原创 2017-04-27 C君 GCBI知识库 今天的周四课堂王刚老师给我们安利了一种研究策略,当研究方向不是热点时,如何让其焕发新的活力。课程中以lncRNA Hotair为例进行讲解。
文章案例 LncRNA HOTAIR Enhances the Androgen-Receptor-Mediated Transcriptional Program and Drives Castration-Resistant Prostate Cancer PMID: 26411689 IF:7.870 Cell Rep. 2015 Oct 6 这篇文章讲了一个啥故事? 又是怎么把Hotair研究出新意?
前列腺癌的发生发展和雄激素密切相关,当激素疗法(减少雄激素)治疗一段时间后,前列腺癌会表现出雄激素不依赖性,类似于肿瘤的耐药。 作者就想探究低剂量的雄激素激活雄性激素受体(AR)的机制。文章归纳起来就是下面这张模式图。 低剂量雄激素下,Hotair表达上调,其和AR结合激活了AR,促进了AR的转录调控活性,导致了前列腺癌的发生发展。 这里涉及到的几个问题也是我们自己研究中面临的: 1、 怎么选出Hotair作为研究的对象? Hotair和AR有啥关系? 这种研究对象的选择,一般就是用测序或者芯片的方法筛差异表达的分子。再用实验看看差异表达分子是否真的和实验因素具有相关性。具体呢?见课程视频。 这里王刚老师给经常找不到实验思路的小伙伴支了一招,那就是“捡漏” ,多看CNS,捡点人家课题中没有深入研究的点,再照着他的思路做,发个3、4分文章也是可能的。
2、 证明有关系之后,探究更深层次的,AR和Hotair是如何相互作用的? 探究RNA和蛋白相互作用关系用的是经典的截断体实验,这也是发高份lncRNA文章必须做的实验。实验证明AR和Hotair是直接结合相互作用的。 3、 那具体的调控机制如何? 做机制,通常的做法就是过表达。在这里有个很有意思的现象,Hotair过表达后,发现AR的mRNA表达量没有任何的影响,实验不符合预期,自己候遇到这种情况肯定蒙圈了。 但作者不是,而是顺着事实进一步进行推测,那mRNA没有发生变化,那我就推测蛋白质的半衰期发生了变化。事实证明,确实如此。 最后关于Hotair如何提高AR的转录活性,就留给大家自己了,答案见视频。
还有很重要的一个问题,就是刚开始提出的,这个课题如何研究出了新意?我说见视频,会不会想扔小编一打白菜鸡蛋。 Tips: LncRNA和DNA甲基化和染色体有密切的关系,是比较好的结合热点,比较好发文章和项目申请。2016年国自然中Hotair中了非常多的项目。 归纳总结一下标书中hotair的思路分析,下面是现在比较热门的几个方向: 视频中还有lncRNA经典大牛推荐,搞科研,就是要站在巨人的肩膀上 …… |
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