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零基础发5分 生信SCI,科研小白靠什么逆袭?

 那抹柔暖的阳光 2019-08-16
作者:VINCENT
编辑:小怡
本文为小狗科研平台原创,转载请在【后台】留言

如果你不会编程,又想发生信文章,或者想在自己课题中加入部分生信内容,让文章尽可能的高分,那么这篇影响因子大于5的生信文章值得学习和借鉴,因为它的产生完全是利用在线数据库!

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结果一:肺癌患者中E2Fs的转录水平

Figure1直观地显示了各个基因在各种癌中的表达水平,红色代表高表达,蓝色代表低表达。这张图直接来源于公开数据库ONCOMINE。

登陆ONCOMINE,网址:https://www./resource/login.html(需复制到浏览器打开)

记得用教育邮箱注册并登陆,然后在左上角search框里面输入E2F1:


点击搜索按钮:


发现这就是figure1里的一部分!figure1就是用这个方法拼接得到的。
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结果二:肺癌患者中E2Fs的转录水平

结果二有3个图,如下:

Figure2 The expression of E2Fs in LC (GEPIA).

Figure3 Correlation between E2Fs expression and tumor stage in LC patients(GEPIA).

Figure4 The expression of E2Fs in LC (IHC).

我们先看figure2。该图是通过GEPIA数据库(http://gepia./)实现的。
在搜索框中输入E2F1


确认后拉下来,可以发现figure2A的一部分就在图中。


Figure2B也类似。


该图与Figure3不一致,原因为我选用的数据库不同。再看生存曲线图

Figure5 The prognostic value of mRNA level of E2F factors in LC patients(Kaplan-Meier plotter).

这部分是通过Kaplan-MeierPlotter的肺癌数据(http:///analysis/index.php?p=service&cancer=lung)实现的。
进入网站后,在搜索框输入“E2F1”,在Probeset options选择:“JetSet”,再点击左下方的DrawKaplan-Meier Plotter。

文章的图基本来源于在线数据库的使用,只要你会用数据库,就能重复出来。至于发高分生信文章,那就需要专业的指导了!

强烈推荐这门《生物信息学基础入门(含相关数据库及软件的应》给大家,帮助你系统地学习生物信息分析技能,零基础发高分SCI。

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