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虽然王清任亲自观看了许多尸体，用三分之一的篇幅描绘了他所亲历见的脏腑解剖，提出了传统脏腑理论中的诸般错误，对我国传统医学解剖有重要的革新意义，但他对诸多脏器的命名和功能解释从现代医学观点看仍是错误的。除了对人体解剖方面的贡献外，书中更多的篇幅论述了王清任对气血为病，特别是气虚血瘀证的诊治经验。此外，书中脑髓说中提出了“灵机记性，不在心在脑。” 在《方叙》中，王清任说：“病有千状万态，不可以余为全书。查证有王肯堂《证治准绳》，查方有周定王朱绣《普济方》，查药有李时珍《本草纲目》，三书可谓医学之渊源。可读可记，有国朝之《医宗金鉴》；理足方效，有吴又可《瘟疫论》。其余名家，虽未见脏腑，而攻发补泻之方，效者不少。余何敢云著书，不过因著《医林改错·脏腑图记》，后将平素所治气虚、血瘀之症，记数条示人以规矩，并非全书。”可见王清任并没有因为解剖上的新认识，而完全抛弃了中医学理论。但在书中最后《辩方效经错之源，论血化为汗之误》篇中，王清任却并不认同伤寒论的六经理论，且认为汗为血化是错误的。本书其余部分，作者重点的强调了气血为病的治疗经验和理念。抛弃前面三分之一的解剖部分，直接阅读后面治疗部分，似乎并不受解剖的影响。 下面是我在阅读解剖部分摘录的经典语句，我觉得抛弃解剖部分阅读这些就够了。后面的方用及病论更值得学习研究。尤其同时活血方，为何用药选择有所差别，最值得研究，而作者并未点明。 方用中包含了：通窍活血汤、血府逐瘀汤、膈下逐瘀汤、少腹逐瘀汤。病论中讨论了半身不遂、瘫痿、瘟毒吐泻转筋、小儿抽风、小儿痘疹、痹证、怀胎。
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