《金匮要略》共载方205首，方剂分类包括解表、温里、涌吐、泻下、和解、清热等达18类，涉及内、外、妇、儿多科，临床应用广泛。该书方剂配伍严谨，用药精当，治疗范围广泛，化裁灵活，临床疗效显著。总结其配伍特点概括为以下十个方面：
1、用药精炼，配伍严谨：经方方剂有用药精炼，药味少，结构严谨的特点。如治胃肠实热呕吐的大黄甘草汤，药仅大黄、甘草两味，大黄泻火通腑，甘草甘缓和中，用治胃肠实热的“食已即吐”效果显著；治呕吐的小半夏汤，药仅半夏、生姜两味，半夏蠲饮降逆，生姜散寒止呕，二者协同配合，止吐作用强大，可治“诸呕吐，谷不得下”，为后世公认的“止呕祖方”。又如治百合病的百合地黄汤，由百合、生地汁两味组成，百合甘寒清气分热，地黄汁甘润清血分热，二者相合，润百脉而镇静安神，药味简，药效宏，用治百合病疗效卓著。似此等精炼而严谨的配伍关系，在《金匮要略》一书中比比皆是，随处可见。
2、重视单味药的效用：仲景重视单味药的临床应用，如利用蜘蛛的破结利气作用，治疗阴狐疝气；用柯子的温涩固脱作用，治疗久利气虚下陷，滑脱不固粪便随矢气而排出的气利证；利用乌头的大辛大热，散寒止痛作用，治疗寒疝的绕脐剧痛，肢冷汗出，方如大乌头煎；用一味苦参杀虫除湿热作用治疗狐惑病阴部蚀烂；用蜀漆的祛痰截疟作用治疗疟疾；用百合的养阴清热安神作用治疗百合病；利用黄连清热解毒燥湿作用研粉外治浸淫疮；用鸡矢白治转筋等。将单味药的效能发挥到极致，充分体现出专药治专病之效用。
3、组方选药，既重视单味药的功能，更强调药物的配伍协同：如桂枝一药，有发汗解肌、温通经脉、助阳化气、平冲降逆等功能，配伍应用于不同方剂中，可以从多个方面将其效用发挥得淋漓尽致。如桂枝汤、黄芪桂枝五物汤用桂枝在于调和营卫；炙甘草汤、枳实薤白桂枝汤之用桂枝在于宣通阳气；茯苓甘草汤、五苓散、苓桂甘枣汤、苓桂术甘汤之用桂枝，在于温阳化气行水；桂枝加桂汤、桂苓五味甘草汤之用桂枝，在于平冲降逆；桂枝甘草汤之用桂枝在于温通心阳；小建中汤、黄芪建中汤之用桂枝，在于健运中气等。又如附子有回阳救逆，补阳助火，散寒止痛诸功能，配伍干姜，可增强回阳救逆之力，用于肾阳虚衰，阴寒内盛之证，方如四逆汤；配白术可温散寒湿，治风寒湿痹关节疼痛，如白术附子汤；配薏苡仁可缓急止痛，治疗阴寒凝聚不散的胸痹剧痛及肠痈脓已成而阳气不足者，方如薏苡附子散、薏苡附子败酱散；配乌头可峻逐阴邪而治阴寒痼结的重症心痛，见胸痛彻背、背痛彻心，疼痛急剧而无休止，方如乌头赤石脂丸；配粳米、半夏能温中除湿、降逆止痛止吐，治太阴虚寒，水饮内停，寒饮上逆之胁腹满痛，肠鸣呕吐，方如附子粳米汤；配大黄，可温阳通便，攻下寒积，以治疗寒实结滞的胁下偏痛，大便不通，方如大黄附子汤；配黄土、白术可温脾摄血，而治虚寒下血，方如黄土汤。经过恰当配伍，可使单味药在原有功能基础上发挥更广泛的治疗功能，且能增强疗效，括大治疗范围。
