醇亲王奕譞走后，光绪帝失去了一个依靠，幸好身边还有亦师亦父的翁同龢。翁祖籍江苏常熟，翁家是当地赫赫有名的书香门第，一门四进士，翁同龢与其侄翁曾源还是状元。清朝非常重视皇子的教育，对于挑选师傅要求很严格，除须出自翰林，学问好外，还得是品行端正的人士。翁同龢的父亲翁心存是同治帝师，翁心存去世后，翁同龢接替父职，成为同治帝的老师。
同治帝有多位老师，其中李鸿藻是启蒙老师，与他感情最深；理学大师倭仁教授《尚书》，同治帝最怕上他的课，一是《尚书》非常枯燥，二是倭仁授课过于一板一眼，同治帝背不出书，倭师傅绝不会提醒一个字，只拿眼干瞪着，看皇帝窘态百出；翁师傅虽然来得较迟，却是同治帝最喜欢的老师，因为翁师傅上课深入浅出，让他觉得很有趣。其实，翁同龢课上得好是早有名气，他给两宫太后讲《治平宝鉴》，连折子都看不懂，半文盲的慈安太后都听得津津有味呢。
所以，光绪二年，翁同龢再次成为帝师。第一节课，翁师傅握着光绪帝的小手，教他写：“天下太平，正大光明。”翁同龢的书法相当出色，尤其擅楷书，得益于老师，光绪帝也是一手漂亮的楷体。光绪四年后，光绪帝渐渐懂事，开始变得好学，尤其喜欢上翁师傅的课。而翁同龢没有孩子，师生日日相对，内心里早已把光绪帝，当成儿子般来疼爱。因此，两人感情日益深厚。
逢年过节，光绪帝会写个福字送给老师，这让翁同龢颇感欣慰。有一次，翁同龢老家修墓，请假回乡三个月。翁师傅不在的日子里，光绪帝故态复萌，整天犯倔不肯读书。等到翁同龢重新回到毓庆宫，光绪帝开心极了，对老师说，你知道吗？我有多么想你！这让翁同龢感动得差点掉下泪来。那天上课，光绪帝特别认真，把新书念了一遍又一遍，连太监都说，万岁爷好久没这么大声念过书了！
在翁同龢的教育下，光绪帝读书非常勤奋，每日黎明必到毓庆宫书房。随着光绪帝年龄的增长，除了儒家经典，翁同龢又增设了中外史地、洋务运动等方面的课程。并结合时政，积极引导光绪帝思考现实问题。这让光绪帝受益匪浅，不但促进了政治上的成熟，同时也为维新变法奠定了思想基础。
光绪十二年，光绪帝已是一位风度翩翩的青年，性情宽厚沉毅，举止庄重大方，很有天子的风范。而且他已能批阅奏章，论断古今，剖决是非。连嗜权如命的慈禧也承认，光绪帝完全能胜任皇权。于是，她不得不提出归政，另一方面却又很恶心地颁布了训政细则，继续把持朝政。慈禧的所作所为，犹如一盆冷水浇在光绪帝的头上，多年来努力学习，为的就是早日亲政，然而亲政之路竟是如此的漫长而曲折。失望至极的光绪帝心情十分沮丧，还是翁师傅苦苦相劝，甚至于涕泪，这才让光绪帝又振作起来。
光绪十五年，光绪帝大婚，娶自己并不喜欢的表姐为妻，也无甚开心。然而，大婚即意味着成人，成人即意味着亲政，从此，自己就可以放开手脚大干一场了！这才是让光绪帝真正兴奋无比的重磅喜事。大婚的那天，翁同龢望着坐在太和殿接受群臣朝贺的光绪帝，心情同样澎湃，自己一手培养的孩子，终于要真正地君临天下了！
他们后来才知道，所谓的亲政只是有限的亲政，换汤不换药。这个精力充沛的慈禧老佛爷归政不退养，依然积极发挥着余热，光绪帝仍然没有决定大权。光绪二十年，翁同龢再入军机。因为多年的师生情谊，光绪帝对翁同龢非常倚重，每每遇事，必找老师商量。这既让群臣侧目嫉妒，也引起了慈禧警惕，她怕聚集起对自己不利的帝党势力。
逢甲年不利的慈禧，六十庆典在甲午战争的隆隆炮声中闭门进行。光绪帝和翁同龢都是主战派，然而结果却是惨不忍睹。接着，中日签订马关条约，割地赔款。翁同龢和李鸿藻主张款可赔地不能割，可是，弱国无外交，战败之国哪有讨价还价的权力？
甲午战败和马关条约的触目惊心，让光绪帝发现再不改革，富国强民，自己就要变成亡国之君了！变法成为光绪帝眼前的头等大事。于是，翁同龢为光绪帝引荐了康有为。今天且不谈康有为的主张是否切合实际？是否有操作性？但在当时，他所勾画的美好前景，无疑是深中帝心。好，就这么办吧！1898年6月11日，光绪帝正式颁布《明定国是诏》，实行变法，这份著名的诏书就是由翁同龢亲自执笔拟就。
然而，出乎意料的是，宣布变法的四天后，也就是在翁同龢生日的当天，光绪帝下令撤去翁同龢所有职务，撵出京城，遣回常熟老家。同年十月，光绪帝再下诏，翁同龢革职永不叙用，交地方官严加管束。从此，这位晚清重臣便彻底退出了历史舞台，也永远告别了相伴二十多年的光绪帝。现无从考证这对师生离别时的心情，是不舍？是无奈？是惆怅？还是各种滋味在其中？
《方家园杂咏纪事》中记载，翁同龢因与李鸿章有私怨，担任户部尚书时不肯拨款给北洋水师，以致北洋军舰老化滞后。甲午战败后，以翁同龢为首的清流又群起攻击李鸿章，使得李背负上汉奸之恶名，几乎求生不得，求死不能。光绪帝知道真相后，痛悔当年听信老师甲午主战。因此，等到翁同龢去世，光绪帝连恤典都没给。似乎听起来，翁同龢的革职是光绪帝的本意。比历史更扑朔迷离的，就是人心。然而，就笔者看来，翁同龢的落魄收场，是因为光绪帝的背后，坐着掌握生杀大权的慈禧。
翁同龢回到家乡常熟后，开始了半隐居的庐墓生活。可怜他曾经堂堂朝廷一品大员，竟无多少私产，晚年居然要靠故吏门生接济度日。1904年7月4日，翁同龢满怀抑郁，悲凉辞世。临终前，他口占一绝：“六十年中事，伤心到盖棺。不将两行泪，轻向汝曹弹。”宣统时，翁同龢被追谥为文恭。
谥号是皇帝给高级官员盖棺定论性的称号，历来被士大夫看重。即使溥仪逊位后，还有不少人来讨谥号，想要拥有这份无上的荣誉。谥号以文正为最高等级，也最难得。清朝一共八个文正，其中帝师占了一半，可见清朝对帝师的恩泽优渥。然而，两任帝师的翁同龢，最后却只在宣统朝得了个文恭。此帝师遗恨，折射了光绪帝亲政之悲。
