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Nat. Commun. | GAPDH的丙二酰化修饰是巨噬细胞的炎症信号

 生物_医药_科研 2019-01-31

蛋白质翻译后修饰对蛋白质的功能有着重要作用。丙二酰修饰是最近新发现的、进化保守的一种修饰。该修饰以丙二酰-CoA为底物,发生在赖氨酸残基上,通过破坏静电相互作用(由+1变为-1)而调节蛋白结构与功能,但对于该修饰在生理功能上的研究依旧较少。研究发现,免疫细胞在执行其功能时,代谢过程会发生改变,巨噬细胞就是其中的一种。

 

作者选择骨髓来源巨噬细胞(SMDMs)进行研究。研究发现,在脂多糖(LPS)诱导24h后,丙二酰-CoA的含量显著上升。通过使用抗赖氨酸丙二酰修饰抗体(anti-mal-K),作者发现在全蛋白质水平上,赖氨酸丙二酰修饰明显上升。

作者通过使用抗体富集、HPLC-MS/MS方法,对LPS处理前后赖氨酸丙二酰化修饰蛋白进行质谱定性鉴定和定量分析。其中GAPDH引起了作者的注意。作者发现,在LPS处理过程中,GAPDH的含量没有发生显著变化,但是其中的赖氨酸丙二酰化修饰水平上升,并且通过质谱实验,发现K213在LPS诱导下,由原本的乙酰化修饰变为丙二酰化修饰,并且该位点与GAPDH的活性中心和RNA结合区域较近。

 

作者发现,LPS诱导后,GAPDH的催化活性显著上升,从而糖酵解过程得以增强,IL-1β含量提高。若将K213为突变为乙酰化修饰模拟的谷氨酰胺残基Q(K213Q),GAPDH活性没有明显变化,若将其突变为丙二酰化修饰模拟的谷氨酸残基E(K213E),则催化活性显著升高。

 

除了催化活性外,作者该检测GAPDH中RNA结合能力的改变。TNFα是GAPDH的结合RNA。作者通过使用抗体富集GAPDH,并使用qRT-PCR检测其结合的TNFα RNA含量的变化。作者发现,在LPS诱导后,GAPDH结合的TNFα含量显著降低,并且同时细胞中TNFα表达量增强。若使用HEK293T细胞,使用K213Q和K213E突变体检测GAPDH对TNFα结合能力的变化,作者发现,K213E结合能力显著较低。

 

因此作者结合上述结果和文献报告,提出了一种新的GAPDH丙二酰化修饰介导的巨噬细胞免疫调节机理:在LPS诱导下,巨噬细胞中,GAPDH K213位被丙二酰化修饰,催化活性提高,从而增强了糖酵解过程,增加IL-1β含量,同时,与TNFα mRNA结合能力减弱,TNFα表达量得以提高,从而两个过程共同促进了炎症的发生。

 

本文作者:YS

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