4、寒热并用，敛散协同：仲景遇寒热错杂、虚实错综的病证，常喜寒热并用。如乌梅丸中既用苦寒的黄连、黄柏，又用辛热的干姜、附子、川椒，寒热并用、清上温下，安蛔止痛以治蛔厥腹痛；半夏、生姜、甘草三泻心汤中均用黄芩、黄连之苦寒，又用干姜之辛热，辛开苦降，调理中焦，和中降逆消痞，以治疗寒热错杂、升降失调的诸痞证；又如桂枝芍药知母汤，既用桂枝、附子、生姜诸热药，又用芍药、知母之寒药，寒热并用以祛风除湿，温经散寒，佐以滋阴清热，治疗风湿历节，日久正虚，夹有郁热，而见肢节疼痛，身体瘦弱，头眩短气，下肢肿等证；其它如瓜蒌瞿麦丸、白虎桂枝汤等，均是寒热并用之实例。此外，对外寒内饮之咳喘，善于辛散与酸敛同用，一散一收，适应肺气之宣发与肃降功能，如小龙汤、苓甘五味姜辛汤，均以干姜、细辛之辛散，配合五味子之酸敛，以治疗寒饮咳喘。
5、阴阳协同，攻补兼施，刚柔相济，动静结合：阴阳协同如桂枝汤，用桂枝、生姜、炙甘草、大枣以辛甘化阳，芍药、炙草、大枣以酸甘化阴，诸药配合共奏滋阴和阳、调和营卫之效；升麻鳖甲汤中，既用升麻升散入阳分以解毒散结，又用鳖甲咸寒沉降入阴分以滋阴养血，如此配伍可升而有制，达邪出表，消散疫毒以治阳毒面赤发斑，咽痛唾脓血。又如木防己汤，既用桂枝之温热，又用石膏之辛寒，既用木防己之利水化饮之攻邪，又用人参之补气以扶正，如此寒热并用、攻补兼施相伍，用以治疗饮实正虚之支饮喘满，心下痞坚重证。黄土汤中既用既用白术、附子等刚药以温阳，又配地黄、阿胶之柔药以滋阴，刚柔相济以治疗中焦虚寒，统摄无权之下血证。胶艾汤中用艾叶、川芎、清酒等温动之药以温经行血而止血，阿胶、地黄、芍药、当归等阴药静药以滋阴养血止血，动、静结合以调补冲任，固经止血，用治冲任虚寒，阴血失守的妊娠下血证。
1、用药精炼，配伍严谨：经方方剂有用药精炼，药味少，结构严谨的特点。如治胃肠实热呕吐的大黄甘草汤，药仅大黄、甘草两味，大黄泻火通腑，甘草甘缓和中，用治胃肠实热的“食已即吐”效果显著；治呕吐的小半夏汤，药仅半夏、生姜两味，半夏蠲饮降逆，生姜散寒止呕，二者协同配合，止吐作用强大，可治“诸呕吐，谷不得下”，为后世公认的“止呕祖方”。又如治百合病的百合地黄汤，由百合、生地汁两味组成，百合甘寒清气分热，地黄汁甘润清血分热，二者相合，润百脉而镇静安神，药味简，药效宏，用治百合病疗效卓著。似此等精炼而严谨的配伍关系，在《金匮要略》一书中比比皆是，随处可见。
2、重视单味药的效用：仲景重视单味药的临床应用，如利用蜘蛛的破结利气作用，治疗阴狐疝气；用柯子的温涩固脱作用，治疗久利气虚下陷，滑脱不固粪便随矢气而排出的气利证；利用乌头的大辛大热，散寒止痛作用，治疗寒疝的绕脐剧痛，肢冷汗出，方如大乌头煎；用一味苦参杀虫除湿热作用治疗狐惑病阴部蚀烂；用蜀漆的祛痰截疟作用治疗疟疾；用百合的养阴清热安神作用治疗百合病；利用黄连清热解毒燥湿作用研粉外治浸淫疮；用鸡矢白治转筋等。将单味药的效能发挥到极致，充分体现出专药治专病之效用。
