新个人所得税法有九项所得需要缴纳个人所得税：工资、薪金所得，劳务报酬所得，稿酬所得，特许权使用费所得，经营所得，利息、股息、红利所得，财产租赁所得，财产转让所得，偶然所得。其中前四项叫综合所得。新个人所得税法对个人取得的综合所得实行按年计算，平时由支付单位预扣预缴，年度汇算清缴，多退少补。居民个人综合所得年度汇算清缴应当注意以下九个事项：
虽然个人取得的综合所得实行按年计算，但并非所有个人取得的综合所得均应当办理年度汇算清缴手续。居民个人取得综合所得有四种情形应当依法办理汇算清缴：一是从两处以上取得综合所得，且综合所得年收入额减除专项扣除后的余额超过6万元。二是取得劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得中一项或者多项所得，且综合所得年收入额减除专项扣除后的余额超过6万元。三是纳税年度内预缴税额低于应纳税额。居民个人取得的工资薪金所得、劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，只要在平时预缴个人所得税低于年度应缴纳的个人所得税的，均应当办理年度汇算清缴。四是纳税人申请退税。居民个人平时预缴个人所得税，如果多预缴了个人所得税，纳税人要求退税的，则应当办理年度汇算清缴。比如个人发生大病医疗支出，因为该项专项附加扣除应当在汇算清缴时扣除，平时在发生工资、薪金时不能扣除，就必然导致纳税人多缴个人所得税。如果纳税人要求申请退税，则应当办理年度汇算清缴后，再办理退税。
综合所得年度应纳个人所得税=（综合所得-专项扣除-6万元-专项附加扣除-依法确定的其他扣除）*税率-年度速算扣除数。综合所得=工资薪金所得+（劳务报酬所得+特许权使用费）*80%+稿酬所得*80%*70%。当年要补缴或者退税额=年度应纳个税-年中综合所得已申报预缴的税款。其中：专项扣除是指按照规定缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险、公积金。专项附加扣除：子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或者住房租金、赡养老人等支出。依法确定的其他扣除：企业年金、职业年金，个人购买符合国家规定的商业健康保险、税收递延型商业养老保险等支出。另外，在一个纳税年度内不论个人实际工作是否为12个月，均应当按照6万元扣除基本减除费用。纳税人在按年计算综合所得的情况下，纳税人无论是否取得工资薪金所得，都需要维持基本的生计费用，因此不宜因为其某个月未任职未取得工资薪金所得而中断其扣除基本减除费用。
个人取得的综合所得汇算清缴应当以纳税人个人为申报主体，但《个人所得税法实施条例》第二十九条规定：“纳税人可以委托扣缴义务人或者其他单位和个人办理汇算清缴。”由于汇算清缴是一项专业性较强的工作，一般来说，如果由扣缴义务人，也就是单位的财务人员办理，会大大增加财务人员的工作量和压力，而且单位的财务人员也没有义务为每个员工承担相应的纳税风险，因此，将这一块工作委托给专业的中介机构更为现实一些。但不论是个人进行汇算清缴，还是委托其他单位、个人或扣缴单位代为汇算清缴，均须纳税人个人签字确认，以明确法律责任。汇算清缴的具体办法将由国务院税务主管部门制定。
《个人所得税法》第十一条规定，居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。比如2019年度居民个人取得综合所得，需办理汇算清缴的，应在2020年3月1日至6月30日内办理。这也是新个人所得税法实施后首个汇算清缴办理期间。
需要办理汇算清缴的纳税人，应当向任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报，并报送《个人所得税年度自行纳税申报表》。纳税人有两处以上任职、受雇单位的，选择向其中一处任职、受雇单位所在地主管税务机关办理纳税申报；纳税人没有任职、受雇单位的，向户籍所在地或经常居住地主管税务机关办理纳税申报。但如果预缴个人所得税与汇算清缴地不一致的，在涉及退税的情况下，应当是由预缴地主管税务机关退税，还是由汇算清缴地负责退税？《个人所得税法实施条例》第二十五条规定：纳税人申请退税，应当提供其在中国境内开设的银行账户，并在汇算清缴地就地办理税款退库。
