今天是生信星球陪你的第306天
大神一句话,菜鸟跑半年。我不是大神,但我可以缩短你走弯路的半年~ 就像歌儿唱的那样,如果你不知道该往哪儿走,就留在这学点生信好不好~ 这里有豆豆和花花的学习历程,从新手到进阶,生信路上有你有我! 1.找不到某个函数x <- str_c('doudou',1:3) Error in str_c('doudou', 1:3) : could not find function 'str_c'
解决方案,先?str_c 看帮助文档,看这个函数属于哪个包,然后安装这个包。有时一个问号不行,需要两个问号,再找不到,就要去百度搜索啦。 > ?str_c No documentation for ‘str_c’ in specified packages and libraries: you could try ‘??str_c’ > ??str_c
箭头所指就是包名。
2.不存在某个包library(GSVA) Error in library(GSVA) : 不存在叫‘GSVA’这个名字的程辑包
两个原因: (1)拼写错误,多使用tab键补齐,就可以避免这个错误。 (2)没有安装成功:R包安装时如果出现error(报错),那就是失败了。需要重新安装一遍,如果还是不行,就看它报错是不存在哪个包,就重新安装哪个包。这种情况是依赖关系没有解决好,跟个人电脑有一定的关系,要知道怎么解决:不存在谁,就安装谁。 3.怎么安装install.packages('stringr') BiocManager::install('GEOquery')
需要知道R包来源在哪里。CRAN的包用install.packages,biocductor的包用BiocManager::install()。不知道的话百度搜索,会找到一个这个包的介绍界面,非常详细,会告诉你如何安装。 比如:
http://www./packages/release/bioc/html/GEOquery.html 网络问题不要问我哦。
还有搜到很多中文教程哦。天下无难事。
|