【原】肿瘤基因检测知识都在这，有你想知道的吗？！

肿瘤基因检测，对于业内人士来说，从来就不是什么“高大尚”的技术；但是，对于医生或患者来说，那可就真的是“既熟悉又陌生”的高科技技术！今天，我们和大家分享关于肿瘤基因检测最常用的知识，希望能对大家有所帮助！

什么是肿瘤基因检测

肿瘤基因检测是通过组织、血液、其他体液或细胞对肿瘤患者的DNA进行检测的技术，通过特定检测设备对被检测者细胞中的DNA分子信息作检测，分析它所含有的各种基因突变情况，从而能针对性地为每位患者“量身定制”一套最合适的治疗方案，最大程度地提高治疗的有效率，减少药物的毒副作用，避免用药不当贻误治疗时机。

肿瘤基因检测亦是肿瘤精准医疗的基础。

肿瘤基因检测都有啥用

肿瘤组织或血液基因检测是评估患者使用药物种类和效果判定非常重要的一环，能从分子层面给医生用药予精确的指导，达到提高疗效、降低副反应的效果。

1）选择最有效的肿瘤治疗药物；

2）通过对相关基因的连续动态分析，判定治疗效果及耐药；

3）通过分析基因突变及微卫星稳定性，初步分析肿瘤负荷（TMB）状态、有助于判定免疫治疗药物应用的有效性；

4）检测相关基因的状态，有助于了解肿瘤发生的可能原因。

基因检测，选择什么标本最合适

做基因检测，是检测肿瘤细胞的突变，因此需要获取肿瘤细胞。临床上通常有3种方式：

1）手术切下来的肿瘤样品；2）穿刺活检样品，穿刺针刺入怀疑肿瘤的部位，获取少量组织；3）液体活检，对血液里的癌细胞或者癌细胞释放的DNA进行分析。

我们一般推荐的优劣顺序是：

最近手术或活检新取的组织标本＞1-2年内的组织标本＞ 新的血标本＞2年以上的旧的组织标本。

 

肿瘤基因检测panel是啥

Panel 是NGS（二代测序，高通量测序技术）技术发展起来的一个词语，主要指同时检测多个基因、多个位点。几个基因可以是一个 Panel，几十个基因也可以是一个 Panel，几百上千个基因也可以是一个 Panel，组合在一起我们称为“基因套餐”。

做肿瘤基因检测的话，是不是panel越大越好

首先，目前市场上基因公司超过3000家，有部分公司是不靠谱的，需要选择大公司。其次，在真正选择产品（大中小panel）的时候建议大家根据经济条件及患者的情况来选择。

比如，一个晚期肺腺癌患者，经济情况一般，只是为了看看，是否有合适的已经在内陆上市的靶向药可用，那么只要测一下最常见的那几个基因就可以了。再比如，一个土豪，看看自己是不是有靶向药可用：不管是已经上市还是处于临床试验研究阶段的，不管是国内还是国外，都想知道。那么，他可以选择做尽可能多的、几十上百甚至全部的基因。

PS：有经济实力，还是建议尽量做大套餐，比如晚期多处转移的时候，尤其是耐药的患者，基因突变比较复杂紊乱，早做检查避免治疗青黄不接。大套餐还可以检查PD-L1、TMB、MSI及MMR的情况，看看是否适合免疫治疗。

是不是所有靶向药，在用药前都需要做肿瘤基因检测

NO。有些靶向药，目前并不知道，哪个或者哪几个基因变异，与这些药物的疗效有相关性。比如索拉非尼、瑞戈非尼、卡博替尼等多靶点的抗血管生成靶向药物，使用前无需做基因检测。

《新型抗肿瘤药物临床应用指导远侧（2018年版）》

不过，对于有明确疗效/耐药靶点的药物，须遵循基因检测后才可使用！

有基因突变，是不是一定有靶向药可用

NO。基因突变的类型太多，绝大多数基因突变，目前无法明确是不是和肿瘤有关；大多数能明确和肿瘤一定相关的基因突变（比如P53突变、KRAS突变、MYC扩增等），目前尚无已经上市的靶向药。因此，经常发生测了基因突变，但是依然没有合适的、已经上市的靶向药可以选择。

用PD-1抑制剂，为何也要做基因检测

免疫治疗有适应症，不同癌种有效率亦不同，不能神化免疫治疗。一般来讲PD-1类药物的有效率在20%左右。对于PD-L1高表达的患者可能会达到45%，存在dMMR突变的患者约可达到40%。所以治疗前，进行基因检测还是有必要的，毕竟治疗费用昂贵。

