你不知道的FlowJo软件的专业分析功能

OK，如果你没有安装Flowjo 10.0以上就不要往下面看了。

1.先来个最常用的，我们做Histogram的时候，如果你收集的细胞数量不一样，你叠加在一起就会高高低低，所以若果放在以前你必须要让你靶细胞的细胞收集数量差不多才会整齐，现在不用，你可以使用高级功能中的DownSample进行处理，从而使各个靶细胞群细胞数量一致。

2. 强大的补偿矩阵计算能力，三五个颜色我们可以两两调节补偿慢慢调节，但是如果20个颜色，怎么办？Flowjo可以根据单染管自动计算，这不是最厉害的，我们知道Facs DIVA7.0也可以做到，但是Flowjo会根据颜色深浅自动标注补偿大小，你可以重点关注某些值，另外在补偿矩阵下方会自动显示两两参数之间的补偿图。嗯，不过如果不是27寸显示器没什么鬼用哈，亲身经历，看得头晕。

3.上面这个可能并不能惊艳到你，但是对于多参数数据的降维计算，真的很厉害！

对于多参数的流式两两之间的关系分析是非常头疼的，尤其对于非标记分子的功能分群分析，降维计算我觉得可以想象成对于多维空间的数据不断按照某个维度不断压缩最终形成二维图像的过程。至于有什么用，https://flowjo./medias/5fq9khd425官方链接。下面是一个分析实例，我们可以看到随着处理因素时间变化细胞群的变化，可以结合我们手动圈门进一步确认该亚群的性质。

4. 聚类分析，和Heatmap，也可以像我们做RNA-seq一样，进行聚类以及热图分析，操作都非常简单。

总的来说，我们可以看到在大数据的背景下Flowjo做的努力，我真心觉得都是超级实用的功能。现在Flowjo已经是BD旗下的产品，希望以后越来越BD，再傻一点，再少点手工分析，多些批量处理，哈哈哈。