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最近在做分子克隆，但是我感觉还是缺少一个分子生物学趁手的兵器，不，是软件。Vector NTI感觉好复杂。就在这里给你做一个分子生物学软件的简单测评哈。 首先是Invitrogen的Vector NTI，说实话Vector NTI是一款很强大的软件，分子生物学研究的话，用这个其实是个不错的选择。但是，下面这个是界面哈： 界面很老旧，机械感很强。可以导入文件，可以兼容'.gb'之类的序列文件。也有Invitrogen的质粒序列库可供选择，质粒方面，其实还是很丰富的。不过如果这个质粒序列是你自己加进去的话，导入序列后，无法直接产生序列中所有的信息，比如抗性位点之类的内容，但是会有酶切位点。导入质粒和序列片段后，构建的界面是这样的： 选择质粒和片段的酶切位置，然后酶切，添加，点击克隆。输入构建的名字。 最终结果就是这样： 总的来说，Vector NTI，不是很人性化，功能虽然多（包括序列比对，BLAST，引物设计，片段拼接等等功能），但是你要认认真真学好了说明书才能真正上手，否则就基本是一脸懵逼。呃，还有一点，就是这软件是收费的，要用的话，需要破解。 第二个上场的是，拥有洪荒之力的Snapgene。这个我也是搜了半天才搜到了破解版，因为，这也是要钱的软件。 Snapgene的界面就比Vector NTI好看很多，简直就是清新脱俗的美少女。而且直接bia进去质粒的序列，就会标注出整个质粒中的各种信息。 插入序列也是一样，可以选择Import，一个NCBI的基因番号，然后就直接导入基因了…… 接着是设计引物，首先吧基因的序列变成Sequence，然后复制一段。复制的过程中，直接可以显示Tm值。
接着点击“Add primer”添加引物。
把刚才选择的序列贴进去后，选择要加的酶切位点。
接着在5'端插入。
点击PCR，会形成一个这对引物扩增的产物序列，这个是我们后面要用的。 在质粒的界面，选择插入片段。
然后按照要求，一步步添加，然后酶切，就能完成克隆了。
最后会生成一个History，简直不能更贴心。但是，这步骤其实还是挺复杂的，虽然界面简单了很多，但是没有看过说明书的我，还是自己摸索了半天。当然Snapgene一样有Vector的很多功能，但是界面清新简洁了很多，更容易上手。 接着测试的是我之前讲过的Genome Compiler，这跟Snapgene比起来，就是外面的那些妖艳贱货。因为……Genome Compiler……不……要……钱。而且，请感受一下界面：
小清新的界面，是Snapgene和Vector NTI没法比的，而且只要注册，不要钱，所以根本不用破解版，还能不停更新。而且商业用邮箱也能注册哦，比很多只能用非商业邮箱的要亲民很多。当然大家关心的是，这货有没有Mac版，呃，我只能说虽然我没试过Mac，但是有一点我能肯定的是，你的Mac如果能打开网页的话，就能用。因为这个除了线下软件，还有一个网页版。（线下的要先装一个Adobe Air才能打开安装包哈）重要的是，这货兼容几乎所有的分子克隆软件生成的文件（Snapgene只能兼容Vector NTI和“.gb”之类的文件）
接着是构建，与其说是按照步骤来，其实就是傻瓜式的操作。然后很烦人的一点就是，你刚打开这个软件的时候，会一直不停地出现按钮教程，真的稍微懂点英语就会用的节奏。
引物设计不需要像Snapgene一样分成好几步，都是在整个过程中按步骤添加的，可以自动也能手动，还有引物库……
添加酶切位点也是用弹出框解决的。
当然，除了界面好看，功能基本也都齐全。
好多人喜欢清新脱俗的Snapgene，但是我只喜欢妖艳贱货Genome Compiler，因为不要钱……总结一下：
好吧，希望这个测评对大家有辣么一点帮助哈。其他两个破解版自己去找哈，Genome Compiler就直接去人家网页上就行了（https://designer./），注意了，这不是广告，也不知道这是啥公司出的。你们自己慢慢玩吧。好了，今天就策到这里了。
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