|
2018年12月10日，来自澳大利亚的Richard B. Lock研究团队，在Cancer Cell杂志发表了Lymphocyte-Specific Chromatin Accessibility Pre-determines Glucocorticoid Resistance in Acute Lymphoblastic Leukemia的文章，整合了DNase-seq，ChIP-seq，ATAC-Seq以及甲基化测序技术，从表观遗传的角度，阐述了ALL对于糖皮质激素耐药的的可能原因。  原文出处：https:///10.1016/j.ccell.2018.11.002 另外一篇同期刊发在Cancer Cell的文章Enhancer Architecture and Essential Core Regulatory Circuitry of Chronic Lymphocytic Leukemia，也通过整合CRISPR-screening 以及ChIP-seq，ATAC-Seq等多组学手段，找到了对于CLL（慢性淋巴细胞白血病，Chronic lymphoblastic leukemia , ALL）细胞增殖至关重要的转录因子PAX5，同时证明了BET bromodomain的抑制可以破坏CLL core regulatory circuitry从而发挥较强的抗肿瘤活性。  原文出处：https:///10.1016/j.ccell.2018.11.001 Cell Rep |研究发现环境应激引起抑郁行为表观新机制 2018年12月11日，国际权威杂志Cell Reports上发表的题为“Ten-eleven translocation proteins modulate the response to environmental stress in mice”的文章，揭示了外界环境刺激引起抑郁发生的表观遗传学新机制。该研究由苏州大学徐兴顺教授课题组和美国Emory大学金鹏教授课题组的研究人员合作完成。 该合作研究发现：外界环境刺激造成小鼠出现抑郁样行为以及前额叶皮层出现DNA 5hmC修饰的显着下降。进一步研究发现，Tet1基因敲除小鼠对外界刺激存在抵抗，不容易产生抑郁样行为，而Tet2基因敲除小鼠，即使不予外界刺激也表现出明显抑郁样症状。Tet1和Tet2催化的同一个DNA5hmC修饰反应，但Tet1/2基因敲除小鼠却表现出相反的行为表现；提示不同Tet酶介导的DNA 5hmC修饰参与小鼠抑郁样行为但存在不同的机制。  原文出处： https:///10.1016/j.celrep.2018.11.061 CELL DEATH DIS |甲基化敏感的Sp1介导ZNF132表观遗传沉默促进食管鳞状细胞癌进展 2018年12月18日，Cell Death & Disease杂志发表题为“Epigenetic silencing of ZNF132 mediated by methylation-sensitive Sp1 binding promotes cancer progression in esophageal squamous cell carcinoma”的文章。肿瘤抑制基因的表观遗传改变是人食管鳞状细胞癌（ESCC）中最重要的指标之一。在本研究中，作者通过综合计算分析鉴定了一种新的ESCC高甲基化生物标志物ZNF132，用于全面的全基因组DNA甲基化微阵列数据集。通过甲基化目标亚硫酸氢盐测序（MTBS）检测了91例中国汉族ESCC患者和邻近正常组织中ZNF132的高甲基化状态。同时，在固体组织和癌细胞系中证实了由高甲基化介导的ZNF132基因沉默。此外，他们发现体外过表达ZNF132在ESCC细胞中可显着降低细胞在裸鼠模型中生长，迁移和侵袭以及细胞致瘤性的能力。他们用染色质免疫沉淀试验验证了ZNF132启动子区域中的Sp1结合位点，并证明高甲基化状态可以降低Sp1转录因子活性。研究结果表明，ZNF132在ESCC作为肿瘤抑制基因的发展中起重要作用，并支持由DNA高甲基化介导的Sp1结合衰变和基因沉默引起的潜在机制。  原文出处：https://www./articles/s41419-018-1236-z   中科普瑞，旗下拥有上海鲸舟医学检验实验室有限公司和上海鲸舟基因科技有限公司，立足新一代测序及其衍生技术，以医学生物信息学为核心，提供覆盖肿瘤等重大疾病风险评估，早期筛查，分子病理诊断，肿瘤精准用药指导和预后预测等符合临床需求的解决方案，为精准医疗打造全方位服务平台。公司的中长期发展策略为医学大数据挖掘和人工智能的临床应用。
公司是十万人甲基化组计划（表观星图计划）项目实施方，拥有专业的多组学技术服务团队，成熟的团队和技术平台提供基因组、转录组、表观基因组、代谢组等多组学的实验分析和生信分析，以及多维度因果关联分析，为广大医学和生物学研究人员提供专业的一站式服务。 |
|
|
