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免费领取植物非生物胁迫转录组文献包 | 120篇转录组学、转录组学+其他组学在植物响应非生物胁迫的分子机制方面的文章(下)为了方便各位小伙伴们研读,我们同时也整理了这120篇文章对应的pdf文档,本期给大家分享的是植物非生物胁迫转录组文献包120篇(下)——60篇转录组学、转录组学+其他组学在植物响应非生物胁迫的分子机制方面的文章。如果...
随着转录组技术的成熟,越来越多的科研人员想要学习转录组数据分析进行科研实验,因此写下转录组常规数据分析教程,以供参考,该教程将用Linux和R语言的方法以研究最为完善的人类基因为分析数据用多篇合集的形式展现。作为转录组教程的第一集,本篇将介绍转录组数据分析常规流程所需要的资源和大概流程,让大家对于转录组数据分析有一个具体的...
首先我们将FPD1基因的登录号EU334871.1在NCBI数据库上进行搜索,找到FPD1基因的序列,在FPD1基因中,我们可以看到FPD1基因是complete cds,基因全长为1013 bp, 含有一个47 bp的内含子,编码序列长度为966 bp,这是我们需要的看的数据,这些数据对于我们进行与其他物种的同源性比较都很有帮助。用生物学软件snapgene打开FPD1全基因序列和FPD1基因...
又一款超强生物学软件——SnapGene,用它就对了!分子生物学作为一门从分子水平研究生物大分子的结构与功能从而阐明生命现象本质的科学,对于DNA、RNA和蛋白质的各种生物学信息处理已经成为了实验的必要过程,比如进行限制性酶切位点分析、引物设计、序列比对、序列作图、结构域查找等诸多实验内容,要想进行这些实验内容均需要用专业的生物信...
共有52个与氮转运和代谢有关的基因在缺氮组和富氮组中有差异表达,这53个氮响应基因中,有20个编码铵转运蛋白(AMT),其中16个在缺氮条件下表达上调,其余4个在缺氮条件下表达下调。这些基因包括8个编码光系统II蛋白的基因、3个编码光系统I蛋白的基因、4个编码叶绿体ATP合成酶的基因、1个编码铁氧还蛋白的基因、1个编码细胞色素b6-f复合铁硫亚单...
病例组和对照组女性数据的缺乏为描述以下差异表达模式提出了重大挑战:1)男性和女性ASD病例之间的差异表达模式,如已观察到的重度抑郁障碍(23,24)和创伤后应激障碍(25),2)女性病例和对照组之间的差异表达模式,以确定女性ASD大脑如何偏离性别特异性预期,以及3)通过诊断确定性别相互作用效应,其中ASD转录组的变化在性别之间的影响幅度或方向...
科研│BMC Biology:整合组学揭示了基生鞭毛藻的次级代谢图谱。鞭毛藻的基因组异常巨大,为了克服这一挑战,研究人员首次对基生鞭毛藻的基因组、microRNAs和mRNA进行了测序,并采用整合组学方法来理解其次生代谢物的生物合成。研究人员组装了约6.4-Gb的鞭毛藻基因组,通过解码的鞭毛藻基因组和转录组,研究人员确定了非核糖体肽合成酶腺苷酸化...
科研│东北农业大学:基于全转录组miRNA-mRNA网络分析揭示了镉致鲤鱼脾脏炎症免疫抑制损伤的机制 (国人佳作)KEGG和GO分析表明5条通路(NF-κB信号通路、JAK-STAT信号通路、MAPK信号通路、Th1型和Th2型细胞分化通路、Toll样受体信号通路)和7 GO项(免疫系统过程负调节、T细胞介导的免疫、免疫反应调节、炎症反应调节、炎症反应正调节、炎症反应...
研究者联合分析WT和r突变果实之间的DMR与DE lncRNA,结果表明它们的特定变化与乙烯和类胡萝卜素途径有关,例如MSTRG.59396.1(靶标ACO2和ERF7),MSTRG.69293.1(靶标 ERF‐RAP2‐12),MSTRG.162893.1(靶标NSY),MSTRG.116865.5(靶标LCY),MSTRG.95226.7(靶标PSY1),miR172a(靶标AP2‐TOE3),miR5300(靶标ZISO),miR396a‐5p和miR47...
对单个细胞反应的分析进一步表明,在WT和TREM2敲除的小胶质细胞中,只有一小部分细胞被SDF-1α激活(图5c),这表明,只有一小部分小胶质细胞对SDF-1α信号有反应,而在TREM2基因敲除的小胶质细胞中,这一比例显著降低(WT中39%响应,KO中11.5%响应)。d.e.对5xMITRG小鼠中人类小胶质细胞的组织学分析证实,与TREM2敲除小胶质细胞(GFP+)相比,T...
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