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短短两个月“灌”了十多篇主刊,这个网站真的无比强大

 微笑如酒 2018-07-09

前些天,笔者已经连续推送了两篇稿件《一个月发表了八篇主刊,这个概念要火了》《继上个月八篇主刊后,这个概念又在同一天发了两篇主刊》。当时写第一篇预测相变(Phase Separation)这个概念要大火之后,笔者还在担心自己的预测是否会出现错误,毕竟一个研究方向是否成为热点不是我一个小小的人物所能预言的,但是当写上一篇稿子讲述6月21日发表的两篇关于相变的主刊时,我已经很有信心相变这个概念在未来肯定是一个热点。果不其然,6月28日,cell杂志再次刊登一篇关于相变的文章。

这篇文章揭示了相变发生的一些基本规律,当目标蛋白序列上富含谷氨酸时,发生相变后它更趋向于形成液滴状,但是当富含谷氨酰胺时,发生相变后更趋向于形成固态状,这为疾病的发生和研究相变过程提供一个可用的规律。


你以为这就完了,相变这个热点可是具有持续生命力的,7月4日,nature杂志上发表文章称:在有丝分裂过程中,激酶DYRK3能够控制无膜细胞器的相变过程。 

在随后的一天,7月5日,science杂志上同样发表了一篇有关相变的文章。

这篇文章讲述的是DNA能够诱导cGAS发生相变从而来活化固有免疫信号。如果熟悉天然抗病毒信号的同学应该都知道,DNA活化cGAS已经是人尽皆知的事情,为什么这种大家都知道的信号通路能再次发表在主刊上呢,主要还是因为它扯上了相变这个概念。

看到这里,不少人估计想问,既然这个概念如此火爆,那研究起来应该比较困难吧。其实大家看看上面三篇文章的作者署名就应该可以看出,每篇文章的作者数目都不多,由此可见,至少在文章的复杂程度上应该比不上一些传统领域的研究。


究竟该怎么做呢?我们先从文章中来找找思路,在这些文章中,很多都存在这个一个预测蛋白是否存在能够发生相变的无序区(IDR)

 

如果蛋白具有这样一段无序区,那就暗示该蛋白能够发生相变转换,这是搭上相变这个概念最关键的一步。怎么预测这段无序区呢?文章中也提到了,应用IUPred这个网站,下面我仔细给大家讲讲如何运用IUPred。


1. 进入IUPred网站,网址为:https://iupred2a./。

 

2. 查询cGAS的蛋白编号或者是蛋白序列,通过uniprot查询到cGAS的蛋白编号为Q8N884。

3. 在图示位置输入Q8N884或者cGAS蛋白序列。

4. 点击Submit,获得以下结果。

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