打开后看着很牛B,但是会让你摸不着头脑。首先,如果点进去选择组织的样本的话,会直接给你跳出来全部的12334个TCGA的样本,这个是供你慢慢筛选的。 根据你研究的肿瘤,自己来选,不要挑很多,大概100个样本,都已经是要拖垮电脑了。 筛选完样本,直接勾选上后,就会出现一层右边栏(只要再选择,就又是一个右边栏),这就是这些样本的全部数据了: 这样的数据吧,看着尴尬,因为并不是统计学的对比结果,所以看着也只能干瞪眼。 因为出来的这些基因,都是没有经过筛选的,只是这些样本中的基因表达数据的罗列。所以要进行下一步,对于每个基因在组织样本或者细胞样本中的表达,进行柱状图的分析…… 但实际上,这个TCGA神器,正确的功能,应该是来作为TCGA的共表达分析,这就需要从“基因”这个按钮,进入到里面,选择两个或两个以上的基因,然后来分析在不同的样本或者细胞系中的共表达情况: 对与基因在TCGA的样本中的共表达,还需要在中间添加筛选需要分析的TCGA样本,具体什么肿瘤,什么器官等等: 然后,就能分析在这些TCGA样本中的这几个基因的共表达情况了。 是不是觉得这个工具没啥卵用呢?确实,最多拿来夏季把分析一下共表达、拷贝数、突变什么的。而且选择样本后,筛选基因,筛选出基因后,再选择样本中的共表达情况……层层叠叠会打开好多窗口,每打开一个,就又会出现一个右边栏让你继续选择……算了,说不定凑合会有用呢?想要这个工具的话,就回复“公克”(不要在评论区回复),去夏老师星球上看吧,祝你们心明眼亮。 |
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