大家好,今天到后面几天介绍lncRNA与甲基化的研究策略,这是第三季的最后一个主题了。 在前面的内容里,我们从lncRNA的角度介绍过: 蛋白泛素化修饰导致的蛋白降解, 蛋白翻译能力的上升导致的蛋白高表达, 蛋白的磷酸化修饰导致的蛋白活性改变, 蛋白由于定位改变导致功能的改变; 还介绍过lncRNA和circRNA通过影响mRNA的稳定性调控基因表达, 也介绍过转录因子对mRNA产生的影响; 介绍完蛋白和RNA,终于到甲基化了。当然,甲基化也可以发生在DNA、RNA、蛋白等多种分子水平,即使是一个水平的甲基化修饰,要说清楚也是很难的。 我们先看下甲基化有关的基金:
胞嘧啶核苷酸的甲基化修饰 在梦熊前面写的文章 “(文章篇)S3E13:lncRNA参与基因调控的DNA去甲基化的作用”中,lncRNATARID就是通过对抑癌基因TCF21(DNA)启动子区域的CpG岛进行去甲基化修饰,然后上调TCF21的表达最终发挥作用的(回复313看文章)。 我们再看下与甲基化和lncRNA有关的基金:
最后我们看几篇非编码RNA与甲基化的文章: 1. H19 lncRNA alters DNA methylation genome wide by regulating S-adenosylhomocysteine hydrolase.Nat Commun. 2015 Dec 21;S腺苷甲硫氨酸(SAM)是甲基化修饰过程中的甲基供体,SAM在提供甲基后被转换成S腺苷同型半胱氨酸(SAH),而SAH可以抑制SAM依赖的转甲基作用。SAHH是SAH的水解酶,因此SAHH的激活能够促进SAM依赖的甲基化修饰。而lncRNA H19可以结合SAHH酶,并抑制其功能,从而阻断了由DNA甲基转移酶DNMT3B介导的广谱甲基化修饰,最终调控基因表达。 2. Regulation of laryngeal squamous cell cancer progression by the lncRNA H19/miR-148a-3p/DNMT1 axis.Oncotarget. 2016 Mar 8 lncRNA H19抑制miR-148a-3p表达,而miR-148a-3p则抑制DNA甲基转移酶DNMT1的表达,从而影响基因的甲基化水平和表达,促进喉癌的病程进展。 3. Small RNA-mediated DNA (cytosine 5) methyltransferase 1 inhibition leads to aberrant DNA methylation. Nucleic Acids Res. 2015 Jul 13 miR-155-5p等microRNA可以结合并抑制DNMT1的活性,从而改变DNA的甲基化程度,最终改变基因表达。 好了,文章的案例先到这里,我们后面几期的文章将从DNA的甲基化、组蛋白的甲基化等方面阐述lncRNA在甲基化过程中的作用,敬请期待。 下期文章预告: Long non coding RNA CCAL regulates colorectal cancer progression by activating Wnt/β-catenin signallingpathway via suppression of activator protein 2α.Gut. 2015 May 20. 全文下载链接:http://pan.baidu.com/s/1nvPDqop 密码: t7iv That’s all. Thank you!
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