circRNA的三个主流研究方向，你属于哪个？

说到circRNA估计小伙伴们并不陌生吧。自2014年起，circRNA犹如一颗冉冉升起的星星，备受到科研工作者的青睐，现已到了炙手可热的地步，成为非编码RNA界的研究新宠。细数近几年来circRNA在国家自然科学基金获批项目情况，可以说是平步青云，一飞冲天。纵观circRNA 研究领域的大军，大概可以分成3大主流。

（a）circRNA 作为miRNA sponge；

（b）circRNA与蛋白结合；

（c）circRNA翻译成蛋白；

下面我们一起来学习下这3大主流和相应的研究思路吧。

数据来自：国自然科学基金管理信息系统

第一类是以miRNA sponge为代表的，circRNA与miRNA 的相互作用是目前报道得最多的circRNA的功能模型，从近几年国自然中circRNA的获批中可以看出，获批的大多项目也是往miRNA sponge方向研究的，而最早提出miRNA sponge功能模型的是Max Delbruck柏林医学系统生物学研究所的RajewskyNikolaus教授。

Rajewsky Nikolaus教授

此主流的研究套路大概如下：

1. 通过高通量测序或芯片结合qpcr验证筛选出感兴趣的circRNA；

2. 针对筛选出来的circRNA进行细胞功能验证；

3. 通过数据库预测或RIP实验筛选出与circRNA相互作用的miRNA，并进行下游靶基因检测等该机制进行研究；

4. 构建动物模型进行体内验证。

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第二类以蛋白结合（protein binding）为代表，即是circRNA与蛋白结合（常见于RNA结合蛋白RBP，不过也有其它类型蛋白），加拿大多伦多大学的Burton B Yang教授是此研究方向的佼佼者。

代表文章1：A Circular RNA Binds To and Activates AKT Phosphorylation and Nuclear Localization Reducing Apoptosis and Enhancing Cardiac Repair.Theranostics 2017 ;7(16)

代表文章2：The Circular RNA Interacts with STAT3, Increasing Its Nuclear Translocation and Wound Repair by Modulating Dnmt3a and miR-17 Function.Mol. Ther. 2017 Sep 06 ;25(9)

代表文章3：A circular RNA promotes tumorigenesis by inducing c-myc nuclear translocation. Cell Death Differ. 2017 09 ;24(9)

此主流的研究套路大概如下：

1. 通过高通量测序或芯片结合qpcr验证筛选出感兴趣的circRNA；

2. 针对筛选出来的circRNA进行细胞功能验证；

3. 通过RIP或计算机模拟实验筛选出与circRNA相互作用的蛋白，并研究两者的调控关系或下游机制；

4. 进行体内验证。

第三类是以circRNA翻译有功能性蛋白为代表的，目前关于此类的研究比较新颖，报道的文章还不是很多，国际上关于circRNA翻译的paper共有5篇，其中两篇是中山大学附属第一医院神经外科张弩副教授发表的。

此主流的研究套路大概如下：

1. 通过高通量测序或芯片结合qpcr、northernblot等验证挖掘出感兴趣的circRNA，并采用pcr 、Sanger测序等技术对目标circRNA进行识别鉴定；

2. 构建circRNA系列表达载体及制备特异性检测circRNA翻译蛋白的抗体并且结合质谱检测手段，证明circRNA翻译蛋白质；

3. circRNA翻译蛋白质进行细胞功能验证；

4. circRNA翻译蛋白质的分子机制；

5. 构建动物模型、临床标本的检测进行体内验证。

案例文章1：

Circ-ZNF609 Is a Circular RNA that Can Be Translated and Functions in Myogenesis.Mol Cell. 2017 Apr 6; 66(1): 22–37.e9.

案例文章2：

Novel Role of FBXW7 Circular RNA in Repressing Glioma Tumorigenesis.J. Natl. Cancer Inst. 2018 Mar 01 ;110(3)