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全长转录组-公开的

 海陵岛的鱼 2017-08-09

目前以Pacbio为检索词,在NCBI中共检索到下面物种具有全长转录组数据,因而依靠这些数据我么可以干这些事:

1.某个特定基因全长序列的获得,不用再用RACE实验获取了,简单省事.

2.可变剪接的获得.比起二代将会更加直接.

3.基因模型优化.不用再害怕这个基因预测不准了,直截了当.



ScientificName中文名字
Aedes aegypti埃及伊蚊
Amborella trichopoda无油樟
Arabidopsis thaliana拟南芥
Archilochus colubris拟南芥
Beta vulgaris subsp. vulgaris甜菜
Bos taurus
Chenopodium quinoa藜麦
Dipteryx oleifera香豆油茶
Fragaria vesca野草莓
Gadus morhua大西洋鳕
Gallus gallus原鸡
Gossypium barbadense海岛棉
Hepatitis C virus丙型肝炎病毒
HIV-1 M:B_89.6
Homo sapiens智人
Hordeum vulgare大麦
Human alphaherpesvirus 1人类疱疹病毒1
Human herpesvirus 1 strain KOS人类疱疹病毒1型菌株KOS
Human immunodeficiency virus 1人免疫缺陷病毒1型;
Influenza A virus甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-681-V10/2009(H1N1))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-681-V32/2009(H1N1))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-720-V10/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-720-V21/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-734-V10/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-734-V32/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-742-V10/2009(H1N1))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-742-V33/2009(H1N1))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-763-V10/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-763-V23/2009(H3N2))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-779-V10/2009(H1N1))甲型流感病毒
Influenza A virus (A/Hong Kong/H090-779-V21/2009(H1N1))甲型流感病毒
Lagenidium giganteum大链壶菌
Mus musculus小家鼠
Nepenthes ampullaria苹果猪笼草
Nepenthes rafflesiana莱佛士猪笼草
Nepenthes x hookeriana双色虎克猪笼草
Notothenia coriiceps革首南极鱼 
Oryza sativa Japonica Group粳稻
Panax ginseng人参
Phyllostachys edulis毛竹
Pinus lambertiana糖松
Plicaturopsis crispa皱褶革菌
Propithecus coquereli智人
Pyropia haitanensis坛紫菜
Rattus norvegicus褐家鼠
Rosellinia necatrix白纹羽病
Saccharomyces cerevisiae酿酒酵母
Saccharum hybrid cultivar甘蔗杂交品种
Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhimurium沙门氏菌亚种,鼠伤寒沙门氏菌
Salvia miltiorrhiza丹参
Schizosaccharomyces pombe粟酒裂殖酵母
Sorghum bicolor高粱
Suid herpesvirus 1 strain Kaplan猪疱疹病毒
Sus scrofa野猪
Triticum aestivum面包小麦
Zaire ebolavirus扎伊尔埃博拉病毒
Zea mays玉米

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