|
1.定义 基因多态性，实际上最常见的是指单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphism，简称SNP，被称为“第二代DNA遗传标记"），是由单个核苷酸A,T,C或G的改变而引起的DNA序列的改变，包括碱基转换、颠换和碱基的插入、缺失四种形式，造成包括人类在内的物种之间染色体基因组的多样性。作为基因多态性研究中的第三代遗传标志物，SNP相比于第一代 RFLP (限制性片段长度多态性标记)和第二代简单重复序列(包括小卫星DNA多态性或VNTR的多态性和微卫星的DNA多态性等多种)有以下几个优点： （1）SNP在基因组中分布广泛，密度大，更有代表性；（2）虽然理论上讲，3个或4个等位型的 SNP 也是可能发生的，但实际上这两种情况非常少见，人群中大部分的SNP都是二等位。在检测时，SNPs可以直接利用序列的差异作为标记，而不再是以长度的差异作为检测手段。因此应用SNPs检测不仅方便，有利于自动化技术筛选，而且更利于基因分型；（3）群体中SNP的遗传稳定性较好，使群体的遗传分析简单易行；（4）某些 SNP，如位于编码区的 SNP 或非同义SNP，因其本身就是影响基因表达或蛋白质合成的基因位点，故该 SNP 自身可能就是疾病遗传机制的候选改变位点。 2. 基因多态性为什么要进行Meta分析？ 单个遗传关联研究存在着三点不足：（1）样本量不足，难以发现基因与疾病之间的关联性，说服力低；（2）不同人种间由于异质性的关系，导致结果不同，难以统一分析；（3）群体分层影响结果。对于很多遗传疾病来说，很多致病基因或易感基因起的作用并不十分明显，为保持较高的检验效能就必须要增大样本量。事实上，正是由于遗传疾病的这种特性，大多数的单个关联研究难以满足大样本量的要求。另外，由于人类复杂疾病中普遍存在的遗传异质性，不同种族人群来源的研究，遗传分析的结果也必然会存在差异，加之存在人群分层现象，因此此类研究常常存在所报道的结果互相矛盾，可重复性差，即使同样都是阳性结果的报道，也会出现风险等位基因不同的情况。 Meta分析恰好可以有效地解决这些问题。通过综合所有可利用的同一疾病与同一基因同一位点的关联分析数据，达到了增大了样本量，提到检验效能的功能。同时，在此基础上，还可根据不同种族进行分层研究，进一步解决了人群异质性的问题。另外，对所纳入分析的研究进行的系统评价更可以让我们对目前研究中存在的问题有更清晰的认识，还可以帮助我们找出影响关联的各种因素。据统计，每年有超过6000篇基因流行病学的原始文献公开发表。总之，它不仅能够对前人的研究做一个全面的总结，更可以为日后的研究工作找到出路。 欢迎关注公众微信号：实用Meta分析（meta-show） QQ讨论群：422021477 |
|
|
