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跨过3分的坎儿,让2018年火起来!

 解螺旋 2020-08-27

          

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在素来等级分明的SCI文章世界中,5个法宝(细胞增殖、凋亡、迁移、浸润和周期)搭配1条常见通路,才堪堪跨过1-2分这个入门级别的坎儿(详情请看《天冷了,抱着1-2分SCI套路暖脚可好》)。

可如今对1-2分文章已经信手拈来的童鞋们,自然不会只满足于此,更是心心念念地想着冲破2-3分的大关,那么又该如何改造文章使其一举跃过3分这个临界线呢?小编千辛万苦寻找了一篇火热的lncRNA的文献研究,以实际内容为例,告诉大家3分文章到手也没有辣么难。

文章题目:《Long noncoding RNA HNF1A-AS1 indicates a poor prognosis of colorectal cancer and promotes carcinogenesis via activation of the Wnt/β-catenin signaling pathway》,这是一篇2017年刚发表在Biomedicine & Pharmacotherapy 杂志上的文章,IF=2.90,文章的概要是做一个LncRNA 如何成功成为一个结肠癌的预后标记物,并且做了一个常见的Wnt/β-catenin信号转导通路。那赶快跟着小编来看一看,怎样做能发到2-3分。

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Lnc HNF1A-AS1在人结肠癌组织中高表达 ,并且与肿瘤组织的大小和分期相关

1.作者首先采用RT-qPCR技术分别检测在142 个结肠癌组织和癌旁组织中HNF1A-AS1的表达量。结果显示:与癌旁组织相比,HNF1A-AS1的表达量在癌组织中是显著增高的。

这一步是常规筛选,几乎做肿瘤标记物的文章都会用到RT-qPCR实验来筛查目标基因。

2.作者更深一步检测了在正常结肠上皮细胞和6种结肠癌细胞(CRC)中的表达量,结果显示:与正常细胞相比,lncRNA基因HNF1A-AS1的表达量在6中细胞系中是升高的。

在1-2分的文章中往往只证明一种正常对照和一种癌细胞,而在该篇文章中验证了6种细胞系,足以证明该LncRNA在CRC中普遍增高的表达性。

3.作者继续分析该lncRNA在结肠癌组织中的表达与肿瘤组织的大小和分期的关系,结果表明:结肠癌组织越大的lncRNA表达量越高,而癌TNM分期程度越深,lncRNA的表达量也越高。

以上这些数据都充分证明,HNF1A-AS1在人结肠癌中是致癌基因参与到人结肠癌病理形成。

2

高表达的LncRNA HNF1A-AS1预示着结肠癌差的预后并且具有一定的诊断价值

1.采用生存分析Kaplan–Meier曲线和log-rank检验分析HNF1A-AS1和结肠癌病人的预后之间的关系。

结果表明:HNF1A-AS1表达水平越高总生存率越低,无病生存率越低。

备注:无病存活率 (DFS)就是指无病存活的比率。某人得癌症 接受治疗后 继续生存了5年 ,其中 前3年没有发过病,那么这5年 就称为实际存活, 没有发病的3年 称之为无病存活。

2.而后又检测了HNF1A-AS1是否具有诊断价值,采用了ROC曲线进行敏感性和特异性分析,结果显示:HNF1A-AS1的表达能够从非肿瘤组织和肿瘤组织中区分,具有一定的诊断价值。

综合以上结果表明:HNF1A-AS1很可能参与了结肠癌病人的预后和诊断。

3

在CRC细胞系中沉默HNF1A-AS1后,减少了CRC细胞的增殖

1.在HCT-116 和 SW620细胞中,沉默HNF1A-AS1后,利用qPCR技术检测HNF1A-AS1的表达水平,结果显示与对照组相比HNF1A-AS1的表达水平显著下降。

2.采用MTS技术检测沉默HNF1A-AS1后,HCT-116和SW620细胞的增殖情况,结果发现沉默HNF1A-AS1后,HCT-116和SW620细胞的增殖明显被抑制。

3.克隆形成实验结果表明沉默HNF1A-AS1后,减少了HCT-116和SW620细胞的克隆活性。

4.细胞周期实验结果显示沉默HNF1A-AS1后,余干扰对照相比,两种细胞都停滞在G0/G1期,G0/G1期扩大,而S期和G2期减少。

以上4个实验充分证明了沉默或者是干扰HNF1A-AS1后减少了CRC细胞增殖。而我们在1-2分的文章中,看到了证明增殖的实验只是单一的CCK8或者MTT,这里近3分的文章用了4种方法而且是在2种细胞系中研究。

4

沉默HNF1A-AS1后,抑制了CRC细胞的浸润和迁移

Transwel实验检测沉默HNF1A-AS1后对CRC细胞浸润能力的影响,结果显示:与干扰对照组相比,HCT-116和SW620细胞的浸润和迁移能力均受到阻滞。

5

沉默HNF1A-AS1,抑制Wnt/β-catenin信号通路可抑制结肠癌细胞的增殖、迁移和浸润

1.作者用PCR水平技术检测β-catenin, c-myc 和 cyclin D1的mRNA表达水平,结果发现与干扰对照组相比β-catenin, c-myc 和 cyclin D1的表达水平下降。

2.作者用WB水平技术检测β-catenin, c-myc 和 cyclin D1的蛋白表达水平,结果发现与干扰对照组相比β-catenin, c-myc 和 cyclin D1的表达水平下降。

以上2-3分的文章已经讲完了,我给大家留一个思考题,作者做了6个结肠癌细胞系,为什么只选HCT-116和SW620两种细胞系继续深一步做实验呢?读完文章相信一定有同学知道升级到3-4分的文章切口在哪里了?那我们下期再见喽!

。。。。。。还没有走远

这里我给大家科普了一个经典的Wnt/β-catenin信号通路图,同学们有看到升级的入口吗?

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