最近看到一篇6.2分的生信文章,看起来挺简单的。所以带着大家重复一下文章中的图,也顺便学习一下各种工具的使用。 文章名:A pan-cancer analysis of the oncogenic role of staphylococcalnuclease domain-containing protein 1 (SND1) in human tumors 本文的Figure 1是介绍SND1这个基因的表达情况 Figure 1a 通过TIMER2数据库,展示SND1在TCGA数据库中的表达。 TIMER2数据库的网址是:http://timer./ 打开后点击箭头所指位置 输入SND1 点击下载pdf就可以得到Figure 1a了 Figure 1b 对于TCGA数据库中没有正常组织的肿瘤类型,使用TCGA与GTEx数据库联合进行分析,该图是使用在线数据库GEPIA2所作 GEPIA2:http://gepia2./#index 打开网址点击箭头的位置 点击Box plot 按照箭头选择好 出图 大家可以一个一个选,就可以得到作者的图了。 突然间有事,今天就这么多吧,下会继续。 公众号专题
单基因泛癌分析套路 -----------------------------分割线------------------------------- |
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