|
少到什么程度呢？师兄怀疑实验成本没超过10万！ 经常看文献的你，心目中10分的文章应该是什么样子？有些童鞋想都不敢想，是不是觉得10分文章是属于大牛的专属期刊，与我等小民隔了十万八千里，一定程度上没错，10分的文章第一首先得要一个好的idea思路，第二得有那么多钱，第三能做完所有的实验且在毕业前还有1年时间给你投稿！ 想一想都不太可能，不过师兄今天看到了这篇文章，工作量大家绝对想象不到的少。 标题：Parentally inherited long non-coding RNA Cyrano isinvolved in zebrafish neurodevelopment 期刊：Nucleic Acids Research（IF=11.56分） 单位：印度科学与创新研究院 发表时间：2018-07-13 摘要：都知道子代会遗传父母的遗传信息，所以才会有种瓜得瓜，种豆得豆，我们都知道各继承了父母的一套染色体，后来我们还知道除了染色体之外，父母的抽烟肥胖等也能通过表观遗传（DNA甲基化、组蛋白修饰、miRNAs等）去影响下一代的生理状态，而这篇文章告诉我们有些来自父母代的lncRNA Cyrano可独立于子代的同一条lncRNA Cyrano，深刻影响这子代的发育，如果母代的该lncRNA Cyrano被沉默，子代的神经系统发育便会受影响，即便子代会自己产生lncRNA Cyrano。 首先一起了解下Nucleic acids research杂志 今年刚公布的2017年影响因子达到了11.56，NAR是个老牌的杂志，影响力逐年升高，我们以前经常介绍的很多数据库大部分都来自NAR，年文章量为1200余篇。
有的童鞋就在网上问，在NAR上发表数据库算article吗？答案是：肯定算！所以有兴趣的同学可以找一些会生信的小伙伴建个数据库，写篇文章，也能发个10分了。 然后咱们来看看今天这篇文章到底工作量有没有你见过的10分意义上的多。 （1）别人已发表的数据做生信分析 作者用了几个别人家的测序数据，包括睾丸、精子、卵母细胞、2细胞状态的胚胎等细胞测序数据，做生信分析，筛选了几条lncRNA，而其中lncRNA Cyrano在睾丸、卵母细胞以及受精卵中高度保守且高表达状态 （2） 保守性ncRNA筛选并用RT-PCR验证生信分析结果 ncRNA的保守性在遗传发育学中是一个非常重要的理论，作者优先筛选了保守性非常强的一些lncRNA来作为进一步的研究。
另外三个antisense lncRNA的表达情况，并不是父母代都表达
LncRNA Cyrano的测序数据、成熟体以及未成熟转录本在睾丸、卵母细胞、2细胞受精卵中的验证，表明LncRNA Cyrano在父母本遗传细胞中都存在（受精卵中），而子代的Cyrano前体RNA前期是未表达的。
受精卵直到3hpf期（1000个细胞胚胎期）才开始出现自身的LncRNA Cyrano （3） LncRNA Cyrano的细胞和动物功能实验 接下来该怎么做呢？就是体内外的功能实验了，看一看母代的Cyrano高表达和敲减干预后，斑马鱼受精卵的发育情况，这里作者用的是miR-7对Cyrano进行敲减
miR-7对Cyrano进行敲减 敲减了Cyrano，斑马鱼胚胎发育异常 然后呢？就是用Cyrano做挽救实验了，看看能否挽救表型，结果和料想的一样。
（4）母代的LncRNA Cyrano 在3hpf期（1000个细胞胚胎期）之后促进神经系统的发育 作者前期发现受精卵在3hpf期（1000个细胞胚胎期）之后就开始有自己的LncRNA Cyrano了，那母代LncRNA Cyrano在48hpf期被敲减后，胚胎的发育依然受到了严重的干扰。
说明母代的该LncRNA Cyrano在胚胎的神经发育中发挥着重要作用，而且是子代的Cyrano所无法取代的。 不过人家这个发现确实有创新性，这才是最主要的原因，咱们这篇文章学到了什么呢？ ①一个好的科学idea节省上百万经费！ ②二手数据生信分析数据挖掘真有用！ ③除了ceRNA机制，lncRNA可被miRNA靶向降解！ |
|
|
