【404期-1】液体活检有多重要？一管血就能检测癌症的新科技！

2016年12月7日，由阜外医院实验诊断中心分子诊断科、赛默飞世尔、安塞斯生物联合成立的“精准医学联合培训中心”，在国宾酒店成功举办了第四次学术沙龙，赛默飞世尔科技公司的液体活检项目负责人Devin Dressman 发表题为《使用NGS重建液体活检研究的罕见变异检测》的报告，北京大学人民医院胸外科李浩博士发表题为《循环肿瘤DNA液态活检在肺癌研究及诊疗中的应用》的报告，我们现在就听听两位专家报告有哪些你不能错过的精彩干货！

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北京大学人民医院胸外科李浩博士《循环肿瘤DNA液态活检在肺癌研究及诊疗中的应用》

1975-2007年美国肺癌患者5年生存率没有太大提高，手术、放疗和化疗等传统治疗的疗效进入平台期。肺癌是发病率和致死率最高的恶性肿瘤，也是基因异常最清楚的实体肿瘤，2009年之前我们对于肺癌的治疗方法只有化疗，化疗有效率只有30%，而且无法筛选哪些患者能从化疗中受益。2009年之后出现了靶向治疗的药物，药物的有效率上升到70%，经过突飞猛进的两三年的发展，我们有了肺癌很多突变的靶点，药物的有效性进一步上升，我们很大的努力在于克服肺癌的耐药性。

就用院长的一句话说：有基因突变可以靶向治疗的肺癌我们可以把它变成慢性病。

现在肺癌的靶向治疗药物如下图所示，上标1234代表处于临床研究的不同阶段，如何选择如何组合，如何克服耐药突变，是在未来亟待解决的问题。

在吴一龙院长的推动下，CSCO联盟建立了中国肿瘤驱动基因分析联盟分析中国人自己的基因突变。由于亚洲人的基因突变的频谱与西方人不同，检测中国人自己的基因突变频谱非常有必要，而且对推广从基因检测到临床靶向药物治疗也是非常有必要的。

组织基因检测有以下3点困难：

(1)取得肿瘤组织有创性，做手术取材比较困难，对高龄患者和无法耐受手术的病人尤其困难。

(2)穿刺获得样本太少不足以做基因突变的检测。

(3)癌症组织特异性：具有空间组织特异性和时间异质性，同一个病灶在不同的区域进行取点进行高通量的测序，突变是不同的，肿瘤的发生发展和应用药物的过程中，肿瘤的突变频谱都发生了变化。往往对原始的治疗产生耐药，这就需要重复活检，可是患者不愿意承担有创性的风险，没有办法做到动态监测。

在这种情况下，液体活检应运而生，ctDNA检测是液体活检最为成熟应用最为广泛的检测。

现在已有很多研究探究过肺癌晚期临床病人外周血ctDNA和肿瘤组织DNA的一致性基本能达到70%以上，有些可以达到90%，因此外周血ctDNA可以作为组织检测的可靠补充。

王俊博士还分享了和圣谷同创公司开展的前瞻性的早期肺癌ctDNA基因检测研究，收录进2016美国肿瘤协会ASCO poster discussion，并获大会Merit Award。

可点击收看下方视频，了解完整报道

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赛默飞世尔科技公司的液体活检项目负责人Devin Dressman 《使用NGS重建液体活检研究的罕见变异检测》

血液中有多种来源的肿瘤DNA，主要是循环肿瘤细胞（CirculatingTumor cell）、循环游离DNA(cell-free DNA)和外泌体(Exosomes)，液体活检和组织活检相比，克服了取样困难无法实时取样和无法反应肿瘤异质性的困难，可以快速得到结果。

赛默飞有从cfDNA提取到数据分析的整套解决方案来检测cfDNA，Oncomine Knowledgebase Reporter可以将检测到的cfDNA突变和用药指导信息和公开的Clinical trial信息关联起来以提高参考建议，数字PCR平台还可以对cfDNA突变结果进行验证。

我们进行了大量样本的测试，从10ml全血中可以提取20ng cfDNA，20ng cfDNA有6000个基因组拷贝，含有突变分子数是6个，由于cfDNA已经被片段化，6个突变分子在实验中利用率是50%，真正我们检测到的是3个突变分子，因此需要检测0.1%的突变，至少需要有20ng cfDNA大约10ml的全血。

质控品测试结果在0.1%突变频率下，特异性99%，灵敏度85%没有那么高是因为1%的突变频率下，有10%-15%的概率突变分子没有和Assay试剂结合。一旦增加了突变分子的量，在0.5%的突变频率下，特异性98%，灵敏度提高到99.9%。

用Horizon公司提供的Control(含有8个突变位点和突变频率)验证和血浆组织样本验证都得到了优异的结果。

来源： IonTorrent