引物数据库qPrimerDB ＋ 内参基因知识库ICG | 实时定量PCR

10月14日，我们曾经介绍过一个实时定量PCR的内参基因知识库。

文章链接如下：

实时定量PCR内参基因知识库ICG

论文题目：

ICG: a wiki-driven knowledgebase of internal control genes for RT-qPCR normalization

发表期刊：Nucleic Acids Research

数据库网址：http://icg./

研究团队：中科院北京基因组生命与健康大数据中心章张研究团队

今天，补充一个引物数据库：

定量PCR引物数据库qPrimerDB

论文题目：

qPrimerDB: a thermodynamics-based gene-specific qPCR primer database for 147 organisms 

发表期刊：Nucleic Acids Research

数据库网址：

http://biodb./qprimerdb/

研究团队： 西南大学农学与生物科技学院李加纳教授团队

 147个物种，5100＋万引物 

该数据库包含人、小鼠、家蚕、斑马鱼、线虫、酵母、拟南芥、水稻、玉米和油菜等147个物种的全基因组qPCR引物设计和验证分析，包含80种动物（37种哺乳动物、17种昆虫、10种鱼类、4种鸟类和12种其他动物）、66种植物（39种双子叶植物、18种单子叶植物和9种其他植物）和1种真菌（酵母）。

基于这些数据，构建了qPrimerDB数据库，收录了147个物种共3331426个基因的51091785对qPCR引物，提供了查询、批量下载和BLAST比对等工具，并定期更新。

/End.