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对于研究miRNA的小伙伴来说，谁人不知miRBase呢？作为最著名的miRNA数据库之一，它给我们的研究带来了极大的便利！然而和大部分公共数据库一样，它上一次更新还是在2014年，数据的落后使得数据库的准确度和覆盖度都大大折扣，如今，沉寂了近四年的miRBase 更新终于来了。 让我们看看它给我们带来了什么惊喜呢？快来了解一下！ miRBase序列数据库 (www.mirbase.org)，为研究者免费提供miRNA序列注释、预测基因靶标等信息，是关于miRNA全方位数据的一个重要的公共数据库。库中所有数据都可以 从首页downloas page或直接进入FTP站点下载。 So, what is new in miRBase 22 ? 序列数目增加了三分之一！ 正如研究者所期盼的，这次miRBase 22所收录的miRNA序列数量大增——超过了原本的三分之一！增加的这部分主要来自于之前数据库中没有的物种的新miRNA注释。具体地说，这次发布的版本新收录的物种达到了48个。尽管如此，miRBase发言人Sam认为他们仍然疏漏了部分已发表的miRNA注释，并表明会更加努力查缺补漏，更勤快地更新数据库。 深度测序数据集的收录和管理方法优化 在这次的新版本中，深度测序数据集的数目跃升为831个。miRBase现在拥有约1,000多个数据集，之前遇到的数据库技术问题以及网页的速度问题，都已经得到修复，使浏览数据时体验变得更好。更新后，希望数据库中越来越多的miRNA可被归类为“高可信度” (high condifence) 。 可跟踪查看miRNA序列的新变化 miRBase 22使用了新研发的接口，可一直保持跟踪miRBase的变化更新，点击'change log'链接即可进入查看。除了上述的更新亮点，miRBase还即将推出收集序列信息的网页程序化服务。 相信miRBase 22的发布，能够给miRNA研究者带来更多的帮助和便利。 致敬作者，转载只为分享，如有侵权请联系删除 来源：表观生物（ID：epibiotek） |
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