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Ion Torrent测序仪是第一个不需要光学系统的商业测序仪，所采用的技术为半导体测序，通过半导体芯片直接将化学信号转换为数字信号。是非常适合扩增子测序的革命性技术。它是一种经济、快速、简单、规模可扩展的测序技术。因为测序时间短，仪器设备便宜等特点而被各种研究所采用。 1. IonTorrent前史今生 Ion Torrent最初属于美国Ion Torrent公司，由Jonathan Rothberg于2007创办(一个传奇人物，99年创建454，07年卖给Roche)。2010年Life Technologies收购了Ion Torrent, 此时Ion Torrent已经开始名声大噪，2013年Life Tech又被Thermo fisher收购。所以呢，现在是Thermo家的测序宝。 2. IonTorrent半导体测序原理 自然情况下，DNA聚合酶将一个核苷酸渗入到DNA分子中就会释放出一个H+，导致局部可检验的PH值发生变化。如果发生结合，就会释放H+,相应的溶液PH值会发生改变，被离子传感器检测到，从而转换为数字信号。 如果检测DNA链上有两个相同的碱基，检测到的电压双倍，芯片则记录两个相同的碱基。 如果模板到的下个核苷酸与微芯片流的核苷酸不匹配，则检测不到电压，也不会记录碱基。 3.仪器平台 1）Ion PGM 2010年发布,目前有三款芯片，芯片不断改进，通量不断提高 2）Ion Proton 2012年发布，一天可以测完人类基因组，试剂消耗$1000/run，错误率1.2% 有两种芯片, PI芯片适用于外显子组和转录组测序，PII芯片适用于人类全基因组测序。PII芯片目前还在研究中，并未上市。 3)用于靶向测序的Ion S5和Ion S5 XL新一代测序系统 2015年9月1日，thermofisher发布了新产品S5系列Ion S5/ the S5 XL，是Proton和PGM相续合而产生的产品，相比较于Proton, PGM.新系列更加容易操作,<15分钟就可以安装测序程序，从DNA到得到数据，只需要24h. 采用的芯片包括三种：
S5 XL和S5使用相同的芯片，但具有更大的计算能力和服务器承载更快地数据分析，可以分析更多的样品/天。 |
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