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大家好，我是骨头实验室新来的博后，应骨头师妹邀请成为新的万事屋NPC。我今年刚从火箭军部队医院转业出来的，以后就叫我东风快递员吧。“东风快递，使命必达！” 发表论文过程中大家经常遇到需要展示KEGG通路数据的情况，但是KEGG pathway数据库中的图片分辨率实在太低，而且配色方案难看，今天推荐给大家一个信号通路数据库Reactome（http://www.）。 从字面意思来看这个数据库叫做“反应组学”，是一个汇集了由专家撰写，经同行评阅的有关人体内各项反应及生物学路径的文章的数据库。目前该库目前覆盖了UniProt数据库中20,000个经人工注释过的人类蛋白质中大约70%以上的蛋白质，对46个主要人类生物学研究领域，如细胞凋亡、HIV、流感病毒生活周期、DNA复制、转录、生理止血机制、碳水化合物代谢途径等进行了注释，并对与OMIM疾病表型相关的1005个蛋白质的正常功能进行了记录（http://www.ncbi.nlm./omim/）。此外相对于KEGG数据库，也是一个改良的搜索及数据挖掘工具，可以简化与生物学途径相关的数据搜索与研究。主页是图1的样子。
点击Browse Pathway可以进行通路检索，整个页面布局有点像Perzi做成的PPT，不同的生物反应按照模块划分为多个烟花状的有向无循环图（图2）。标记1处可以按照不同的生物功能来检索自己所需要的通路；标记2处可以选择物种；标记3处点击放大镜，可以通过特定关键词（比如基因、小分子、代谢产物）检索相关通路；标记4处的相机可以对当前页面进行拍照下载。我们这里随便看一下干扰素相关通路，配色方案还不错哦（图3）。
这个数据库还可以进行基因分析，点击图1中的Analysis Data即可进入分析界面（图4）.这里可以进行两种分析，一个是分析一系列基因涉及到哪些通路，另外一个是对比物种间的通路差异，两者显示方式相同，都通过对有向无循环图标黄来显示。这里我们对比了人与小鼠的信号通路差异，如图6所示。
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