LncRNA与癌症：最全LncRNA明星分子总结

除了编码蛋白基因的突变或异常表达，ncRNAs特别是LncRNAs的突变和异常表达，在癌症中也扮演了重要角色。通过肿瘤样本的全基因组关联研究发现了大量的与各种类型癌症相关的LncRNAs。

LncRNA研究主要是两种模式，一种是通过测序寻找差异表达的LncRNA，一种是选择明星LncRNA分子。

德克萨斯大学基因调控与表观遗传学研究实验室的Arunoday Bhan等人不久前在Cancer Research杂志发表题为“Long Noncoding RNA and Cancer:A New Paradigm”的综述文章（图1），总结统计了前列腺癌、乳腺癌、肺癌、肝癌、胰腺癌、肾脏癌、结直肠癌、脑水肿、白血病、胃癌、卵巢癌、膀胱癌等12种癌症中的相关LncRNA。

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图1

Introduction

癌症是一类与多种基因突变有关的复杂疾病，包括表观遗传改变、染色体易位、缺失和增加等。ncRNAs是由基因组编码，但大多不被翻译成蛋白质。虽然没有翻译，但ncRNAs在多种细胞中有至关重要的生理功能，特别是LncRNA，在的调节染色质、基因表达、生长、分化和发育中有关键作用。超过75%的人类基因组是功能性的，并编码了大量的ncRNAs。估计人类基因组编码了超过28000个不同的LncRNAs，还有许多有待发现。了解这么多LncRNAs和它们的详细的表征功能是一项具有挑战性的任务，近几年通过高通量测序，在各种癌症中发现了成千上万的LncRNAs的异常表达或突变。

除了传统的ncRNA，环状RNAs（circRNA）也是一种新的内源性ncRNAs，形成一种共价闭合的环状结构。circRNAs具有物种保守性，被认为与多种重要的生物过程和包括癌症在内的人类疾病相关。circRNAs作为miRNA海绵，参与mRNA剪接、转录调控、基因表达等。一般来说，环状RNA具有分为外显子环状RNA、内含子环状RNA和外显子-内含子环状RNA。它们可能来自外显子、内含子、未翻译区域、反义转录本和基因间区域。circRNAs在多种癌症中异常表达，具有很强的潜力成为新的生物标志物和癌症治疗靶点。

总结的与这12种癌症相关的LncRNA如下图。

图2

脑肿瘤：H19，CRNDE，ADAMTS9-AS2，DISC2，MALAT1，POU3F3，MEG3, CASC2，TSLC1-AS1

白血病：CRNDE，HOTAIRM1，DLEU1，DLEU2，LUNAR1，BGL3，CCDC26，XIST，NEAT1，UCA1

肺癌：MALAT1，NEAT1，SPRY4-IT1，ANRIL，HNF1A-AS，UCA1，HOTAIR，GAS5，MEG3，CCAT1，MVIH，BANCR，PANDAR，EVADR，PVT1，H19，SOX2-OT

肝癌：HULC，Linc00152，HEIH，HOTTIP，HOTAIR，MALAT1，DILC，ZFAS1，MEG3，PRAL，LALR1，LET，MVIH，PCNA-AS，TUC338，UC001NCR

胰腺癌：H19，HOTAIR，HOTTIP，MALAT，GAS5，HULC，PVT1，LincRNA-RoR，AF339813，ENST00000480739，AFAP1-AS

肾脏癌：PVT1，LET, PANDAR，PTENP1，HOTAIR，NBAT1，LINC00963，MALAT1，SPRY4-T1，KCNQ1OT1，GAS5，RCCRT1，HIF1A-AS

结直肠癌：CCAT1，CCAT2，CCAT1-L，CRNDE,E2F4，HOTAIR，HULC，MALAT1，H19,FER1L4，TENP1，KCNQ1OT1，T-UCRs，UCA1

乳腺癌：HOTAIR，ANRIL，DANCR，NEAT1，HIF1A-AS，ZFAS1，XIST，HOTAIRM1，TOPORS-AS1，LSINCT-5

胃癌：UCA1，H19，GHET1，CCAT1，LINC00152，LSINCT-5，PTENP1，TUG1，HOTAIR，PVT1，GAS5，AA174084，GACAT2，FER1L4

卵巢癌：H19，LSINCT-5，XIST，HOST2，NEAT1，HOTAIR，PVT1，CDKN2BAS，CCAT2，BC200

膀胱癌：UCA1，UCA1a，HOXD-AS1，TUG1，ncRAN，H19，MALAT1，GHET1，lincRNA-p21，MEG3，SPRY4-IT1，linc-UBC1

前列腺癌：PCAT1，PCAT6，PCAT18，PCA3，PCGEM1，MALAT1，PVT1，LincRNA-p21，PRNCR1，CTBP1-AS，TRPM2，SCHLAP1