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RNA-seq原始数据读值counts怎么转化为RPKM或者TPM的，其背后的原理今天以自己理解做的笔记与大家分享一下(Source:StatQuest)，如理解有偏差，请留言指出，接受批评指正。 RPKM=Reads Per Kilobase Million TPM=Transcripts Per Million RPKM标准化流程：先深度后长度标准化 TPM标准化流程：先长度后深度标准化 RPKM与TPM的比较 适用性形式
RPKM与RFPKM的差别：RPKM是单端测序（single）得到的原始reads标准化转化而来的，FPKM是两端测序（paired）测序得到的原始reads标注准化转化而来。 |
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