经村委会批准建的厂房，后被认定为违法建筑怎么办？

这个问题，个人认为，应该视情况区别来看。

第一，村委会无权批准建设厂房。

村委会按照有关规定，可以为集体组织内的成员分配宅基地，但是宅基地只能用于建设农民自用住宅，不能建设企业、厂房等。如果你建厂房的土地，性质是宅基地，持有的是宅基证，那么你建厂房从一开始就是不符合规定的，村委会的批准也是无效的，属于违建无疑。

第二，如果你建设的土地是村集体所有的建设用地。

村集体通过出让、承包等方式把使用权转让给你，你是可以建设厂房的。但是，建设之前也要经过乡镇国土、建委部门的审批同意，才有资格进行建设。否则也是违法建筑。

第三，如果你建设厂房是村委会为了发展经济、招商引资，有相应的承诺或者协议。那么在认定违建拆除后，可以依据协议向村委会申请赔偿。