从疾病、定位和机制角度研究ncRNA，怎么没早发现这三个网站？！

今天来介绍三个好用的工具，分别帮我们解决三个关键问题：

1. 从疾病到ncRNA；

2. 查询ncRNA的细胞定位；

3. 查询RNA-RNA以及RNA-蛋白等互作模式。

1. 非编码RNA与疾病的数据库：MNDR v2.0

网址：http://www./mndr/index.html

我们可以查询非编码RNA和疾病的关系，根据疾病、非编码RNA和物种浏览：

比如ALL：

就可以直接看到相关的非编码RNA：

也可以下载后查看。

2. 查询ncRNA的细胞定位: RNALocate

网址：http://www./rnalocate/index.html

可搜索可浏览，比如搜索功能：

以lncRNA malat1为例搜索：

这里展示了MALAT1在各不同的组织里面的定位，还有细节信息，比如：

其中的sequence序列和network功能非常好用：

浏览功能同样强大，可根据定位、物种和RNA类型进行:

比如外泌体：

3. 查询RNA-RNA以及RNA-蛋白等互作模式：RAID v2.0

网址：http://www./raid/index.html

同样搜索和浏览功能都很强大，比如浏览功能查看与lncRNA MALAT1作用的分子：

结果里面既有microRNA，又有蛋白：

并可以分别查看与microRNA和蛋白的结合序列：

MALAT1与hsa-miR-9-5p：

MALAT1与EZH2：

当然，浏览功能也很强大，根据作用类型、检测方法和物种都可以：

比如大家感兴趣的circRNA与microRNA结合：

lncRNA与蛋白/microRNA的结合：

根据实验手段和物种浏览我们就不介绍了：

ref：

1. MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals.Nucleic Acids Res. 2017 Nov 2.

2. RNALocate: a resource for RNA subcellular localizations.Nucleic Acids Res. 2017 Jan 4;45(D1):D135-D138.

3. RAID v2.0: an updated resource of RNA-associated interactions across organisms.Nucleic Acids Res. 2017 Jan 4;45(D1):D115-D118.