它的亚基1进行。GO 联盟的文档 'Colocalizes_with“出现在一个GO注解以指示与细胞器或复杂的蛋白的一过性或外围关联。GO 联盟的文档 GO参考从应用程序中创建的电子标注的InterPro到GO映射
在UniProtKB。GO 协会文件 从应用程序的创建电子注解酶委员会号GO映射
在UniProtKB。GO 协会文件 从应用程序中创建的电子注解SWISS-PROT关键字来GO映射
在UniProtKB。GO 协会文件 手工标注创建时策展人已经找遍了所有相关文献的注释蛋白，没有发现信息支持注释任何GO长期在一个特定的本体。这个参考只能与三个术语使用; 分子功能GO：0003674，生物制程GO：0008150和细胞组分 GO：0005575。GO 协会文件 从实验证实手工GO注释的数据传送到使用ENSEMBL直向同源基因数据创建电子注解。 的UniProt-GOA文档 从应用程序中创建的电子标注HAMAP到GO映射
在UniProtKB。GO 协会文件 从应用程序中创建的电子标注的UniProt亚细胞定位于GO映射
在UniProtKB。GO 协会文件 由GO联盟的参考基因组计划从进化树的注解创建推断标注PANTHER数据库
。GO 协会文件 证据法从实验推断。见GO联盟文档。 通过直接分析推断。见GO联盟文档。 从物理互为作用的推断。见GO联盟文档。 从突变表型推断。见GO联盟文档。 从表达模式推断。见GO联盟文档。 从遗传相互作用推断。见GO联盟文档 从审核计算分析推断。见GO联盟文档。 从基因组上下文推断。见GO联盟文档。 溯源作者声明。见GO联盟文档。 非溯源作者声明。见GO联盟文档。 策展人推断。见GO联盟文档。 没有数据。见GO联盟文档。 从序列或结构相似性推断。见GO联盟文档。 从序列直向推断。见GO联盟文档。 从序列比对的推断。见GO联盟文档。 从序列模型推断。见GO联盟文档。 电子注释推断。见GO联盟文档。 联合occurence术语的列表，其中最常注释以相同的蛋白质作为所选术语，且术语至少经常注释以相同的蛋白质。 该条款在注释选定的期限，并按概率比蛋白质超过限额。 相比术语：这是相对于所选择的术语 概率比 比较长期的概率比给出选择的术语来比较长期的概率 =（＃在一起/选择）/（＃比较/＃全） 长期的概率估计这里的注释，以长期的蛋白质部分。 概率相似比 这两个词的概率比任任期的可能性 =＃一起/（＃选定+＃compared-＃在一起） 长期的概率估计这里的注释，以长期的蛋白质部分。 伯爵的蛋白质，其中既选择和比较的术语注释 伯爵的蛋白质，其中较长期被标注 蛋白质的总次数注明所选词 蛋白质的总计数 GO注释集可以使用一组布尔操作的定制。 输入一个查询（可用字段和运算符如下所示）到输入框高级筛选对话框中的选项卡，然后按提交按钮提交查询。如果还设置过滤条件上的任何其他选项卡，它们也将被包括在查询，及编着与您在高级选项卡中输入的条件。 一般形式 查询是做出来的标注标准，结合运营商的集合。注释标准是表单字段= value，其中??多个字段和值可以用逗号分隔的前提。该标准匹配的注释中任何指定的字段有任何指定的值。例如，要找到任何注释与ISA，partof或身份关系方面去：0005515或GO：0005634： 身份，ISA，partof = GO：0005515，GO：0005634 标准相结合，与下面的运算：
查询示例： 找到所有ISS注释这些注释的任何蛋白的蛋白质结合了考研参考项： （祖先= GO：0005515＆REF =结论：*）证据= ISS 更高级查询的例子都可以在这里 领域
现有运营商的更多信息点击这里 此选项将导致注释被精简高达请求GO术语的所有祖先，利用一切关系的路线。 它将使用不仅is_a，part_of，调节positively_regulates和negatively_regulates的关系，但是也未定义组合关系，如：
有关GO关系的信息，请参阅GO联盟文档。 关系类型
有关GO关系的信息，请参阅GO联盟文档。 联系goa@如果您对结果数据的查询。 使用此选项可以查看，GO注释的过滤器和下载集。 QuickGO可以筛选注释集与特定的基因或蛋白质的标识符，GO术语标识符，分类标识符或证据码。 该页面还为您提供了不同的序列标识符类型（例如UniProtKB，ENSEMBL，以RefSeq或MGI标识符）之间的映射，并下载注释数据的能力。 使用此选项找出QuickGO如何帮助您创建自己的GO苗条，或使用预定义的GO GO财团以SLIMS产生本体结构的具体意见，或注释集。 使用此选项可以查看历史的变迁中去，作为记录在的UniProt-GOA数据库。 在此页面，您可以指定可选的过滤器来查看基于日期范围的修改，规定的条件和/或改变的类型。 本节将选择条款页面显示你的任期篮子的内容。 您可以通过点击它添加一个词来选择术语列表  图标; 您可以通过点击添加所有的条款，以列表的标题行中的图标。您可以通过点击它添加一个词来对比图  按钮。执行此操作时，该条款将被添加到图表和列表项将用来突出图表中的术语相同的颜色突出显示。此外，该按钮变为 ; 点击这个按钮删除从图表中的术语。您可以通过点击添加所有的术语来对比图 的标题行中键。本节编辑条款页面显示您所选择的是你苗条的一部分GO术语列表。术语列表被划分成三个部分，每个本体。 您可以通过点击它从列表中删除的项  按钮。如果你点击了ontolgy标题行中按钮时，将删除从列表中本体的所有条款。您可以通过点击它添加一个词来对比图 按钮。执行此操作时，该条款将被添加到图表和列表项将用来突出图表中的术语相同的颜色突出显示。此外，该按钮变为; 点击这个按钮删除从图表中的术语。您可以从本体通过单击添加所有条款 的本体标题行的按钮。关系类型项A is_a项B指这个词一个词是B的子类型 。例如，“转录”是一种“核酸代谢过程”中。 项A part_of项B指短期A始终是长期B的一部分 。例如，“转录”始终是“基因的表达”的一部分。 项A规定条件B指这个词一个调节项B，但项B可能并不总是被长期A.调节 一个子关系的“调整对象”的关系。 期限一positively_regulates项B指项B正由长期A.调节 一个子关系的“调整对象”的关系。 期限一negatively_regulates项B指长期B的负面长期A.调节 has_part意味着项B总是有，因为它长期A的一部分，但长期A可独立存在长期B的 。例如，“蛋白质结合trancription活性因子”总是作为它的一部分“蛋白结合”，而是“蛋白结合”可以独立地发生的转录因子的活性。 另外，has_part不是过渡关系，意思是有否暗示基因产物注释以术语A可能还与术语B或它的任何父词条正确相关联 。Has_part 应读入相反的方向上的其他关系。 文件即将更新... 数据下载格式已创建的过滤注释集可以从QuickGO以多种格式被下载（见'制表符分隔值'下面为用户指定的下载格式）。
“有了'弦该GO协会的指导方针上采用了推断的序列相似性（ISS）的证据代码的建议“与”字段中填充了一个数据库标识符， 凡“与”字段中填入“附：Not_supplied”，注释组创建注释没有为这个领域的任何条目。 |
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