有了这几个神器，从此idea和机制就不用愁了!（预测糖基化位点）

以昨天的第三篇文章为例，在文章中作者使用质谱的方法鉴定出了stat3的可能糖基化位点，随后通过验证发现OGT诱导stat3的T717位点发生糖基化。这种找位点的方式比较传统，耗时费力，随着生物信息学的发展，当然是由网站可以预测糖基化发生位点的，下面为大家讲解一下这些好用的网站。

1. YinOYang 1.2 Server

进入该网站，网址是http://www.cbs./services/YinOYang/.

在主页可以看到该网站相当简洁，这也便于大家使用，在搜索栏中输入目的蛋白序列，我在这里输入stat3的蛋白序列（注意是FASTA格式）。

在threshold栏中，可以修改阈值，这里我选择0.5，点击submit后，可以看到以下界面。

在这里，网站首先显示该预测蛋白的完整序列，随后会出现一些可能被糖基化的位点，图中用“G”标注的，为了更加清楚的显示结果，在网页的下方，会出现具体位点的分值和对于的展示图。

点击Graphics in postScript可以直接下载图片的矢量图，可直接用于文章中。

2. GPP

进入GPP网站，网址为http://comp.chem./glyco/。

在网站首页，选择WEB services下方的GlycoPred，随后按照提示点击Calculation。

点击进入后，在搜索栏中输入stat3的蛋白序列（FASTA格式），随后在下方输入自己的邮箱地址，预测后的结果会通过邮件的形式发送给你。

糖基化修饰主要分为两种类型，分别为O-连接的糖基化和N-连接的糖基化，前者主要发生在ser和thr，后者主要发生在Asn氨基酸上。上面两个网站主要预测O-连接的糖基化，下面给大家介绍一下预测N-连接的糖基化的网站。

3. NetNGlyc 1.0 Server

进入该网站，网址为http://www.cbs./services/NetNGlyc/.

该网站和YinOYang 1.2 Server比较类似，进入首页后，在搜索栏输入蛋白序列。

点击submit，获得预测结果，其中糖基化修饰主要发生在Asn（N）氨基酸上，“+”表示可能发生糖基化的位点，“-”表示该位点不能发生糖基化。

4.GlycoMine

网址为http://glycomine.erc./Lab/GlycoMine/。

进入该网站，在搜索栏中输入stat3的蛋白序列，在类型type栏中可以看到，该网站提供三种糖基化修饰方式，分别为W-linked，O-linked和N-linked，在这里选择N-linked。

点击submit后，获得预测结果（这一步需要耐心等待较长时间）。在结果中，按照糖基化修饰的可能性从高到低依次排列。

通过这四个糖基化预测网站就可以轻松找到你想研究蛋白的可能糖基化位点，之后再通过实验证明OGT通过预测位点来调控目的蛋白的功能，就能轻松的规划整个课题。