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人类基因和种族是怎样测定出来的(上)

 汉青的马甲 2016-09-22

       人类基因和种族是怎样测定出来的(上)

       许多科学领域我们知之甚少,或不知而自以为知。例如说到人类基因组测序问题,有人把它和DNA测试混为一谈,它们之间有何区别?有一些术语都弄不清,不知什么意思,如何分得清楚到底说的是什么?如什么叫DNA、RNA、基因、酶、碱基、核苷酸、氨基酸?

       脱氧核糖核酸叫DNA,是一种生物大分子,可组成遗传指令,引导生物发育与生命机能运作。主要功能是信息储存,可比喻为“蓝图”或“食谱”。其中包含的指令,是建构细胞内其他的化合物,在细胞内,DNA能与蛋白质结合形成染色体,整组染色体则统称为染色体组。对于人类而言,正常的人体细胞中含有46条染色体。DNA是高分子聚合物,DNA溶液为高分子溶液,具有很高的粘度。如蛋白质与核糖核酸所需。带有蛋白质编码的DNA片段称为基因。

       基因是指在细胞核里的DNA的分子中,通过(转录)合成出核糖核酸(简称RNA〕,RNA再合成出蛋白质,这是催化细胞里新陈代谢过程的酶类,或是多肽激素等具有生理活性的蛋白质,这些是能够进一步地调控细胞的生命活动过程的遗传信息叫基因,被称之为“中心法则”。RNA起传递作用,因而又叫“信使RNA”。这个“中心法则”简单地说,就是:DNA制造RNA,RNA制造蛋白质,蛋白质反过来协助前两项流程,并协助DNA自我复制,即完成遗传信息的转录和翻译的过程。

       酶、碱基、核苷酸、氨基酸又是什么?酶,指具有生物催化功能的高分子物质, 在酶的催化反应体系中,反应物分子被称为底物,底物通过酶的催化转化为另一种分子。几乎所有的细胞活动进程都需要酶的参与,以提高效率。碱基又叫核苷酸,碱基是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。蛋白质是由氨基酸构成的。氨基酸就是含有氨基和羧基的一类有机化合物的统称。生物功能大分子蛋白质的基本单位,是构成动物营养所需的蛋白质的基本物质。

       这之中最让科学家们好奇的是,RNA到底怎么制造蛋白质呢?RNA是一条由核酸构成的单链,蛋白质是由氨基酸构成的,所以最初科学家猜想,RNA中的一个碱基决定一种氨基酸。这些碱基共有四种:腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤的(G),但这样的话,四种碱基就只能决定四种氨基酸,显然不够决定生物体内的二十种氨基酸。如果是二个碱基结合在一起,决定一个氨基酸,那么就可以决定十六种氨基酸,显然还是不够。如果三个碱基组合在一起决定一个氨基酸,则有六十四种组合方式,即4的3次方=64种,64种碱基的组合即64种密码子。看来三个碱基的三联体就可以满足二十种氨基酸的表示了,而且还有富余。每一个三联体密码都具有一定意义,有的代表转录的起始,有的代表转录的终止,这就是著名的“三联体密码”猜想,是1959年被美国生化学家尼伦伯格(1927-2010年)等人用“体外无细胞体系”的实验证实的。也就是说,信使RNA分子中的四种核苷酸(碱基)的序列通过“三联体密码”能决定蛋白质分子中的20种氨基酸的序列,从而破解了基因密码的初步工作。这就是DNA测序工作,也就是指分析特定DNA片段的碱基序列。

       尼伦伯格是怎样通过“猜想”找到三联体密码的呢?

       尼伦伯格的思路很简单,也很严密。他想,既然核苷酸的排列顺序与氨基酸存在对应关系,那么只要知道mRNA链上碱基序列,然后由这种链去合成蛋白质,不就能知道它们的密码了吗?所以,他尝试着构建仅仅含有单一碱基尿嘧啶(U)的mRNA链,做试管内合成蛋白质的研究。也就是说,在这一条mRNA链里,只有UUU这个单一密码子的存在。把这种mRNA放到和细胞内相似的溶液里,应该得到由单一的一种氨基酸组成的蛋白质。这样合成的蛋白质中,只含有苯丙氨酸。于是,人们了解了第一个蛋白质的密码:UUU对应的氨基酸是苯丙氨酸。随后,又有人用U-G-U-G交错排列的mRNA合成了半胱氨酸—缬氨酸—半胱氨酸的蛋白质,这说明UGU为半胱氨酸的密码,而GUG为缬氨酸的密码。通过尼伦伯格的实验,人们不仅证明了遗传密码是由3个碱基排列组成,而且不断地找出了其他氨基酸的编码。

       破译64个密码子的工作并不简单,现有有三拨人逐步发展出了四种破译方法,终于才在1965年找出完全密码子和氨基酸的对应表,这三位科学家,包括尼伦伯格和其他两位美国科学家分享了1968年的诺贝尔奖。

       遗传密码的破译解决了遗传信息本身的物质基础含义,而中心法则的修正则解决了遗传信息的传递途径和流向问题……加上20世纪60年代初,人们相继发现了限制性内切酶和DNA连接酶等,它们可以帮助实现DNA分子体外的切割和连接。以上研究成果为人类开始“操纵”基因,也即基因工程的问世提供了准备——即人类基因组计划,其目的首先是把人类23对染色体上的碱基排列顺序一一测试出来,以供科学家进一步研究所谓基因图谱——31亿个“字母”排列组合4种碱基A、T、G、C 形成的基因排序。

