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老板就给了我个基因名,要我上三分

 yjt2004us 2018-09-06
开学了,满心欢喜地等待着开题,但老板就告诉我一个基因的名字,告诉你这是你师兄师姐做剩下的,你就拿这个基因来开题吧。这种问题,我估计你们应该有人会遇到过。


然后呢,你们可能会有点手足无措。可能会这样吧。实际上并不用太担心,其实这并不难解决。我们来听这样一个故事吧,这个人叫Haribalan Perumalsamy,听名字,应该知道,不是中国人,就叫他“小哈”吧。



是的,他是个印度人,但尴尬的是他在韩国的首尔大学,更尴尬的是,他课题是中药……之前还做过什么中药灭蚊的课题,有兴趣的话可以自己去查查看。


这次他老板给了他一个分子——香豆素,让他自己去玩去。小哈估计也是一脸茫然的,但是其实这并不难。实际上,作为你也一样,对于这样一个仅有的线索(某个基因也好,某个药物也好),就是需要往下继续深挖,找出更多的线索来。


小哈基本上也是个老鸟了,他先分析了一下能和香豆素互作的蛋白。没错,其实我也教过你们(不知道的点)。



就是用这类网页小工具就能实现的,小哈用这个分析了一下凋亡通路上的蛋白,发现的确香豆素能和BCL2结合,然后就是一系列的和凋亡相关的表型了,比如,加药后的生长抑制:



加药后的凋亡(实际上我觉得吧,加点盐其实也能差不多这样):



机制部分,就是加药后,之前预测的蛋白产生了变化



最后他画了个圆谎般的总结图



额,就是加了香豆素后,结合BCL2然后产生抑制(奇怪的是结合上BCL2蛋白后,BCL2的蛋白都不表达了,那它结合的是什么?),于是导致了凋亡。大概就是这么个逻辑,编辑心里也没点B数,反正看得我是挺汗的,但小哈还是出色地完成了他老板给他的任务。



这篇蚊帐发表在Phytomedicine上,IF=3.610,(记住这本杂志,说不定就用上了)印度队稳稳上分……


那你们呢?我给了你们很多个工具了(不知道的就回复“神奇工具在哪里”,当然进不去别怪我)。



你们能找到那个基因和别的任何机制的联系了么?当然,找到了就要开始准备慢慢得分了吧。好了,今天就先策到这里吧,祝你们心明眼亮

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