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在16S分析结果中物种柱状图占有十分重要的地位，不仅可以直观的看到各个样本物种的组成及比例，还可以看到样本间物种的变化情况，是一类十分实用的图表。 单样本饼图是一类可以反应单个样本中物种分布及比例的图表，可以直观反映样本物种组成，也是一类简单、实用的图表。 今天跟踪小编一起来学习一下物种柱状图和单样本饼图的绘制。所用的工具为最常见的excel表格，这样大家学习起来会更加简单、便捷。 一. 物种柱状图绘制步骤 1.数据来源 在高通量测序完成后会有一个结果（summary文件）文件，以其中6_taxonomy_community/2_Phylum/1_abundance_stats/all/Phylum_count.xls为例，即是门水平所有样本及物种的丰度信息；其他数据表格雷同处理即可： 2.数据处理：相对丰度计算及删选 （1）各物种在各个样本中的相对丰度计算： 第一步：求和，如下图红色方框所示。 第二步：计算相对丰度，每个物种在各个样本中的表达量 / 该物种序列总和。如下图箭头所示： 若是其他水平（科属种）时，物种种类可能很多，此时若是将所有物种均在图上展示结果会不太美观，一般来说选取丰度前20的物种进行绘图展示比较合适，联川生物提供的测序结果已经是按照丰度从高到低进行排序了，筛选时可以直接选取前20行，将其余物种的各个样本中丰度进行相加，合并为others大类即可。 3.作图 选中作图数据区域，选择excel中的“插入”功能，选择插入“柱状图”，即可得到一个柱状图： 4.图形调整及保存 得到图形后，可以点击图片空白处、图片中柱形图以及坐标轴等位置，将会在表格右侧出现如下所示的调整窗口，可以根据自己的需求对坐标轴格式，坐标轴文字大小及倾斜度，表格标题文字大小及颜色，图表柱形图颜色及宽度等进行修改及、调整： 最后调整完成后，鼠标右击选择保存为图片即可。 二. 单样本饼图绘制步骤 操作步骤与上面柱状图类似，使用上述筛选过的数据，选择如下图红框中数据，点击“插入”功能，选择插入“饼图”，即可得到一个单样本饼图，其他样本以此类推。 修改及保存步骤与上面柱状图类似，根据需求改完成后保存即可。
今天的分析技能讲解就到这里了~ /End. |
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