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2018年，全球肠道领域的研究又取得了突飞猛进的进展。我们通过“热心肠日报”又解读了2800多篇高水平的肠道研究论文。 这其中，影响因子超过15分的就有接近700篇，来自Cell、Nature、Science的文章有近150篇，来自JAMA、NEJM、Lancet的文章有近100篇。 这绝对是肠道科学研究的大丰收！ 我们向所有取得突破的科学家表示祝贺，并坚信在2019年我们依然能够看到肠道科学领域的持续高产。 广告：我们特别欢迎你在2019年莅临中国肠道大会，共庆肠道科学的巨大成就，共谋中国肠道产业的发展大计： 今天，我们特别发出四个榜单，分别介绍2018中国肠道研究十大成果、全球肠道研究十大人物、最受关注的50篇肠道综述和100篇肠道论文。 我们充分利用了“热心肠日报”的后台数据，对2800多篇文章进行了多维度的加权评分，在充分考虑杂志影响力、阅读数、转发和讨论数等客观数据的基础上，也请热心肠日报的主编和几位编辑进行了充分讨论，并最终形成了榜单。 本榜单仅代表热心肠生物技术研究院基于自身数据所做的优选，存在主观因素影响客观性的可能，仅供参考。欢迎你在文末留言提出批评、建议和意见。 本篇发布“全球肠道研究十大人物”。 01 Ramnik J. Xavier Broad Institute of Massachusetts Institute of Technology (MIT) and Harvard University，USA 入选理由：2018全球最高产，CNS主子刊高水平文章达到两位数。 2018代表性文章 C1orf106 is a colitis risk gene that regulates stability of epithelial adherens junctions Science：C1orf106变异增加IBD风险的机制 02-01, Report, 10.1126/science.aan0814 The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study Nature：早发1型糖尿病的早期菌群特征 10-24, Letter, 10.1038/s41586-018-0620-2 T Helper Cell Cytokines Modulate Intestinal Stem Cell Renewal and Differentiation Cell：与T细胞间的亲密互作，调节肠道干细胞的更新和分化 11-01, Article, 10.1016/j.cell.2018.10.008 特别提示：上述文章英文标题带链接，点击可直达热心肠日报的解读页面，下述文章不再出现本提醒。 02 Curtis Huttenhower Harvard T.H. Chan School of Public Health，USA 入选理由：2018第二高产，被热心肠日报收录高水平文章达到9篇。 2018代表性文章 The human gut microbiome in early-onset type 1 diabetes from the TEDDY study Nature：早发1型糖尿病的早期菌群特征 10-24, Letter, 10.1038/s41586-018-0620-2 Species-level functional profiling of metagenomes and metatranscriptomes Nature 子刊：HUMAnN2实现宏基因组和宏转录组种水平功能组成分析 10-30, Article, 10.1038/s41592-018-0176-y Gut microbiome structure and metabolic activity in inflammatory bowel disease Nature子刊：炎症性肠病中肠道微生物组的结构和代谢活性 12-10, Article, 10.1038/s41564-018-0306-4 03 Peer Bork European Molecular Biology Laboratory, Germany 入选理由：过去几年持续高产，关于非抗生素药物可能杀菌的研究轰动全球。 2018代表性文章 The Human Gut Microbiome: From Association to Modulation Cell：从相关性研究到靶向调节菌群（综述） 03-08, Review, 10.1016/j.cell.2018.02.044 Extensive impact of non-antibiotic drugs on human gut bacteria Nature: 非抗生素药物同样影响肠道细菌 03-19, Article, 10.1038/nature25979 Structure and function of the global topsoil microbiome Nature：土壤菌群特点或影响全球物质循环 08-01, Article, 10.1038/s41586-018-0386-6 04 Eran Elinav & Eran Segal Weizmann Institute of Science，Israel 入选理由：以色列魏茨曼研究所的两位Eran，我们实在难以将他们分开，他们配合得太默契。2018年，除了让全世界益生菌行业惊出一身冷汗，菌群热点充分涉及，牛！ 2018代表性文章 Environment dominates over host genetics in shaping human gut microbiota Nature：对菌群的影响，环境大于宿主基因！ 02-28, Article, 10.1038/nature25973 Cell：抗生素治疗后，益生菌干预不利于菌群复原 09-06, Article, 10.1016/j.cell.2018.08.047 Cell：未来趋势——个性化益生菌干预 09-06, Article, 10.1016/j.cell.2018.08.041 05 Rob Knight University of California San Diego，USA 入选理由：不知Rob Knight，不是专业搞菌群的！2018年，继续为整个肠道研究领域开辟新方法，开发新软件。 