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没花一分钱,他发了15分的文章!

 yjt2004us 2019-01-30

大家好,我是大家的新朋友Diucidong!今天的推文要给大家说一个人,讲一个故事,介绍一个数据库。

小伙伴们赶紧搬小板凳过来占位。

   

要说的这个人呢,其实医学方的粉丝应该都知道,他就是大家的老朋友,Leopard老师。

很多医学方的粉丝都听过Leopard老师讲R语言,Diucidong也是其中之一。Leopard老师是我R语言学习道路上的领路人,让我一步一步感受到R的魅力,同时呢,我也在学习的过程中,跟Leopard老师成了很好的朋友。我跟他都在复旦读博士,因为工作方向类似,所以日常交流比较多。

前段时间,大概是在1812月初,具体日子记不清了,Leopard一脸神(huai)秘(xiao)的跑来跟我说,“嘿,跟你说件事。”我以为他又是有啥新奇的想法了。

没等我开口问,他就忍不住说,“我刚刚发表了一篇文章”。

发文章有什么稀奇的?我不耐烦的说道,在我心里,这家伙就是论文制造机,“简直高产如母猪”啊!

“15分!

还没等我反应过来,他又强调了一遍,“影响因子15.04!”

“花擦!厉害了!”

听完我的夸赞,他一脸傲娇的走开了,剩下我在寒风中凌乱和发抖,都是读博的,差距咋就那么大呢?咱发的文章影响因子还不及人家一个零头……哎,日子难过呀!


故事就这么长。事实证明,Leopard所言非虚,没过多久,他的文章就online了,截个图给大家看看。

各位朋友也可以去PubMed下载。

这篇文章发表在国际肝病学顶尖期刊Journal of hepatology上,2018年的IF15.04,隶属欧洲肝病研究协会,能在这个杂志上发文,也着实是不容易啊。

我感叹之际,顺便瞄了一眼文章的标题和主要内容,除了文中的插图依旧让我震撼之外,文章的内容也是让我觉得很新奇。

新奇点主要来自于他使用的数据,全部来自于一个叫做GBD的公共数据库。也就是说,Leopard发这篇文章,没花一分钱!

“用别人的数据,发自己的文章”,“只要锄头挥的好,没有数据挖不到”。Leopard的“口头禅”又在我耳边回响。

这一波操作,确实666 啊!

关于这个GBD数据库,我之前也有耳闻,全称叫做global burden of disease(全球疾病负担)。Leopard硕士专业是流行病学,主要方向是肿瘤流行病学,最近开始转向分子和遗传方向。这么一想,就对了,这正是对了他的胃口啊。

我迫不及待的想看看这个数据库到底有何神通。我首先去PubMed上搜索了利用这个数据库发表的文章。不搜不知道,一搜吓一跳啊。不说了不说了,截个图给大家看看吧。

几乎全是大文章啊!再细看的话,柳叶刀,新英格兰,JAMA上都有这个数据库的身影,具体文章我就不列了,太多了,你们自己去搜吧,要啥有啥。

敢情Leopard发的Journal of hepatology也只算是毛毛雨啊。我的心里总算得到了一丝丝的安慰(原谅我这博士同行的自尊心)。

我的好奇心完全被勾起来了,我必须要看看这个数据库到底是何方神圣。

数据库倒是很好找,直接Google全称就可以了,为了避免大家走这一步,我直接把数据库的数据获取链接贴出来了(http://ghdx./gbd-2017)。

如你所见,现在这个数据库已经更新到2017版本了,而Leopard发文章用的还是2016的版本。上图中红色圈圈标识的就是数据库的数据获取界面的链接,大家直接点击即可。如下图所示:

不得不说,这真是我见过的最简单最亲民最直接的数据库。所有做公共卫生或者做疾病负担的同学都应该去看看这个数据库。

数据的检索十分方便:

Context下拉菜单中可以选择不同的选项,默认是cause,即病因(可以理解为导致疾病负担的原因,比如肝癌)。

Measure中可以选择不同的疾病评价指标,比如发病率incidence,死亡率death等,也有疾病负担的指标,比如DALY

Location中展示的是全球所有的国家和地区,做了非常详尽的分类,比如中国(国家水平),东亚(地区水平)等,而对于一些国家,比如美国和英国,甚至有国家内部的州或者省的水平的数据(很遗憾,中国是没有省级别的数据的)。

AgeSex可以选择年龄和性别。

Year选择年份,起止范围是1990-2017.Cause中详细的列出了各种常见的病因,比如肿瘤,高血压,糖尿病等。

有兴趣的读者可以自己去探索。

最难能可贵的是,GBD的工作人员将所有的数据向全球用户开放,不需要注册,不需要缴费,你想要什么数据,只需要在上述的搜索框中选好之后,点击Search进行搜索,或者直接点击Download CSV进行下载。

不说了不说了,今天的推文就这么多了,我要去捣鼓我刚刚下载的数据了。

大家忘了Leopard,记住GBD


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