《国家税务总局关于发布<个人所得税专项附加扣除操作办法（试行）>的公告》（国家税务总局公告2018年第60号）第十条规定，纳税人选择在汇算清缴申报时享受专项附加扣除的，应当填写并向汇缴地主管税务机关报送《扣除信息表》。纳税人可以通过远程办税端、电子或者纸质报表等方式，向扣缴义务人或者主管税务机关报送个人专项附加扣除信息。第二十一条规定，纳税人选择年度终了后办理汇算清缴申报时享受专项附加扣除的，既可以通过远程办税端报送专项附加扣除信息，也可以将电子或者纸质《扣除信息表》（一式两份）报送给汇缴地主管税务机关。报送电子《扣除信息表》的，主管税务机关受理打印，交由纳税人签字后，一份由纳税人留存备查，一份由税务机关留存；报送纸质《扣除信息表》的，纳税人签字确认、主管税务机关受理签章后，一份退还纳税人留存备查，一份由税务机关留存。第二十三条规定，纳税人应当将《扣除信息表》及相关留存备查。自法定汇算清缴期结束后保存五年。
需要汇算清缴的个人当年综合所得无论最终计算出来的结果是补税、退税，还是不补不退，均需要办理汇算清缴。依照《税收征收管理法》规定：未按照规定办理纳税申报，造成少缴税款会被追缴税款、滞纳金，还可能被处以0.5倍至5倍税款的罚款。《个人所得税法实施条例》附加扣除相关的资料。税务机关可以对纳税人提供的专项附加扣除信息进行抽查，具体办法由国务院税务主管部门另行规定。税务机关发现纳税人提供虚假信息的，应当责令改正并通知扣缴义务人；情节严重的，有关部门应当依法予以处理，纳入信用信息系统并实施联合惩戒。《国家税务总局关于发布<个人所得税专项附加扣除操作办法（试行）>的公告》（国家税务总局公告2018年第60号）第二十九条规定，纳税人有下列情形之一的，主管税务机关应当责令其改正；情形严重的，应当纳入有关信用信息系统，并按照国家有关规定实施联合惩戒；涉及违反税收征管法等法律法规的，税务机关依法进行处理：（一）报送虚假专项附加扣除信息；（二）重复享受专项附加扣除；（三）超范围或标准享受专项附加扣除；（四）拒不提供留存备查资料；（五）税务总局规定的其他情形。
《个人所得税法》第十一条规定：“居民个人取得综合所得，按年计算个人所得税；有扣缴义务人的，由扣缴义务人按月或者按次预扣预缴税款；需要办理汇算清缴的，应当在取得所得的次年三月一日至六月三十日内办理汇算清缴。”《税收征收管理法》第五十一条规定，纳税人超过应纳税额缴纳的税款，税务机关发现后应当立即退还；纳税人自结算缴纳税款之日起3年内发现的，可以向税务机关要求退还多缴的税款并加算银行同期存款利息，税务机关查实后应当立即退还；涉及从国库中退库的，依照法律、行政法规有关国库管理的规定退还。《税收征管法实施细则》第七十八条第二项规定，《税收征管法》第五十一条规定的加算银行同期存款利息的多缴税款退税，不包括依法预缴税款形成的结算退税、出口退税和各种减免退税。可见，新个人所得税法对个人取得的综合所得实行按年计算，分月或分次预扣预缴，年度汇算清缴时，对纳税人依法多预缴的个人所得税，在向税务机关要求退还多缴的税款时不可加算银行同期存款利息。
在个人所得税汇算清缴期正常补税不存在补缴个人所得税。但补缴平时应扣未扣或少扣的个人所得税是否加收滞纳金？《税收征收管理法》第六十九条规定：扣缴义务人应扣未扣税款的，由税务机关向纳税人追缴税款，对扣缴义务人处应扣未扣税款百分之五十以上三倍以下的罚款。注意：这里写的是追缴税款，而不是追缴税款及滞纳金，也没有在追缴税款后面紧接着写上并从滞纳之日起按日加收万分之五的滞纳金。并且《国家税务总局关于行政机关应扣未扣个人所得税问题的批复》（国税函〔2004〕1199号）明确规定，扣缴义务人应扣未扣税款，无论适用修订前还是修订后的《征管法》，均不得向纳税人或扣缴义务人加收滞纳金。
