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几个在线网站帮你解决文章着急发表却数据不够的困扰

 花开半夏ypsy9f 2020-04-04
实验数据的丰富程度是你能不能发文章的关键,我明明很努力了,可我的文章为什么还这么单薄呢?
那是因为有些资源你还没有利用起来,合理利用这些资源能够让你的文章今天跟大家总结一下文章中,那些可以直接为你“产图”的网站吧。

1、Oncomine

网址:
https://www./resource/login.html
应该是现在最方便的肿瘤数据挖掘平台了,用学校邮箱注册以后,按照自己的研究方向一顿选择,就能产出一堆图出来,关键还能直接放到文章里。
举例:

这是一篇4分多文章的第一个Figure,来自oncomine。

参考文献:

Hu, M., et al. 'Serum TNFRII: A promisingbiomarker for predicting the risk of subcentimetre lungadenocarcinoma.' Journal of cellular and molecular medicine (2020).
我们前面也推出过用word和excel获取oncomine数据的教程,详情可戳:Word+Excel教你轻松批量获取Oncomine数据

2、GEPIA

网址:
http://gepia./

这是个神奇的网站,不论是基因表达还是肿瘤预后,直接把你想要研究的Pia进去,就能够出图了,可以直接用在文章里,分数还不低的那种。

举例:下面这张图来自oncogene,老牌一区期刊。

参考文献:

Wang, T., Jing, B., Xu, D. et al. PTGES/PGE2 signalinglinks immunosuppression and lung metastasis in Gprc5a-knockoutmouse model. Oncogene (2020). https:///10.1038/s41388-020-1207-6
GEPIA的教程很多老朋友应该很熟悉了,详情可戳:GEPIA:点点鼠标就能分析TCGA数据GEPIA 2.0:看看都有什么新东西吧!

3、KaplanMeier Plotter

网址:
https:///analysis/index.php?p=service&start=1

这个网站也是基于TCGA数据库,主要做生存分析,局限在于能够分析的肿瘤不是很多。

举例:参考文献同样是来自上面一篇文章。

我们之前在介绍网页版生存分析工具时,介绍过 KaplanMeier Plotter,详情可戳最全生存分析网页版工具,你掌握了几种?

4、The Human Protein Atlas

网址:
https://www./

这个杂志同样是检测细胞、组织中的表达,独特之处在于他有很多高清的组化图片,当你没有组化数据时候,可以直接在里面找,而且也可以通过这个网站挖掘新的课题思路。

举例:这幅图来自一个影响因子5分多的杂志Oncogenesis。

上图中的a图的组化就是来自这个网站,b图来自oncomine,c图来自TCGA。三张图凑成了文章最后一个Figure。

参考文献:

Peng W X , Wan Y Y ,Gong A H , et al. Egr-1 regulates irradiation-induced autophagy through Atg4Bto promote radioresistance in hepatocellular carcinoma cells[J]. Oncogenesis,2017, 6(1):e292.

5、UALCAN

网址:
http://ualcan.path./index.html
基于TCGA数据库的在线软件,功能强大,可以链接到其他数据库,就是图的质量不高,但是也可以直接用,另外他会给出数据,可以重新作图。
举例:这幅图来自一个影响因子8.0的杂志。

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