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基金结果还有1-2周公布,这个明星分子了解一下!

 微笑如酒 2018-08-10

对大家来说,(T)P53应该是最熟悉的明星分子了。明星分子,是大家约定俗成的一个叫法,一个分子是不是明星分子,没有具体的标准。就像明星一样,刘德华是大明星,很多人都知道,那么最新的大明星是谁就见仁见智了,在演艺圈还有所谓的一线、二线说法,对基因来说就没有这么清楚了,不过我们可以通过最新文章上出现的一些词汇看到哪些基因'上镜率'较高,从而了解大体的情况。


有意思的是,Pubmed有个功能叫Trending Articles

这个功能有点像微博热搜,我们可以从中看最新的科研趋势,所以看趋势文章就这样吃饭:

至于有没有用,大家自己体会吧。


当然,需要说明的是,做科研是很严肃的事情,在昨天的投稿文章(为何中药我们只能发1、2分,人家却能发14分?)中,有粉丝严厉指出说在文章最后不应该评论作者长相:

我们觉得他说的很对,只是我想起来一个故事:

老和尚携小和尚游方,途遇一条河;见一女子正想过河,却又不敢过。老和尚便主动背该女子趟过了河,然后放下女子,与小和尚继续赶路。小和尚不禁一路嘀咕:师父怎么了?竟敢背一女子过河?一路走,一路想,最后终于忍不住了,说:师父,你犯戒了? 怎么背了女人? 老和尚叹道:我早已放下,你却还放不下!


好了,我们也鼓励大家认真做科研,评论作者长相的确不对,我们认错。


下面我们大家的科研心态:一种是:“板凳要坐十年冷,文章不写一句空”,对准一个方向死命做,使劲做,即使你是医生,也要拿出大多数的时间来做科研,开什么刀,看什么门诊啊?这样就可以把中科院高校的这批靠做科研吃饭的人的饭碗抢掉了,这样你就是著名科学家了,至于做不做医生,反正科研很多时候是评价的唯一指标,等把职称升上去再慢慢学怎么做医生呗!另一种是:'我要做个好医生,这是我的初心,才不想去抢别人的饭碗呢。可是,我博士毕业要发3分的文章才行,导师又不管,又没有师兄师姐带,就靠自己折腾,选题是瞎选的,经费本来就没多少,超过1000要导师签字,所以实验材料和仪器还要到处借,好不容易买个培训课程还要自己省几个月的生活费攒够才可以,辛辛苦苦学了投个“灌水”杂志,还被大家鄙视的要死,单位也拉黑了,你们能不能给我们留条活路?即使是灌水杂志,对我们这种自己辛辛苦苦做出点东西,想顺利毕业能做医生的人来说,只求能毕业就可以了,总比买文章要好吧!' 。以上两种心态,你的心态是哪种呢?


好了,我们接着Trending Articles说,最近有篇Nature的文章一直在趋势榜前面:Glucose-regulated phosphorylation of TET2 by AMPK reveals a pathway linking diabetes to cancer.Nature. 2018 Jul;559(7715):637-641. doi: 10.1038/s41586-018-0350-5. 

不过朋友圈里面没怎么见大家发,可能最近大家在关注疫苗(疫苗事件似乎大家刷过朋友圈就默认问题解决了,可能这就是大家所说的风头吧,所以有个说法叫“等风头一过,……”)、阿宝、谷歌回归等,今天我们就从这篇文章开始,说一个明星分子——TET2。

这篇文章说的是:葡萄糖——AMPK——TET2可能是联系糖尿病与肿瘤的重要通路,其具体机制是这样的:流行病学研究发现糖尿病患者的肿瘤风险更高,而葡萄糖可能是关键因素,其具体机制是:AMPK作为细胞能量稳态的关键开关,作为激酶(kinase)可诱导TET2蛋白99位ser(丝氨酸)的磷酸化,而TET2有两个角色:一是抑癌基因,二是DNA羟甲基化酶:

TET2被AMPK磷酸化后稳定性升高,从而发挥抑癌功能;而葡萄糖则可以抑制AMPK介导的TET2蛋白磷酸化,用图来展示是这样:

文章全文大家通过doi: 10.1038/s41586-018-0350-5. 直接通过sci-hub.tw下载,我们就不展开讲了,如果大家想听,我们下次单独进行解读。


下面我们延伸开说几个事情:

1. 关于二甲双胍Metformin:

二甲双胍是这几年老药新用的典型之一,在高分文章里面常常出现抑制肿瘤的报道:

作为常用的口服类降糖药,本文的研究也可以用来解释二甲双胍抑制肿瘤的作用机制。


2. 关于明星分子TET2:

DNA的甲基化修饰经典的表观遗传学研究内容之一,而胞嘧啶(C)上的甲基化修饰是一个动态变化的过程,在这个过程中的重要介导因素就是各种甲基化修饰酶,TET2就是导致DNA甲基化进一步变为羟甲基化的一个关键因素,DNA的羟基化和TET2在近期的多篇文章中被报道参与诸多生理和病理过程:

比如8月2号的Hepatolgoy杂志上肝癌中DNA羟甲基化和甲酰化的研究:

8月6号发表在JCI杂志上对TET2与肿瘤化疗抵抗和复发的研究:

我们在震惊!白血病可以提前几年预测风险了!一文中介绍的Nature Medicine文章中TET2基因突变用于AML早期发现的研究:

TET2与CAR-T细胞疗效的研究:

等等,如果大家觉得DNA甲基化“过时”了,可以考虑羟甲基化或者RNA的甲基化修饰。


从基金的角度来说,去年资助的TET2相关的项目也不少:

  • TET2介导的羟甲基化表观修饰参与抑郁行为中神经再生调控

  • TET2基因截短突变在一代EGFR TKIs获得性耐药中的作用及相关机制研究

  • FGFR3/TET2/p-TET2轴异常激活对肝癌生物学特性影响及调控机制

  • TET2调控Foxp3 DNA去甲基化在变应性鼻炎中的作用及机制研究

  • DNA羟化酶TET2在肾移植慢性排斥过程巨噬细胞-肌成纤维细胞转化中的作用研究

  • TET2蛋白N端介导的选择性去甲基化对肠癌Wnt通路的作用及其机制研究

  • SCAP外泌体通过Tet2调控Treg细胞功能介导牙髓再生的分子机制

  • SIRT7 通过去琥珀酰化作用激活TET2在乳腺癌发生发展中作用机制探索

  • hnRNPA2/B1协同Tet2在脆性X相关的震颤/共济失调综合征中异常调控5-羟甲基化胞嘧啶水平引起浦肯野细胞变性的机制

  • TET2介导STAT3低甲基化在苯造血毒性中的作用和机制

  • 低氧相关微小RNA-210/Tet2/IL-6调控轴在子痫前期中的作用及其机制研究


按照往年基金公布时间,大约还有1-2周时间就公布结果了,新的情况我们出来后再看,预祝大家基金中标!

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