全世界的 miRNA分析工具都在这里 | 平行对比多个工具的靶基因预测结果 原帖发布于嘉因公众号 如果评选年度最佳生物信息网站,我就选tools4miRs! 来自伟大的波兰,居里夫人的祖国!纪念居里夫人诞辰150周年。 延伸阅读:居里夫人诞辰150周年 | 重温饶毅《光荣背后的辛酸》——科研春秋,《知识分子》旗下的科学史平台。 这是去年发表在Bioinformatics上的一个工具,Tools4miRs,https:///,目前已收录了200个miRNA分析工具。有高通量测序数据的分析工具,也有单个序列的分析工具。 包括数据库、测序数据分析、All-In-One工具、7类software,还提供多个工具平行预测靶基因功能。 其中,7类software包括: 鉴定已知miRNA 鉴定isomiRs 分析新的miRNA/Precursor 差异表达分析 靶基因预测 靶基因功能分析 miRNA的SNP分析 以靶基因预测为例,有以下工具。列出了在线还是本地、适用的物种、算法特点、是否要求高通量测序数据作为输入、带不带靶基因功能富集分析功能、参考文献。 References列有该工具Homepage链接、paper网页链接、Pubmed引用链接。真是人性化啊!如果能按参考文献的年代排序就做到了极致。 |
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