3、组方选药，既重视单味药的功能，更强调药物的配伍协同：如桂枝一药，有发汗解肌、温通经脉、助阳化气、平冲降逆等功能，配伍应用于不同方剂中，可以从多个方面将其效用发挥得淋漓尽致。如桂枝汤、黄芪桂枝五物汤用桂枝在于调和营卫；炙甘草汤、枳实薤白桂枝汤之用桂枝在于宣通阳气；茯苓甘草汤、五苓散、苓桂甘枣汤、苓桂术甘汤之用桂枝，在于温阳化气行水；桂枝加桂汤、桂苓五味甘草汤之用桂枝，在于平冲降逆；桂枝甘草汤之用桂枝在于温通心阳；小建中汤、黄芪建中汤之用桂枝，在于健运中气等。又如附子有回阳救逆，补阳助火，散寒止痛诸功能，配伍干姜，可增强回阳救逆之力，用于肾阳虚衰，阴寒内盛之证，方如四逆汤；配白术可温散寒湿，治风寒湿痹关节疼痛，如白术附子汤；配薏苡仁可缓急止痛，治疗阴寒凝聚不散的胸痹剧痛及肠痈脓已成而阳气不足者，方如薏苡附子散、薏苡附子败酱散；配乌头可峻逐阴邪而治阴寒痼结的重症心痛，见胸痛彻背、背痛彻心，疼痛急剧而无休止，方如乌头赤石脂丸；配粳米、半夏能温中除湿、降逆止痛止吐，治太阴虚寒，水饮内停，寒饮上逆之胁腹满痛，肠鸣呕吐，方如附子粳米汤；配大黄，可温阳通便，攻下寒积，以治疗寒实结滞的胁下偏痛，大便不通，方如大黄附子汤；配黄土、白术可温脾摄血，而治虚寒下血，方如黄土汤。经过恰当配伍，可使单味药在原有功能基础上发挥更广泛的治疗功能，且能增强疗效，括大治疗范围。
4、寒热并用，敛散协同：仲景遇寒热错杂、虚实错综的病证，常喜寒热并用。如乌梅丸中既用苦寒的黄连、黄柏，又用辛热的干姜、附子、川椒，寒热并用、清上温下，安蛔止痛以治蛔厥腹痛；半夏、生姜、甘草三泻心汤中均用黄芩、黄连之苦寒，又用干姜之辛热，辛开苦降，调理中焦，和中降逆消痞，以治疗寒热错杂、升降失调的诸痞证；又如桂枝芍药知母汤，既用桂枝、附子、生姜诸热药，又用芍药、知母之寒药，寒热并用以祛风除湿，温经散寒，佐以滋阴清热，治疗风湿历节，日久正虚，夹有郁热，而见肢节疼痛，身体瘦弱，头眩短气，下肢肿等证；其它如瓜蒌瞿麦丸、白虎桂枝汤等，均是寒热并用之实例。此外，对外寒内饮之咳喘，善于辛散与酸敛同用，一散一收，适应肺气之宣发与肃降功能，如小龙汤、苓甘五味姜辛汤，均以干姜、细辛之辛散，配合五味子之酸敛，以治疗寒饮咳喘。
5、阴阳协同，攻补兼施，刚柔相济，动静结合：阴阳协同如桂枝汤，用桂枝、生姜、炙甘草、大枣以辛甘化阳，芍药、炙草、大枣以酸甘化阴，诸药配合共奏滋阴和阳、调和营卫之效；升麻鳖甲汤中，既用升麻升散入阳分以解毒散结，又用鳖甲咸寒沉降入阴分以滋阴养血，如此配伍可升而有制，达邪出表，消散疫毒以治阳毒面赤发斑，咽痛唾脓血。又如木防己汤，既用桂枝之温热，又用石膏之辛寒，既用木防己之利水化饮之攻邪，又用人参之补气以扶正，如此寒热并用、攻补兼施相伍，用以治疗饮实正虚之支饮喘满，心下痞坚重证。黄土汤中既用既用白术、附子等刚药以温阳，又配地黄、阿胶之柔药以滋阴，刚柔相济以治疗中焦虚寒，统摄无权之下血证。胶艾汤中用艾叶、川芎、清酒等温动之药以温经行血而止血，阿胶、地黄、芍药、当归等阴药静药以滋阴养血止血，动、静结合以调补冲任，固经止血，用治冲任虚寒，阴血失守的妊娠下血证。
