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免疫治疗流程中的基因检测

 蓝调闲人 2017-04-11

201632Science Translational Medicine 上面发表了陈列平教授的综述:PD-L1(B7-H1) and PD-1 pathway blockade for cancer therapy Mechanisms, responsebiomarkers, and combinations。其中总结了百时美施贵宝得纳武单抗OPDIVOnivolumab)和默沙东的帕母单抗Keytruda,Pembrolizumab)等PD-1, PD-L1阻断剂的临床结果。目前国内也开始了相关的临床试验。这里结和这篇综述,看看我们可以为此类临床试验提供哪些支持:

  

1.    Biomarker

    PD-1PDL-1IHC检测是目前认为关联性比较强的检测,虽然有些争议,但是这些检测价格不高,临床实践上估计会采用。

 

2.    Neoantigen

    TumorAssociated Antigens (TAAs) 是肿瘤产生的抗原,这些抗原大多数是自身抗原,由于肿瘤有很多特异性突变产生,这些突变可能导致出现一些肿瘤特异性地抗原(NeoAntigen)。T细胞可以识别这些抗原,杀死肿瘤细胞。在免疫治疗中,当PD-1抗体阻断掉了免疫检查点,激活的T细胞将更容易杀死那些有Neoantigen的肿瘤细胞,

 

    艾达康的OncoGxOnePlus 肿瘤精准检测服务有333个肿瘤相关的基因,除了全面覆盖已批准上市以及处于临床试验阶段的靶向治疗、化疗药物相关的基因之外,还加入具有潜在临床意义的癌症基因;

 

    OncoGxOne Plus基于二代测序平台,基因的点突变、插入缺失、基因扩增及基因融合等,平均测序深度大于250X

 

    该检测采用全自动化数据分析,充分分析数据,报告内容详实,易为临床专家理解和接受;

 

    OncoGxOne Plus中我们增加了HLA(人类白细胞抗原)分型信息

 

    人类白细胞抗原(HLA)基因分布在第6染色体上,存在丰富的基因序列多态性,其对应等位基因的编码产物负责与靶标肽链结合形成抗原表位。癌症细胞免疫治疗技术中,因参与呈递肿瘤特异多肽到树突状细胞(DC)表面及随后刺激形成具有特异抗肿瘤活性的T淋巴细胞群,影响效应T细胞对肿瘤细胞的有效识别。因此,HLA基因分型对细胞免疫治疗个体化方案的制定可能有一定参考价值。

 

    为了更契合免疫治疗,在最新版的OncoGxOnePlus中,我们增加了PD1/PDL1expression level检测。用于提示PD-1阻断剂对肿瘤的治疗效果。

 

3.    MutationBurden

 

    在临床研究中发现大量的非同义突变预示较好的反应。MutationBurden是一个被普遍认可的指标。

 

    我们可以通过全外显子组测序(WES)来分析肿瘤的MutationBurden

 

4.    肠道菌群检测FloraCheck

 

    肠道微生物对于免疫治疗有重要的意义。2015年的Science (Science. 2015 November 27; 350(6264):1079–1084)曾经报道了CTLA-4抗体的效果依赖于肠道中B. thetaiotaomicronB.fragilis 两种杆菌的量。PD-1阻断剂有同样的情况。

 

    艾达康结合世界领先的16S rRNA基因检测技术,以及全面的健康和菌群解读数据库。FloraCheck?菌群检测服务深度解析“无所不在”的菌群组成信息,增强人们对自身菌群状态和相关干预策略的充分认识,服务个体化健康管理。现在该检测可以直接用到PD-1 免疫治疗药物的临床试验中。

更多信息也可以参照:http://www./

 

5.   甲基化

 

    文章讲到甲基化药物与PD-1治疗的联用,提示甲基化检测的重要性。我们的甲基化检测也正在研发过程中,预计在2016年中可以上市。

 

6.   液体活检

 

    目前肿瘤的预后,复发监控和耐药都已经对液体活检提出了新的要求。相信液体活检也可以令接受免疫治疗的患者获益。

 

    AdmeraHealthBESTTM 技术(Blocker-based Enrichment System for Tumor DNA) 可以实现高度的灵敏度的原理在于用特殊探针封闭野生型DNA,这样突变的DNA就会被相对富集起来,达到用NGS有效检测突变DNA

 

    Admear Health BESTTM液体活检技术具有高度灵敏性100% @0.01% MAF96.05%@0.005% MAF。目前几个位点的灵敏度:

 

BRAF V600. LOD 0.005%.

EGFR Del19. LOD 0.01%.

EGFR T790M. LOD 0.01%

EGFR L858R. LOD 0.004%

KRAS G12. LOD 0.01%.

ALK融合. LOD 0.1%.

ROS1融合. LOD 0.1%.

 

201629 Admera Health 的液体活检技术BESTTM获得了美国CLIA的认证。更多位点可以进行定制开发。

 

综上所述,针对免疫治疗,艾达康提供综合的检测服务,希望可以和中国临床医生开展伴随诊断,实施更精准的个体化治疗。


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