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是时候拿出神器了!——如何搜索某一分子涉及的信号通路

 海陵岛的鱼 2017-05-16

神器在手,天下我有!

    小黑所在的实验室主要研究蛋白泛素降解。

    这一天老板对小黑说,上次布置给你的给大家讲讲蛋白泛素系统任务,明天讲下,一定要简要,但也要全面,10分钟左右。

    收到通知后,小黑如坐针毡,因为小黑以为上次老板只是说说而已。小黑暗自思忖:离明天汇报还剩16个小时38分钟,今天晚上就不睡了,用1个小时来搜索文献,15个小时看15篇文献,38分钟来做PPT。

    小黑立即在PUBMED上面输入 “ubiquitin”:



    如果是一个新手,5万多篇的文献肯定会感到绝望无助。但是小黑是什么人啊,小黑就是掌握着实验高科技的人,他对PUBMED搜索了如指掌。


1小时后:

小黑下载了20篇文献,超出预期目标5篇,超额33%完成了预订目标。

2小时后:

小黑看完了第一篇文献,圆满完成预期目标。

3小时后

小黑第二篇文献还差一节。

4小时后

小黑第二篇刚看完。

5小时候

小黑睡着了….

一觉醒来,距离汇报2小时,

“没事,我觉得我还可以再看一篇”


距离汇报还剩1小时,

小黑看完的文献在脑海中揉成了一团浆糊,


怎么办?

一世英名就要毁于一旦?

在师妹们新中伟岸的形象就要完蛋?


是时候亮出神器了

KEGG Pathway

不论你做的课题是蛋白泛素系统



还是病毒与肿瘤:


都能找到相关的信号通路总结。

实在是居家旅行,实验撩妹,必备工具


KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)是系统分析基因功能、基因组信息数据库,它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。基因组信息存储在GENES数据库 里,包括完整和部分测序的基因组序列;更高级的功能信息存储在PATHWAY数据库里,包括图解的细胞生化过程如代谢、膜转运、信号传递、细胞周期,还包 括同系保守的子通路等信息。


这个神器究竟在哪里?在下面:

http://www./kegg/pathway.html


下面截取一些信号通路列表:


赶快去看看你研究的分子和谁有瓜葛吧!


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