2018代表性文章 Best practices for analysing microbiomes Nature子刊: 一文读懂：Rob Knight手把手指导菌群研究（必读综述） 05-23, Review, 10.1038/s41579-018-0029-9 Qiita: rapid, web-enabled microbiome meta-analysis Nature子刊：菌群分析新手的可用工具 10-01, Article, 10.1038/s41592-018-0141-9 Striped UniFrac: enabling microbiome analysis at unprecedented scale Nature子刊: Rob Knight发布条形UniFrac算法轻松分析微生物组大数据 10-30, Other, 10.1038/s41592-018-0187-8 06 Justin L. Sonnenburg Stanford University，USA 入选理由：2018年，他和妻子写的《让身体和微生物成为朋友》在中国热销，他们整的科学研究也被中国专业人士津津乐道。 2018代表性文章 Microbiota-accessible carbohydrates suppress Clostridium difficile infection in a murine model Nature子刊：高纤维饮食或能治疗艰难梭菌感染 04-23, Letter, 10.1038/s41564-018-0150-6 An exclusive metabolic niche enables strain engraftment in the gut microbiota Nature：改造菌株+配套营养支持=可精细调控的菌株定殖 05-09, Letter, 10.1038/s41586-018-0092-4 Transient Osmotic Perturbation Causes Long-Term Alteration to the Gut Microbiota Cell：短期渗透性腹泻可引起菌群的长期改变 06-14, Article, 10.1016/j.cell.2018.05.008 07 Stanley L. Hazen Cleveland Clinic，USA 入选理由：肠道菌群与心血管领域研究的开创者，继续引领这方面的研究。 2018代表性文章 Microbial modulation of cardiovascular disease Nature子刊：菌群在心血管疾病中的作用（综述） 01-08, Review, 10.1038/nrmicro.2017.149 Development of a gut microbe–targeted nonlethal therapeutic to inhibit thrombosis potential Nature子刊：肠道菌群靶向药，有望防治心血管疾病 08-06, Article, 10.1038/s41591-018-0128-1 European Heart Journal：天天吃红肉，菌群产物TMAO飙升 12-10, Article, 10.1093/eurheartj/ehy799 08
Fredrik Bäckhed University of Gothenburg，Sweden 入选理由：瑞典大牛继续在肠道菌群与免疫、代谢等的细胞和分子机制上驰骋。 2018代表性文章 Cell子刊：低碳水饮食迅速改变菌群改善脂肪肝 02-07, Article, 10.1016/j.cmet.2018.01.005 Neonatal selection by Toll-like receptor 5 influences long-term gut microbiota composition Nature：幼年期先天免疫对菌群塑造的长期影响 08-08, Letter, 10.1038/s41586-018-0395-5 Microbially Produced Imidazole Propionate Impairs Insulin Signaling through mTORC1 Cell：与糖尿病相关的菌群代谢物，损伤胰岛素信号 10-25, Article, 10.1016/j.cell.2018.09.055 09
Cynthia L. Sears Johns Hopkins University，USA 入选理由：专注挖掘促进大肠癌的细菌和毒素，2018收获满满。 2018代表性文章 Cell子刊：脆弱拟杆菌毒素如何促进结肠肿瘤发生 02-01, Article, 10.1016/j.chom.2018.01.007 Patients with familial adenomatous polyposis harbor colonic biofilms containing tumorigenic bacteria Science：在家族性息肉病人肠道里，有两种细菌促癌！ 02-02, Report, 10.1126/science.aah3648 Mucosal Immunology：非产毒脆弱拟杆菌抑制小鼠的结肠炎及结肠肿瘤发生 10-02, Article, 10.1038/s41385-018-0085-5 10
赵立平 上海交通大学，中国 入选理由：带领团队20年磨一剑，代表中国学者取得绝对的国际影响力。 2018代表性文章 Gut bacteria selectively promoted by dietary fibers alleviate type 2 diabetes Science: 赵立平+彭永德+张晨虹等：膳食纤维治疗2型糖尿病，多亏关键肠道菌 03-09, Article, 10.1126/science.aao5774 mBio：仝小林+赵立平等：中药复方富集有益肠道菌，改善2型糖尿病合并高血脂症 05-22, Article, 10.1128/mBio.02392-17 Causality in dietary interventions-building a case for gut microbiota Genome Medicine: 赵立平等：如何解析肠道菌群在饮食与健康中的作用 08-01, Comment, 10.1186/s13073-018-0573-y （本榜单结束） |
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