       基因测序只是基因检测的方法之一,其又叫基因谱测序,是国际上公认的一种基因检测标准。历时16年的人类基因组研究计划,是要完成人类基因组测序,目的不只是为了读出全部的DNA序列,更重要的是读懂每个基因的功能,每个基因与某种疾病的种种关系,真正对生命进行系统地科学解码,从此达到从根本上了解认识生命的起源、种间、个体间的差异的原因,疾病产生的得机制以及长寿、衰老等困扰着人类的最基本的生命现象为目的。

       “21世纪是基因的世纪”。随着基因技术的不断突破,个体通过检测基因来预知自己的未来健康状况,有针对性地进行保健和治疗,颠覆了传统的健康观念,帮助人们从被动预防治疗走向主动预知健康,这是一次医学史上的全新改变。例如研究人员把艾滋病(HIV)蛋白酶分子作为对象,酶在不同人体中形状略有不同,如果知道了酶的形状,就可以找到相应的药物来阻止这一过程。有可能通过病人的基因组序列,推断出酶的形状,构建准确的蛋白质三维结构,筛选匹配药物,并将结果告诉主治医生给出最优处方。

       如今人们只需要一滴血或一点唾液,就能预测罹患多种疾病,如癌症或白血病;更能帮助警方准确快速破案。基因测序就像一把双刃剑,如果运用得不得法,它也有消极的一面。若全基因的检测普及,含有基因缺陷的人的信息,一旦落入保险公司或者被测者雇主的手中,将对他的生活产生不良影响。基因测序是基因检测领域的一项新技术,虽然速度快、成本低,但也因尚未经过监管部门的系统评价、准入,尚存安全性、有效性风险。

       目前从应用的角度来说,科学家只确定了部分的基因位点与疾病的确切关系,也就是说真正可以用于临床诊断和指导治疗的基因检测并不多。要想真正全面的用基因来诊病,还需要时间。权威调查显示,基因检测市场比保健市场更为庞大,未来将达到几百万亿美元的市场。美国2007年有500万人接受基因检测,达到30亿美元的市场收益。在英国,基因检测已经在健康超市出现,英美等发达国家基因检测就像体检一样普及。

       我们通常关注的外貌特征包括肤色、身高、胖瘦、眼睛、鼻子、下巴、耳朵等,按照遗传倾向或者概率的大小,区分为近乎百分百的“绝对”遗传(包括肤色、下巴和双眼皮等)、有半数以上概率的遗传(包括身高、胖瘦等)和后天可塑的遗传(包括声音、腿型等)。

       2014年科学家研究表明,人体内仅有8%DNA具有重要作用,剩余的DNA都是“垃圾”。英国牛津大学研究显示,仅有8.2%的人体DNA具有重要作用,剩余的DNA都是进化残留物,就像是阑尾一样,对人体无益,也没有什么害处。人类单核苷酸多态性的比例约为1/1250bp,不同人群仅有140万个核苷酸差异,人与人之间99.99%的基因密码是相同的。并且发现,来自不同人种的人比来自同一人种的人在基因上更为相似。在整个基因组序列中,人与人之间的变异仅为万分之一,从而说明人类不同“种属”之间并没有本质上的区别。

      在人类冗长的DNA分子中,有具体表达功能的基因只有三万个左右,而大部分的区段都只是填充基因组或维持分子结构的无意序列。这些序列的变异往往不会影响正常的人体功能,所以可以自由的与人群分化同步。然而,不管有无功能,位于常染色体上的序列都会碰到混血的难题。人类基因组主要分成23段,每一段构成一种染色体,其中22种是常染色体。每种常染色体在每个人体内都有一对,其一来自母亲,另一来自父亲,但在继续传给后代时,父母双方的染色体会打断而后重新拼接,即重组。所以不同位置的突变之间毫无关系,其组合完全没有意义。

       于是,人们自然开始关注没有重组现象的区段,其一是线粒体,其二是Y染色体非重组区NRY。线粒体是男女都有的,但不管男女都来自其母亲,男性的线粒体无法传给后代(线粒体位于细胞质里,男女交配授精过程中,精子细胞只有细胞核和卵细胞核融合,精子的细胞质包括线粒体被排除在卵细胞之外),所以人们的线粒体都来自其女祖先,自然不存在重组。NRY则只有男性体内存在,更无法重组。这种不重组的区段,最大的优点是其上的突变是紧密相关的,每一个突变都代表着整个区段的特性。先后发生的突变,也会有上下游关系。这样,不仅突变的谱系清晰,不同性质的突变,在研究时也可以相得益彰。相关联的突变构成的组合结构叫做单倍型。而每种单倍型的发生年代可从其相关的“时钟”标记计算得到。这样,只要民族群体有特征单倍型,其发生渊源和年代就可推断。

       由于技术难度不同,最早研究的非重组区是线粒体。在分析了遍及全世界的几千个人的线粒体之后,1987年,发现线粒体的系统发源于非洲,这一学说被称为”非洲夏娃说”,这项研究揭开了遗传学方法探索人类史前历史的序幕。从现代人的线粒体发现现代人类起源于十万年前的非洲。

        2016.9.19

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