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分子生物学作为一门从分子水平研究生物大分子的结构与功能从而阐明生命现象本质的科学，对于DNA、RNA和蛋白质的各种生物学信息处理已经成为了实验的必要过程，比如进行限制性酶切位点分析、引物设计、序列比对、序列作图、结构域查找等诸多实验内容，要想进行这些实验内容均需要用专业的生物信息学软件进行处理，今天给大家介绍的是一款强大的生物信息学软件——SnapGene。 SnapGene是一款强大的生物学软件，在中国生物学界内已经成为了最受欢迎的分子克隆工具之一，它拥有13大类75种功能，几乎涵盖了生物学信息需要处理的各项实验内容，SnapGene不仅有丰富的信息窗口来模拟PCR或者克隆等试验方法，，还能可视化试验流程，可以让操作者清晰的看到各项步骤是如何组合的，并且还能自动记录工作步骤，自动归档文本，让操作者节省更多的时间完成信息处理。 我们用pCT74质粒打开这个中文版的软件，可以看到以下这个pCT74质粒“图谱”视图，整个质粒都用图谱的方式展现，可以让操作者看到质粒包含的基因，酶切位点还有片段长度，一目了然。 点击“序列”，就能够看到质粒的TCAG序列信息，该序列直接包含了质粒中每个基因的正向序列和反向序列，可以在这里进行序列信息处理。 在序列视图中选择添加“特征”，可以对选中的片段序列进行命名，类型选择和颜色分裂等等，对序列信息有更好的了解。 点击“酶”，可以看到质粒的酶切位点汇总信息，可以进行酶切位点分析。 点击“特征”，可以看到质粒的各个片段的特点，比如长度、翻译信息，编码区，在整个质粒中的位置等等，同时还可以进行特征切割，添加删除等。 点击“引物”，“添加引物”，则可以对质粒进行上下游引物设计，还能够随时的进行酶切位点添加，酶切活性判断以及双酶切位点距离的远近判断，方便快捷设计引物。 SnapGene还有一个强大的功能，就是可视化模拟实验方法，点击“行动”“限制和插入片段模拟”，选择好载体和插入片段。选择酶切位点进行酶切，则可以进行克隆模拟，如果模拟成功，产物会显示一个完整的闭环，如果不成功，产物会显示操作者修饰片段让片段末端变得黏性。 点击“工具”“模拟琼脂糖凝胶”，可以将克隆成功的片段进行模拟电泳，点击“MV”可以选择不同的MAKER，其中那个1、2、3……，分别为不同的泳道，可以选择不同的酶切位点，进行不同泳道的模拟。 以第一泳道为例，酶切位点选择BsaBI和KpnI，进行模拟电泳，得到如下结果，有助于我们对实验预期结果的解读。 SnapGene除了上述这些功能，还有很多强大的功能等待使用者们挖掘，要想走得快，拥有去强大的工具是必须的，也许SnapGene就是你想要的利器，不妨用起来吧。 |
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