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灰度分析不会做?image J帮你一次搞定!

 yjt2004us 2019-01-31

关于用Image J量化westernblot条带灰度值,很多小伙伴们一直不确定到底怎么做才是正确的测量灰度方法,今天我们一起学习下。


Image J软件:Windows 版本软件安装

1. 下载地址:

http://rsb.info./ij/download.html

2. 下载windows 32位带Java版本,双击软件安装。


一、灰度分析步骤

1、下图为样板图片:


2、 导入图片:File> Open> Sample1.jpg


图片导入后,Sample1.jpg在新的窗口中打开


3、图片类型设置:Image> Type> 8 bit


4、去除图片背景:Process> Subtract Background> …


Subtract Background 窗口:Rolling ball radius 设为50 pixels,勾选light background,可选preview,点击“OK”确定。


5、 工具栏:选择“矩形选框”


6、最大化“Sample1.jpg”窗口,便于矩形选择,矩形选择第一个泳道。

7、 标记“矩形选框”为1:矩形选择后,调整矩形至合适大小,按下数字键“1”,或者Analyze> Gels> Select Fist Lane。


8、选择“泳道2”:拖动“1”的矩形框,会出现两个矩形选框,拖动矩形框至泳道2,调整位置,并按下数字键“2”,Image J 会自动调整大小使“矩形框2”与“矩形框1”保持同一水平。


 9、 继续拖动,会出项新的“矩形选框”,调增至泳道3,并按下数字键“2”(注意:是按下数字键“2”),重复9至6个泳道全部选择。



10、 所有泳道选择后,按下数字键“3”,出现分析图谱。


11、“直线”封闭峰:工具栏选择“直线”,从起峰处至落峰处。


12、 计算峰值:工具栏> Wand(tracing) tool,点下刚才封闭的区域,峰值结果出现在新的窗口中。


计算结果:


13、其他泳道的操作方式,以此类推。

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