1）肿瘤突变负荷（TMB）高的患者，PD-1抑制剂的有效率更高，生存期更长；

2）携带JAK1、JAK2、BM2、HLA、STK11等基因突变的患者，可能对PD-1抑制剂天然耐药；

3）携带EGFR突变、MDM2扩增的患者，使用PD-1抑制剂，可能发生爆发进展；

4）携带PBRM1、POLE基因突变的患者，使用PD-1抑制剂，疗效很好。

肿瘤药物治疗是否都需要基因检测

按照基因检测用于药物选择必要性的大小，依次排列：

1）靶向药物（完全必要，见上文）

2）免疫检验点抑制剂（必要，见上文）；

3）细胞毒类药物（需要非必需）；比如：UGT1AI野生型患者接受伊立替康化疗后产生腹泻的副作用较低，UGT1AI突变和杂合型使用伊立替康可产生致死性腹泻可能

4）激素类药物（可选择）；

5）生物反应调节剂（意义不大）；

6）辅助药（意义不大）

肿瘤二代测序（NGS）、液体活检—了解

肿瘤细胞相比正常细胞，最重要的不同就是产生了驱使肿瘤发生的突变基因（驱动基因），因此肿瘤本质上是一种基因病。NGS可以从基因的层面了解肿瘤，检测出、并定量其中驱使肿瘤发生的基因成分，并根据检测结果推荐使用靶向药物、免疫药物。

NGS检测：解决传统分子方法面临的挑战

以肺癌为例，已经有10余种靶向药物在国内获批上市，同时还有几十种药物正在开展临床实验。 

肺癌获批靶向药物（FDA：美国食药局，NMPA：国家药监局）

基于这些靶向药物的多样性，临床检测需求已经从单一基因推进到了多基因平行检测，患者如果想通过一次检测筛选出所有可能获益的药物，传统分子方法将难以胜任。

传统分子检测 VS 多基因平行检测

液体活检：对组织检测有价值的补充

液体活检，主要是指通过分析血液里的癌细胞或者癌细胞释放的DNA进行分析，判断癌症突变类型。通过检测从肿瘤组织释放到血液中的ctDNA以获得癌症相关基因变异信息的液体活检方法能够真实地还原患者肿瘤的具体情况。

液体活检还可以实现不同时间点的动态采血，继而实现对于肿瘤治疗过程的动态监测，并可能比影像学更早发现耐药分子机制的发生，这都弥补了组织检测的不足。此外，对于晚期无法获得组织活检样本的患者，液体活检也是有利的补充。

链接：

肺癌靶向药物疗效好、副作用小，都可以试试？

稿件来源：浙江省荣军医院分子病理室

科室成立于2017年初，现科室拥有一支专业知识全面，年龄梯次合理，技术力量较为雄厚的学术队伍，能开展临床分子检测及基础研究，拥有分子病理诊断医师和技术人员4人，其中含硕士研究生及以上学历3人，高级职称2人，中级职称1人，初级职称1人。

科室用房面积200余平方米，配备先进的实验室设备，目前已建立完善的荧光定量PCR、数字PCR、荧光原位杂交、CTC、一代测序、二代测序等多种检测平台，并成功在肺癌、结直肠癌、甲状腺、乳腺癌、胃癌、冠心病、结核杆菌和幽门螺杆菌检测中开展相关分子检测项目，为指导疾病的精准医疗，特别是为肿瘤的分子分型、靶向治疗及科研等方面提供了重要的数据资料。科室多个基因检测项目通过国家卫生计生委病理质控中心（PQCC）和国家合格评定国家认可委员会（CNAS）的检测能力验证，并通过欧盟EMQN认证，分子病理室成立至今医技人员已发表论文20余篇，其中10余篇被SCI杂志收录，包括Clin Chem，Ann Oncol， Oncologist，J Thorac Oncol，Lung Cancer，Clin Lung Cancer 等，在国内外肿瘤学大会上进行口头发言和壁报交流20余次，包括USCAP，ECP，JSP，AMP等，参编专著10余篇，获国家实用型专利2项，发明专利1项。

目前开展业务满足三甲医院临床诊疗的需求。科室常规开展业务包括：（1）乳腺癌、胃癌HER2基因荧光原位杂交；（2）非小细胞肺癌EGFR、ALK、ROS1基因检测；（3）结直肠癌KRAS、NRAS、BRAF基因检测，MSI/dMMR相关基因检测；（4）甲状腺BRAF基因检测；（4）冠心病CYP2C19基因检测；（5）结核杆菌检测；（6）幽门螺杆菌（HP）检测。