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绝对精确地修饰人类基因组中的单个DNA碱基,日本开发新型基因组编辑技术

 萌小芊 2018-03-07

来自日本的研究人员报告了一种新的基因编辑方法,可以绝对精确地修饰人类基因组中的单个DNA碱基。


相关论文3月5日发表在Nature Communications上,其独特之处在于它通过设计引导细胞自身的修复机制,用于提供携带疾病相关突变遗传信息的细胞。


点击文末的阅读原文,查看论文全文


DNA中的单个突变(称为单核苷酸多态性,简称SNPs)是人类基因组中最常见的变异类型。已知有超过1000万个SNP,其中许多与阿尔茨海默病,心脏病和糖尿病等疾病有关。


为了解SNP在遗传性疾病中的作用,京都大学iPS细胞研究与应用中心(CiRA)的科学家们从患者供体中制造了诱导性多能干细胞。



iPS细胞保留了供体的基因组成,并可以转化为体内任何细胞类型。通过这种方式,可以在实验室中创建和观察来自诸如脑,心脏或胰腺等组织的细胞,从而在开始临床试验之前对新的疾病治疗进行安全测试。


证明单核苷酸多态性导致疾病需要与遗传匹配或同基因的iPS细胞进行非常严格的比较。理想的细胞是被描述为同基因“双胞胎”( isogenic “twins”);其基因组只有一个SNP不同的细胞。


然而,研究人员称,“通常我们需要添加抗生素耐药基因以克服转化效率低的问题。然而就是这一步骤,又增加了对基因组的改变,因此我们也需要一种方法来消除这一影响。”



为此,Knut Woltjen实验室开发了一种新的基因组编辑技术。


插入SNP修饰以及荧光报告基因,该基因充当检测修饰细胞的信号。另外,他们还在报告基因的左侧和右侧设计了一个短的重复DNA序列,称为microhomology,以及CRISPR(切割DNA的酶)的独特靶位点。


这些特征使研究人员能够利用细胞内的内源性DNA修复系统,称为微同源性介导末端连接( microhomology-mediated end joining ,MMEJ),以精确去除报告基因。 MMEJ去除荧光报道基因,仅留下修饰的SNP。通过将突变SNP安排在一种 microhomology 中,并将正常SNP安排在另一种中,从而有效地产生了等基因双胞胎。


该实验室已经开始运用他们的方法来进行疾病研究,他们与日本和加拿大的研究人员合作,正在调查青少年患者严重糖尿病的遗传病因。


/End.

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